FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA1449.ptfa, 675 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1768342 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4763+/-0.00459; mu= 17.1828+/- 0.306
 mean_var=89.6255+/-21.085, 0's: 0 Z-trim: 21  B-trim: 103 in 1/35
 Lambda= 0.1355

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 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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mKIAA4188  ( 402 res)   mbh00640                   ( 402)  195   48 1.6e-06
mKIAA0893  ( 1132 res)   mbg01684                  (1132)  197   49 2.3e-06
mKIAA4123  ( 639 res)   mbg05860                   ( 639)  194   48 2.4e-06
mKIAA1708  ( 1291 res)   mbg16135                  (1291)  192   48 4.9e-06
mKIAA0696  ( 555 res)   mbh00867                   ( 555)  187   47 5.7e-06
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mKIAA1435  ( 411 res)   mbp03169                   ( 411)  155   41 0.00036
mKIAA0449  ( 171 res)   mfj00177                   ( 171)  145   38 0.00083
mKIAA0982  ( 504 res)   mpm10083                   ( 504)  141   38  0.0027
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>>mKIAA0413  ( 1251 res)   meh00513                       (1251 aa)
 initn: 235 init1: 107 opt: 227  Z-score: 237.9  bits: 55.3 E(): 4.2e-08
Smith-Waterman score: 248;  26.531% identity (29.680% ungapped) in 245 aa overlap (37-270:971-1200)

         10        20        30        40        50        60      
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                                     :.: :. .  . .:. :.:  . ...    
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       ..:   :   :  . .  .::::::.: :....::: . :  .  :..:.. :: .   .
mKIAA0 FSSGVGHKKAVRHIQFTADGKTLISSSEDSVIQVWNWQTG-DYVFLQAHQETVKDFRLLQ
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mKIAA1 DKELVASAGLDRQIFLWDVNTLTALTASNNTVTTSSLSGNKDSIYSLAMNQLGTIIVSGS
       :..:. : ..:  . .:.: :              ... .. .. : :... .: . : :
mKIAA0 DSRLL-SWSFDGTVKVWNVITGRI---------ERDFTCHQGTVLSCAISSDATKFSSTS
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       ..:. ..:.    . : .::::.  :.   .  ::    .:...: ::.: .  ::  . 
mKIAA0 ADKTAKIWSFDLLSPLHELKGHNGCVRCSAFSLDGILLATGDDNGEIRIWNVSDGQLLHS
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mKIAA1 CIATYRVHD----EGVWALQVN---DAFTHVYSGGRDRKIYCTDLRNPDIRVLICEEKAP
       : :   :..    .: :. .:    :. : : .::                         
mKIAA0 C-APISVEEGTATHGGWVTDVCFSPDSKTLVSAGGYLKWWNVATGDSSQTFYTNGTNLKK
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mKIAA1 VLKMELDRSADPPPAIWVATTKSTVNKWTLKGIHNFRASGDYDNDCTNPITPLCTQPDQV
                                                                   
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>>mKIAA4167  ( 342 res)   mpj04828                        (342 aa)
 initn: 295 init1: 177 opt: 199  Z-score: 214.5  bits: 49.1 E(): 8.4e-07
Smith-Waterman score: 369;  26.812% identity (29.249% ungapped) in 276 aa overlap (17-285:42-301)

                             10        20        30        40      
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mKIAA4 AGSMATEHLPAERAQSLLSAPRREEEPQKPNYALRLTLAGHS-AAISSVKFSPNGEWLAS
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mKIAA1 AGRDSIIRIWSV--NQHKQDPYIASMEHHTDWVNDVVLCCNGKTLISASSDTTVKVWNAH
       .. :..: ::..  .. :.  :  :.:     ..::.   ... :.:::.: :.:::. .
mKIAA4 SAADALIIIWGAYDGNCKKTLYGHSLE-----ISDVAWSSDSSRLVSASDDKTLKVWDMR
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       .: :..::. :.:.:    .   ..:..:...:... .:.:.:   :         ..::
mKIAA4 SGKCLKTLKGHSDFVFCCDFNPPSNLIVSGSFDESVKIWEVKTGKCL---------KTLS
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mKIAA1 GNKDSIYSLAMNQLGTIIVSGSTEKVLRVWDPRT--CAKLMKLKGHTDNVKALLLHRDGT
       ...: : .. .:  :..::::: . . :.::  .  : . .  .:.   :. . .  .: 
mKIAA4 AHSDPISAVNFNCNGSLIVSGSYDGLCRIWDAASGQCLRTLADEGNPP-VSFVKFSPNGK
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         :... :.:..::  .. ::. ::  : .  . : .. . :    : ::..:  .:  .
mKIAA4 YILTATLDNTLKLWDYSRGRCLKTYTGHKNEKYCLFASFSVTGRKWVVSGSEDNMVYIWN
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mKIAA1 LRNPDIRVLICEEKAPVLKMELDRSADPPPAIWVATTKSTVNKWTLKGIHNFRASGDYDN
       :.. .:                                                      
mKIAA4 LQTKEIVQRLQGHTDVVISAACHPTKNIIASAALENDKTIKVWSSDC             
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>>mKIAA4188  ( 402 res)   mbh00640                        (402 aa)
 initn: 151 init1: 151 opt: 195  Z-score: 209.5  bits: 48.4 E(): 1.6e-06
Smith-Waterman score: 195;  25.389% identity (27.374% ungapped) in 193 aa overlap (94-281:95-278)

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mKIAA1 DPYIASMEHHTDWVNDVVLCCNGKTLISASSDTTVKVWNAHKGFCMSTLRTHKDYVKALA
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mKIAA4 SVSLPGIPVAKPAYSFHVSADGQMQPVPFPSDALVGTGIPRHARQLHTL-AHGEVVCAVT
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        ... . : ..:    . .:::.      .:.. :.  .  .  . : :  .   :  ..
mKIAA4 ISSSTQHVYTGGKG-CVKVWDVGQ----PGSKTPVAQLDCLNRDNYIRSCKLLPDGQSLI
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        :.  ..: .::     ::  :.: .    .    :: .  :.  :.:  :::.: .: :
mKIAA4 VGGEASTLSIWDLAAPTPRIKAELTS---SAPACYALAVSPDAKVCFSCCSDGNIVVWDL
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        .:  .  .. : .:.  ....:  :....:: :  . : :::.                
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>>mKIAA0893  ( 1132 res)   mbg01684                       (1132 aa)
 initn:  58 init1:  58 opt: 197  Z-score: 206.7  bits: 49.4 E(): 2.3e-06
Smith-Waterman score: 210;  23.100% identity (26.573% ungapped) in 329 aa overlap (28-327:818-1132)

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                                     . ..: :. . :. . :...: .:  .:. 
mKIAA0 PGDSSGNLSRSKGEEDDKSKKQFVCINTLEDTQAVRAVAFHPS-GSLYAVGSNSKTLRVC
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mKIAA1 -------WSVNQHKQDPYI--ASMEHHTDWVNDVVLCCNGKTLISASSDTTVKVWNAHKG
               :.... ..: .     .::   .  :.    :. : ..:.:  :::   .  
mKIAA0 AYPEKMDASAHDNPKQPVVRFKRNKHHKGSIYCVAWSPCGQLLATGSNDKYVKVLPFNAE
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mKIAA1 FCMST-----LRTHKDYVKALAYAKDKE----LVASAGL-DRQIFLWDVNTLTALTASNN
        : .:     .  :   .. ::. .  :    .. :::  : .:.  : .   .: :   
mKIAA0 TCNATGPDLEFSMHDGTIRDLAFMEGPESGGAILISAGAGDCNIYTTDCQRGQGLHA---
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mKIAA1 TVTTSSLSGNKDSIYSLAMNQLGTIIVSGSTEKVLRVWDPR--TCAKLM--KLKGHTDNV
             :::.   : .: ..  : .:.::: .:..: :: :  .:....   ..:  . :
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mKIAA1 KALLLHRDGTQCLSGSSDGTIRLWFLGQQRCIATYRVHDEGVWALQVNDAFTHVYSGGRD
        .. .  .:    .:. :..  :. .   : . .:. :.  : ... . .  .. .:. :
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        ::  :::..   . :    . :.:  :..    :      ..  ...  ::. :: .: 
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mKIAA1 HNFRASGDYDNDCTNPITPLCTQPDQVIKGGASIIQCHILNDKRHILTKDTNNNVAYWDV

>>mKIAA4123  ( 639 res)   mbg05860                        (639 aa)
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mKIAA1                      AAHHRQNTAGRRKVQVSYVIRDEVEKYNRNGVNALQLDP
                                     ::...:  .  :.:. :    ::  :: : 
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mKIAA1 ALNRLFTAGRDSIIRIWSVNQHKQDPYIASMEHHTDWVNDVVLCC--NGKTLISASSDTT
         ... .. ::. :.::. .  .    ...   ::      :::   . ...:..:::.:
mKIAA4 --QKIVSGLRDNTIKIWDKSTLECKRILTG---HTG----SVLCLQYDERVIITGSSDST
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mKIAA1 VKVWNAHKGFCMSTLRTHKDYVKALAYAKDKELVASAGLDRQIFLWDVNTLTALTASNNT
       :.::... :  ..::  : . :  : .  .. .... . ::.: .::. . : .:     
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mKIAA1 VTTSSLSGNKDSIYSLAMNQLGTIIVSGSTEKVLRVWDPRTCAKLMKLKGHTDNVKALLL
            : :.. ..  . ...    :::.: .....::.  ::  .  :.::  .. : : 
mKIAA4 -LRRVLVGHRAAVNVVDFDD--KYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGI-ACLQ
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mKIAA1 HRDGTQCLSGSSDGTIRLWFLGQQRCIATYRVHDEGVWALQVNDAFTHVYSGGRDRKIYC
       .::    .:::::.::::: .    :. . . :.: :  .. ..   .. ::. : ::  
mKIAA4 YRD-RLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNK--RIVSGAYDGKIKV
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mKIAA1 TDL------RNPD----IRVLICEEKAPVLKMELDR------SADPPPAIWVATTKSTVN
        ::      : :     .:.:. :... :.....:.      : :    ::         
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mKIAA1 KWTLKGIHNFRASGDYDNDCTNPITPLCTQPDQVIKGGASIIQCHILNDKRHILTKDTNN
                                                                   
mKIAA4 AEPPRSPSRTYTYISR                                            
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>>mKIAA1708  ( 1291 res)   mbg16135                       (1291 aa)
 initn: 143 init1:  68 opt: 192  Z-score: 200.8  bits: 48.5 E(): 4.9e-06
Smith-Waterman score: 207;  22.378% identity (26.016% ungapped) in 429 aa overlap (1-384:876-1289)

                                             10              20    
mKIAA1                               AAHHRQNTAGRRKVQVS------YVIRDEV
                                     : .:... .:  ....:         :.:.
mKIAA1 SRQSSLSEKKVPEPSPVTRRKAYEKADKPKAKEHKHSDSGASETSLSPPSSPPSRPRNEL
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mKIAA1 EKYNR----NGVNALQLDPAL---NRLFTAGRDSIIRIWSVNQHKQDPY--IASMEHHTD
       . .::    .:. ..: : .    . :  . :  :  . . .  . .:   .   : :: 
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mKIAA1 WVNDVVLCCNGKT--LISASSDTTVKVWNAHKGFCMSTLRTHKDYVKALAYAKDKELVAS
           .::: ..    :...:.: : ::::   :  . .: .: . : .. : .   :: .
mKIAA1 ----AVLCVDSTDDLLFTGSKDRTCKVWNLVTGQEIMSLGVHPNNVVSVKYCNYTSLVFT
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mKIAA1 AGLDRQIFLWDV----NTLTALTASN----------NTVTTSSLSGNKDSIYSLAMNQLG
       .. .  : .::.    . . .::.:.          .:  : .. .....: ..:.:  :
mKIAA1 VSTSY-IKVWDIRESAKCIRTLTSSGQVTLGEACSASTSRTVAIPSGESQINQIALNPTG
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mKIAA1 TIIVSGSTEKVLRVWDPRTCAKLMKLKGHTDNVKALLLHR--DGTQCL-SGSSDGTIRLW
       :.. ..: . : :.:: .   .  :: ::   :  : . .  .: . . .::.:  :...
mKIAA1 TFLYAASGNAV-RMWDLKRFQSTGKLTGHLGPVMCLTVDQISNGQDLIITGSKDHYIKMF
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mKIAA1 -----FLGQQRCIATYRV-HDEGVWALQVNDAFTHVYSGGRDRKIYCTDLRNPDI-RVLI
             ::      ...  : .:. :: ..    ...::.::  :   :: .  . . . 
mKIAA1 DVTEGALGTVSPTHNFEPPHYDGIEALAIQG--DNLFSGSRDNGIKKWDLAQKGLLQQVP
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mKIAA1 CEEKAPVLKMELDRSADPPPAIWVATTKSTVNKWTLKGIHNFRASGDYDNDCTNPITPLC
         .:  :  . :   .   :..  .   . .. :.   . .:   :.. .   .::. .:
mKIAA1 NAHKDWVCALGL---VPGHPVLLSGCRGGILKLWN---VDTFVPVGEMRGH-DSPINAIC
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mKIAA1 TQPDQVIKGG----ASIIQCHILNDKRHILTKDTNNNVAYWDVLKACKVEDLGKVDFEDE
       ..  .:. ..    . : . : :.: .   : : ....:                     
mKIAA1 VNSTHVFTAADDRTVRIWKAHNLQDGQLSDTGDLGEDIASN                   
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mKIAA1 IKKRFKMVYVPNWFSVDLKTGMLTITLDESDCFAAWVSAKDAGFSSPDGSDPKLNLGGLL

>>mKIAA0696  ( 555 res)   mbh00867                        (555 aa)
 initn: 225 init1:  91 opt: 187  Z-score: 199.5  bits: 47.0 E(): 5.7e-06
Smith-Waterman score: 347;  28.037% identity (32.847% ungapped) in 321 aa overlap (10-312:239-530)

                                    10        20        30         
mKIAA1                      AAHHRQNTAGRRKVQVSYVIRDEVEKYNRNGVNALQLDP
                                     ::...:     : . .. : .::  :: : 
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mKIAA1 ALNRLFTAGRDSIIRIWSVNQHKQDPYIASMEHHTDWVNDVVLCC--NGKTLISASSDTT
         ...... ::. :.::. .. .    .  .  ::      :::   . ......:::.:
mKIAA0 --DKIISGLRDNSIKIWDKSSLEC---LKVLTGHTG----SVLCLQYDERVIVTGSSDST
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mKIAA1 VKVWNAHKGFCMSTLRTHKDYVKALAYAKDKELVASAGLDRQIFLWDVNTLTALTASNNT
       :.::... :  ..::  :.. :  : ...   :... . ::.: .::. . : .:     
mKIAA0 VRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNG--LMVTCSKDRSIAVWDMASATDIT-----
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mKIAA1 VTTSSLSGNKDSIYSLAMNQLGTIIVSGSTEKVLRVWDPRTCAKLMKLKGHTDNVKALLL
            : :.. ..  . ...    :::.: .....::.  ::  .  :.::  .. : : 
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mKIAA1 HRDGTQCLSGSSDGTIRLWFLGQQRCIATYRVHDEGVWALQVNDAFTHVYSGGRDRKIYC
       .::    .:::::.::::: .    :. . . :.: :  .. ..   .. ::. : ::  
mKIAA0 YRD-RLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNK--RIVSGAYDGKIKV
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mKIAA1 TDL------RNPD----IRVLICEEKAPVLKMELDR------SADPPPAIWVATTKSTVN
        ::      : :     .:.:. :... :.....:.      : :    ::         
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mKIAA1 KWTLKGIHNFRASGDYDNDCTNPITPLCTQPDQVIKGGASIIQCHILNDKRHILTKDTNN
                                                                   
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>>mFLJ00045  ( 612 res)   mfj40199                        (612 aa)
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Smith-Waterman score: 211;  25.118% identity (26.500% ungapped) in 211 aa overlap (32-235:313-519)

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mKIAA1 AHHRQNTAGRRKVQVSYVIRDEVEKYNRNGVNALQLDPALNRLFTAGRDSIIRIWSVNQH
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mFLJ00 QDIMDTHPASGKDVRVPTTASYVFDAHDGEVNAVQFSPGSRLLATGGMDRRVKLWEAFGD
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mKIAA1 KQDPYIASMEHHTDWVNDVVLCCNGKTLISASSDTTVKVWNAHKGFCMSTLRTHKDYVKA
       : . . .:.   .  .... .   :  :..::.: . ..:..       ::  :.  : .
mFLJ00 KCE-FKGSLSGSNAGITSIEFDSAGAYLLAASNDFASRIWTVDDYRLRHTLTGHSGKVLS
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mKIAA1 LAYAKDKELVASAGLDRQIFLWDVNTLTALTASNNTV--TTSSLSGNKDSIYSLAMNQLG
         .  :.  ..:.. :: . :::. . .    ..  :  . . ::: :  . . . :.. 
mFLJ00 AKFLLDNARIVSGSHDRTLKLWDLRSKVCEEMQSLCVLMVFGFLSGIKTVFAGSSCNDIV
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mKIAA1 TI---IVSGSTEKVLRVWDPRT--CAKLMKLKGHTDNVKALLLHRDGTQCLSGSSDGTIR
            ..::  .: .: :: :.   .. :.: :.   . :: :. . :. :: : :  ..
mFLJ00 CTEQCVMSGHFDKKIRFWDIRSESVVREMELLGK---ITALDLNPERTELLSCSRDDLLK
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mKIAA1 LWFLGQQRCIATYRVHDEGVWALQVNDAFTHVYSGGRDRKIYCTDLRNPDIRVLICEEKA
       .                                                           
mFLJ00 VIDLRTNAVKQTFSAPGFKCGSDWTRVVFSPDGSYVAAGSAEGSLYVWSVLTGKVEKVLS
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>>mKIAA1261  ( 729 res)   mfj34130                        (729 aa)
 initn: 138 init1: 138 opt: 168  Z-score: 178.1  bits: 43.5 E(): 8.9e-05
Smith-Waterman score: 180;  23.006% identity (26.786% ungapped) in 326 aa overlap (72-389:441-728)

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