FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1449.ptfa, 675 aa vs ./tmplib.26680 library 1768342 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4763+/-0.00459; mu= 17.1828+/- 0.306 mean_var=89.6255+/-21.085, 0's: 0 Z-trim: 21 B-trim: 103 in 1/35 Lambda= 0.1355 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0413 ( 1251 res) meh00513 (1251) 227 55 4.2e-08 mKIAA4167 ( 342 res) mpj04828 ( 342) 199 49 8.4e-07 mKIAA4188 ( 402 res) mbh00640 ( 402) 195 48 1.6e-06 mKIAA0893 ( 1132 res) mbg01684 (1132) 197 49 2.3e-06 mKIAA4123 ( 639 res) mbg05860 ( 639) 194 48 2.4e-06 mKIAA1708 ( 1291 res) mbg16135 (1291) 192 48 4.9e-06 mKIAA0696 ( 555 res) mbh00867 ( 555) 187 47 5.7e-06 mFLJ00045 ( 612 res) mfj40199 ( 612) 185 47 8e-06 mKIAA1261 ( 729 res) mfj34130 ( 729) 168 43 8.9e-05 mKIAA1547 ( 897 res) mbg07188 ( 897) 165 43 0.00015 mKIAA1435 ( 411 res) mbp03169 ( 411) 155 41 0.00036 mKIAA0449 ( 171 res) mfj00177 ( 171) 145 38 0.00083 mKIAA0982 ( 504 res) mpm10083 ( 504) 141 38 0.0027 mKIAA1942 ( 431 res) mej02524 ( 431) 135 37 0.0056 mFLJ00025 ( 1204 res) mfj36335 (1204) 138 38 0.007 >>mKIAA0413 ( 1251 res) meh00513 (1251 aa) initn: 235 init1: 107 opt: 227 Z-score: 237.9 bits: 55.3 E(): 4.2e-08 Smith-Waterman score: 248; 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