FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0300.ptfa, 1352 aa vs ./tmplib.26680 library 1767665 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2364+/-0.00814; mu= -12.0117+/- 0.536 mean_var=404.2309+/-97.487, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0638 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4048 ( 1363 res) mbg06182 (1363) 411 53 4.1e-07 mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694) 270 40 0.0039 >>mKIAA4048 ( 1363 res) mbg06182 (1363 aa) initn: 573 init1: 288 opt: 411 Z-score: 220.1 bits: 53.1 E(): 4.1e-07 Smith-Waterman score: 750; 26.829% identity (32.432% ungapped) in 984 aa overlap (422-1348:479-1349) 400 410 420 430 440 mKIAA0 KRLNSKSKASPEAPVASPAKGGRTDHRKSLPSPQAAHKMLSKAVSHRL---------HIA :.::.....:..::.. . : mKIAA4 SPVHCLTLNEVYTILSHCDPGPVPIIVSRHPDPQVSEQQLKEAVAQAVEGVKFGKDRHQW 450 460 470 480 490 500 450 460 470 480 490 mKIAA0 DQEEPKNTAGDTSKPPQCVPE----SKPPLA-ASGSLRTSASDTSIRTIT---SPLTS-- . : : .. : : : :: :. . :.::.: . . :: .. mKIAA4 SLEGVKRLESSWHGRPTLEKEREKHSAPPHRRAQKIMVRSSSDSSYMSGSPGGSPCSAGA 510 520 530 540 550 560 500 510 520 530 540 550 mKIAA0 -PKPLPEQGANNRFHMAVYLESDTSCPAT-SRPPRYGPEGKVPHANSGSVSPSASRTNIA :.: ..:... .. :.. ::.. ::: . .: .:.. : mKIAA4 EPQPSEREGSTHSPSLSPGEEQEP-CPGVPSRPQQESPP--LPESLERESHPP------- 570 580 590 600 610 560 570 580 590 600 mKIAA0 LAGVRQSKQFTHSRVDLVLTEAAQPQGISEKGTEKMASDPLERTNQL-KIIEISSERMPK .: .:.: .. . ...:. .: : :.: .. .. :. . :.. .: mKIAA4 ---LRLKKSF---EILVRKPTSSKPKPPPRKYF-KNDSEPQKKLEEKEKVTDPSGHTLP- 620 630 640 650 660 670 610 620 630 640 650 660 mKIAA0 NACGDKPPGSDRKGGFLTQSNCQEKSSVRLRQSAESSPKQPHFPPSQASQGEQEMRWSYS .:... :. : :: .. : .: : : . .:. : : : mKIAA4 -TCSQET----RE---LLPLLLQEDTAGRAPCTAACCPG-PAASTQTSSSTEGESR---- 680 690 700 710 670 680 690 700 710 720 mKIAA0 MARLASSSPSAPQLPSKMPDYSQGKSSQMPASVGVPKNGVPVGLAGEEPPYFTPRPATRT :.:: .: :.: : . ....: : . . : .. :.: . mKIAA4 ----RSASPETPASPGKHPLLK--RQARMDYSFDITAEDPWVRISDCIKNLFSPIMSENH 720 730 740 750 760 770 730 740 750 760 770 780 mKIAA0 YSMPAQFSSHFGREGLSPPSPSHSPQDPQVTAMSGSLS-EKSAKGVTNEQGV-YSVKPL- : : .. .:.: . : . . .. : .:. ::: : : ..: . :: mKIAA4 SHTPLQPNTSLGEEDGTQGCPEGGLS--KMDAANGAPRVYKSADGSTVKKGPPVAPKPAW 780 790 800 810 820 790 800 810 820 830 840 mKIAA0 ----LETLRNPPPVDVGDVSAVPE-ASGLIPDKLKVTRRHYYCEQSWPHESTSFFSVKQR :. ::: : : :: ::.. : :.: . :. ..: :..:: mKIAA4 FRQSLKGLRNRAP----DPRRPPEVASAIQPTP--VSR-----DPPGPQPQASS-SIRQR 830 840 850 860 870 850 860 870 880 890 mKIAA0 IKSFENLANS---DRPAAKSATSPFLSVSSKPPVNR---RSSGSITSGRPSDGTARSLR- :.::::...: :: . . . .: . ..: : .. : :: . .: . :. . mKIAA4 ISSFENFGSSQLPDRGVQRLSLQPSSGETTKFPGKQDGGRFSGLLGQGATVTAKHRQTEV 880 890 900 910 920 930 900 910 920 930 940 950 mKIAA0 RSLSSCSENQSEASSLLPQMTKSPSSVTLTVSRQNPPETNNKGHSPDPKKSLVPVGIPIS .:.:. :.::. . : . .:: : : ..:. :::: : .. mKIAA4 ESMSTTFPNSSEVRD--PGLPESPPP------GQRP---STKALSPDPLLRL------LT 940 950 960 970 980 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA0 TGSPASPIKRNKSSVRHAQPSPVSRSKLQELRALSMPDLDKLCSGEDYSASPGAVLFRTQ : : . : ..:. :..:.. : . :. .:: : :.. ....... mKIAA4 TQSEDTQGPGLKMPSQRARSFPLTRTQSCETKLLD-EKASKLYS---ISSQLSSAVMKSL 990 1000 1010 1020 1030 1020 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA0 LEITPRRSQGSPATSPASSPARGHADVNGSAFLSCPVNGGNRVYPKGNSSPTVPTGSREW : . :.: .:: : :: :: : .. mKIAA4 LCL------------PSS--------------VSC---GQITCIPKERVSPKSPCNNSSA 1040 1050 1060 1080 1090 1100 1110 mKIAA0 GESL-RAMPSGKSWSVNLDQL------LASVGY--------QQRLQAVLSLVGSKSPILP .:.. .:: : ..:.::..: :. : .: :.:.::. : . mKIAA4 AEGFGEAMASDTGFSLNLSELREYSEGLTEPGETEDRNHCSSQAGQSVISLL-SAEELEK 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1120 1130 1140 1150 1160 1170 mKIAA0 LIQEAKAQSENK----EDICFIVLNKKEGSGLGFSVAGGADVEPESVLVHRVFSQGVASQ ::.:... .: ..: .:.:.::.:::::.:::::.: . . ::::: .:.::: mKIAA4 LIEEVRVLDEATLKQLDSIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGADLENKVITVHRVFPNGLASQ 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1180 1190 1200 1210 1220 1230 mKIAA0 EGTVSQGDFLLSVNGTSLAGLSHSEVTKVLHQAELHKHVLMIIKKGNDQPRPSFRQEPPS :::...:. .::.:: :: : .:... .:.::. ...... .. . . .. . : mKIAA4 EGTIQKGNEVLSINGKSLKGATHNDALAILRQARDPRQAVIVTRRTTVEATHDLNSSTDS 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1240 1250 1260 1270 1280 1290 mKIAA0 ANGKAPFPRRTLPLEPGAGRNGAAHDALC-VEVLKTSAGLGLSLDGGKSSIAGDGPLVIK : . . . .: . . ..: : . :::::::.::.:::.:. :: ::.:. mKIAA4 AASASA--ASDISVE-------SKEATVCTVTLEKTSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTIN 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 mKIAA0 RVYQGGAAEQAGTIEAGDEILAINGKPLVGLVHFDAWNIMKSVPEGPVQLVIRKHRDS :...: .::. .. ::::: . : . ::..:.:::..:..:.::: .:::. mKIAA4 RIFKG--TEQGEMVQPGDEILQLAGTAVQGLTRFEAWNVIKALPDGPVTIVIRRTSLQCK 1300 1310 1320 1330 1340 1350 mKIAA4 QTTASADS 1360 >>mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694 aa) initn: 215 init1: 139 opt: 270 Z-score: 148.7 bits: 40.2 E(): 0.0039 Smith-Waterman score: 298; 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