FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4141.ptfa, 1593 aa vs ./tmplib.26680 library 1767424 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4211+/-0.00503; mu= 14.9194+/- 0.334 mean_var=136.4910+/-31.612, 0's: 0 Z-trim: 43 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1098 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0813 ( 1557 res) mbg05377 (1557) 7298 1169 0 mKIAA0230 ( 1431 res) mbg10262 (1431) 413 79 9.6e-15 mKIAA1465 ( 785 res) mfj00439 ( 785) 377 73 3.5e-13 mKIAA1910 ( 760 res) mbg21737 ( 760) 369 71 8.3e-13 mKIAA0814 ( 116 res) mpk00279 ( 116) 354 68 1.4e-12 mKIAA1781 ( 1140 res) mbg19640 (1140) 363 71 2e-12 mKIAA1580 ( 640 res) mbf00310 ( 640) 354 69 3.9e-12 mKIAA0644 ( 837 res) mbg06261 ( 837) 346 68 1.1e-11 mKIAA0815 ( 835 res) mpm01062 ( 835) 342 67 1.7e-11 mKIAA0416 ( 528 res) mbg05717 ( 528) 333 66 3.5e-11 mKIAA4208 ( 721 res) mbe00555 ( 721) 332 66 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TCSCPSGFEGPTCGVDTDDCVKHACVNGGVCVDGVGNYTCQCPLQYTGRACEQLVDFCSP 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1110 1120 1130 1140 1150 1160 mKIAA4 DLNPCQHDSKCILTPKGFKCDCTPGYIGEHCDIDFDDCQDNKCKNGAHCTDAVNGYTCVC :.:::::...:. :: : .:.: :: :..:. . :::.:.::.:::.:.: ::.:.:.: mKIAA0 DMNPCQHEAQCVGTPDGPRCECMLGYTGDNCSENQDDCKDHKCQNGAQCVDEVNSYACLC 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1170 1180 1190 1200 1210 1220 mKIAA4 PEGYSGLFCEFSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIIRINEPICQCLPGYLGEKCEKLVSV ::::: .::. :: ::.: :.. .:::::.:. . ..:.::::::. : .::::.:: mKIAA0 VEGYSGQLCEI-PPA--PRSS-CEGTECQNGANCVDQGSRPVCQCLPGFGGPECEKLLSV 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1230 1240 1250 1260 1270 1280 mKIAA4 NFVNKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILLYKGDKDHIAVELYRGRVRASYDTG :::....:::. . . :..:::::..: ::.:::::.::.::::::::.:.::.::: : mKIAA0 NFVDRDTYLQFTDLQNWPRANITLQVSTAEDNGILLYNGDNDHIAVELYQGHVRVSYDPG 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1290 1300 1310 1320 1330 1340 mKIAA4 SHPASAIYSVETINDGNFHIVELLTLDSSLSLSVDGGSPKVITNLSKQSTLNFDSPLYVG :.:.:::::.::::::.:: :::.:.:. ..::.::::: .. :..:. ::: ..::::: mKIAA0 SYPSSAIYSAETINDGQFHTVELVTFDQMVNLSIDGGSPMTMDNFGKHYTLNSEAPLYVG 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1350 1360 1370 1380 1390 1400 mKIAA4 GMPGKNNVASLRQAPGQNGTSFHGCIRNLYINSELQDFRKMPMQTGILPGCEPCHKKVCA ::: : :..: :::::::::::::::.::::: : :. :..::::::.: : mKIAA0 GMPVDVNSAAFRLWQILNGTSFHGCIRNLYINNELQDFTKTQMKPGVVPGCEPCRKLYCL 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1410 1420 1430 1440 1450 1460 mKIAA4 HGMCQPSSQSGFTCECEEGWMGPLCDQRTNDPCLGNKCVHGTCLPINAFSYSCKCLEGHG ::.:::.. : .:.:: :: : ::: .. :: :.::::: :.:..:..:::.: .:.. mKIAA0 HGICQPNATPGPVCHCEAGWGGLHCDQPVDGPCHGHKCVHGKCVPLDALAYSCQCQDGYS 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1470 1480 1490 1500 1510 1520 mKIAA4 GVLCDEEEDLFNPCQMIKCKHGKCRLSGVGQPYCECNSGFTGDSCDREISCRGERIRDYY :.::.. . .:: ..: ::.:. :.. .: :. ::.:. :..: :::. .::.. mKIAA0 GALCNQVGAVAEPCGGLQCLHGHCQASATKGAHCVCSPGFSGELCEQESECRGDPVRDFH 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1530 1540 1550 1560 1570 1580 mKIAA4 QKQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAGGQCCGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVVKC . :.::: ::::. .: .::::.: : :: :: :::: .:::.::.::..:::: .:: mKIAA0 RVQRGYAICQTTRPLSWVECRGACPGQGCCQGLRLKRRKLTFECSDGTSFAEEVEKPTKC 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1590 mKIAA4 GCARCAS :::.:. mKIAA0 GCAQCV >>mKIAA0230 ( 1431 res) mbg10262 (1431 aa) initn: 362 init1: 362 opt: 413 Z-score: 357.0 bits: 78.8 E(): 9.6e-15 Smith-Waterman score: 413; 34.112% identity (34.597% ungapped) in 214 aa overlap (368-578:11-224) 340 350 360 370 380 390 mKIAA4 PSCSVLHCPAACTCSNNIVDCRGKGLTEIPTNLPETITEIRLEQNSIRVIPPGAFSPYKK ..::.: .. :. : :: : :::: .. mKIAA0 ARRQKRQCRESSLPRTQQHLDLRFNRIREIQPGAFRRLRS 10 20 30 40 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 LRRLDLSNNQISELAPDAFQGLRSLNSLVLYGNKITELPKSLFEGLFSLQLLLLNANKIN : : :.::::... ::. :..:. : :: :.: . .. :.:: ::. : :. :.:. mKIAA0 LNTLLLNNNQIKKIPNGAFEDLENLKYLYLYKNEIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIE 50 60 70 80 90 100 460 470 480 490 500 510 mKIAA4 CLRVDAFQDLHNLNLLSLYDNKLQTVAKGTFSALRAIQTMHLAQNPFICDCHLKWLADYL : ..:: : .:. : :..:.. . :::: :.... ..: .: . :::.. :::: : mKIAA0 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IPQYTAELRLNNNEFTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLT .: .. : :. :..:::. : : .. :. .. ...... .: ::. : .... :. mKIAA1 LPANVTTLSLSANKITVLR-RGAFVNVTQVTSLWLAHSEVRTVESGALAVLSQLKNLDLS 90 100 110 120 130 140 660 670 680 690 700 710 mKIAA4 SNRLENVQHKMFKGLESLKTLMLRSNRISCVGNDSFIGLGSVRLLSLYDNQITTVAPGAF : . : . ...: .:. : . ::.. . :.. .: ..: : . .:.. :. ::.: mKIAA1 HNLISNFPWSDLRNLSALQLLKMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLEPGTF 150 160 170 180 190 200 720 730 740 750 760 770 mKIAA4 DSLHSLSTLNLLANPFNCNCHLAWLGEWLRRKRIVTGNPR---CQKPYFLKEIPIQDVAI :.: .:: :.: :::.:.: :.:: : :. .: : .: :. .:.. . mKIAA1 DALSALSHLQLYHNPFHCSCGLVWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPELQGVPVHRLPA 210 220 230 240 250 260 780 790 800 810 820 mKIAA4 QDFTCDDGNDDNSCSPLSRCPSE--CTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPKDVTELYLDGNQ . : . : : . :. . : ...: .: . :. .: . :. mKIAA1 --LPCAPPSVRLSAEPPPEAPGTPLRAGLAFMLHCVAEG-----HPTPRLQWQLQIPGGT 270 280 290 300 310 320 830 840 850 860 870 880 mKIAA4 FTLVPKELSNYKHLTLIDLSNNRISTLSNQSFSNMTQLLTLILSYNRLRCIPPRTFDGLK .::: ::. mKIAA1 VVLVPPVLSKEEDGGDKVEDGEGDGDEDLPTQTEAPTPTPAPAWPAPPATPRFLALANGS 330 340 350 360 370 380 >>mKIAA1910 ( 760 res) mbg21737 (760 aa) initn: 212 init1: 212 opt: 369 Z-score: 322.3 bits: 71.4 E(): 8.3e-13 Smith-Waterman score: 409; 23.630% identity (28.049% ungapped) in 584 aa overlap (74-572:68-644) 50 60 70 80 90 100 mKIAA4 LGHCPVFTQPKAQEKSFKARSLLGKMSGIGWQTLSLSLGLVLSILNKVAPQACPAQ-CSC : : : .: .. : :. ..: . ::: mKIAA1 ELELCLWRAGWLLLLCDEIWDELLALKMLLWILL-LETSLCFAAGN-VTGDVCKEKICSC 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 mKIAA4 S---GST-VDCHGLALRSVPR-NIPRNT-ERLDLNGNNITRITKIDFAGLRHLRVLQLME . :. :::. .. :. : . : . .: :.::..::. .::.. . :.. . mKIAA1 NEIEGDLHVDCEKKGFTSLQRFTAPTSQFYHLFLHGNSLTRLFPNEFANFYNAVSLHMEN 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 mKIAA4 NRISTIERGAFQDLKELERLRLNRNNLQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFR : . : ::: :. ..::..: :... : . ::: : :. . : .. : ::. mKIAA1 NGLHEIVPGAFLGLQLVKRLHINNNKIKSFRKQTFLGLDDLEYLQADFNLLRDIDPGAFQ 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 mKIAA4 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..: : . : : ::: :..: . ::. : . mKIAA1 AQLCSCANNGTCSPIDGSCQCFPGWIGKDCSQACPSGFWGSACFHTCSCHNGASC----S 720 730 740 750 760 1530 1540 1550 1560 1570 1580 mKIAA4 KQQGYAACQTTKKVSRLECRGGCAG---GQCCGPLRSKRRKYSFECTDGSSFVDEVEKVV ..: ::. : . : : : . :. :: . .: .:.: :.. mKIAA1 AEDG--ACHCTPGWTGLFCTQRCPSAFFGKDCGHI--------CQCQNGAS-CDHITG-- 770 780 790 800 810 1590 mKIAA4 KCGCARCAS :: : mKIAA1 KCTCRTGFSGRHCEQRCAPGTFGYGCQQLCECMNNATCDHVTGTCYCSPGFKGIRCDQAA 820 830 840 850 860 870 >>mKIAA1580 ( 640 res) mbf00310 (640 aa) initn: 659 init1: 249 opt: 354 Z-score: 310.3 bits: 68.9 E(): 3.9e-12 Smith-Waterman score: 354; 38.235% identity (39.394% ungapped) in 204 aa overlap (79-279:31-231) 50 60 70 80 90 100 mKIAA4 VFTQPKAQEKSFKARSLLGKMSGIGWQTLSLSLGLVLSILNKVAPQACPAQCSCSG--ST :.: : : . . : :.::. ::::. : mKIAA1 MLNKMTLHPQQIMIGPRFNRALFDPLLVVLLALQL-LVVAGLVRAQTCPSVCSCSNQFSK 10 20 30 40 50 110 120 130 140 150 160 mKIAA4 VDCHGLALRSVPRNIPRNTERLDLNGNNITRITKIDFAGLRHLRVLQLMENRISTIERGA : : :: :: .: ::. :.:. :.: : .: ::::..::: .:.: ::: :: mKIAA1 VICVRKNLREVPDGISTNTRLLNLHENQIQIIKVNSFKHLRHLEILQLSRNHIRTIEIGA 60 70 80 90 100 110 170 180 190 200 210 220 mKIAA4 FQDLKELERLRLNRNNLQLFPELLFLGTAKLYRLDLSENQIQAIPRKAFRGAVDIKNLQL :. : .:. :.: : : .:. :. .:: .: : .: :..:: :: ... :.: mKIAA1 FNGLANLNTLELFDNRLTTIPNGAFVYLSKLKELWLRNNPIESIPSYAFNRIPSLRRLDL 120 130 140 150 160 170 230 240 250 260 270 280 mKIAA4 -DYNQISCIEDGAFRALRDLEVLTLNNNNITRLSVASFNHMPKLRTFRLHSNNLYCDCHL . ...: : .:::..: .:. :.: :. . . ... . :: . : .:.: mKIAA1 GELKRLSYISEGAFEGLSNLRYLNLAMCNLRE--IPNLTPLIKLDELDLSGNHLSAIRPG 180 190 200 210 220 230 290 300 310 320 330 340 mKIAA4 AWLSDWLRQRPRVGLYTQCMGPSHLRGHNVAEVQKREFVCSDEEEGHQSFMAPSCSVLHC mKIAA1 SFQGLMHLQKLWMIQSQIQVIERNAFDNLQSLVEINLAHNNLTLLPHDLFTPLHHLERIH 240 250 260 270 280 290 >>mKIAA0644 ( 837 res) mbg06261 (837 aa) initn: 516 init1: 289 opt: 346 Z-score: 302.2 bits: 67.8 E(): 1.1e-11 Smith-Waterman score: 475; 27.611% identity (33.333% ungapped) in 565 aa overlap (51-602:41-521) 30 40 50 60 70 mKIAA4 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