FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0600.ptfa, 917 aa vs ./tmplib.26680 library 1768100 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3554+/-0.00773; mu= 3.1514+/- 0.510 mean_var=288.5312+/-69.544, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 153 in 1/35 Lambda= 0.0755 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0744 ( 573 res) mbg11691 ( 573) 2250 259 1.4e-69 mFLJ00062 ( 852 res) mpm11169 ( 852) 1455 172 2.1e-43 >>mKIAA0744 ( 573 res) mbg11691 (573 aa) initn: 2239 init1: 2061 opt: 2250 Z-score: 1341.5 bits: 258.8 E(): 1.4e-69 Smith-Waterman score: 2250; 59.259% identity (62.411% ungapped) in 594 aa overlap (333-917:1-573) 310 320 330 340 350 360 mKIAA0 QLVMQQQHQQFLEKQKQQQMQLGKILTKTGELSRQPTTHPEETEEELTEQQEALLGEGAL : .:: .: ::.:::: .: mKIAA0 EQLKQPGSHLEEAEEEL---------QGDQ 10 20 370 380 390 400 410 420 mKIAA0 TIPREGSTESESTQEDLEEEEEEEEEEEEEDCIQVKDEDGESGPDEGPDLEESSAGYKKL .. .......:.. : :. . ..::.: .: :: ...: : . mKIAA0 SMEDRAASKDNSARSD--SSACVEDTLGQVGAVKVKEEPVDS--DEDAQIQEMECGEQAA 30 40 50 60 70 430 440 450 460 470 mKIAA0 FA------DAQQLQPLQVYQAPLSLAT---VPHQALGRTQSSPAAPGSMKSPTDQPTVVK : .... . :.:.:. ...: : :.::.::::: : . .: : . mKIAA0 FMQQPPLLESSRARSLSVHQTLAAVGTDGLEKHGLLSRTHSSPAASMSPHPAADCPR--Q 80 90 100 110 120 130 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 HLFTTGVVYDTFMLKHQCMCGNTHVHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLGKCERIRGRKATLD .::..:: .::::::.::.. .:::::::::::::::::::::.:::::.::::.:. mKIAA0 PSSATGIAYDPLMLKHQCICGSSTTHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLSKCERIQGRKASLE 140 150 160 170 180 190 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 EIQTVHSEYHTLLYGTSPLNRQKLDSKKLLGPISQKMYAMLPCGGIGVDSDTVWNEMHSS ::: ::::.:.::::::::. :::: . ::: :.:... :::::.::::::.:::.::: mKIAA0 EIQLVHSEHHSLLYGTSPLDGQKLDPRTLLGDDSRKFFSSLPCGGLGVDSDTIWNELHSS 200 210 220 230 240 250 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 SAVRMAVGCLVELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKLLQQK .:.::::::..::: :::.::::::::..::::::::::.::::::::::::::: :... mKIAA0 GAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESAAMGFCFFNSVAITAKYLRDQ 260 270 280 290 300 310 660 670 680 690 700 710 mKIAA0 LSVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPEEVGGGPGVGY :...:.:::: :.::::::::::: :::.:::::::::.::::::::::.::: : : :: mKIAA0 LNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGNFFPGSGAPNEVGVGLGEGY 320 330 340 350 360 370 720 730 740 750 760 770 mKIAA0 NVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAQEFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSV :::.:::::.:::.:::::: ::::::::.:.::.::.:::::::::.::: :::::.: mKIAA0 NVNIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTVVMPVAREFDPDMVLVSAGFDALEGHTPPLGGYKV 380 390 400 410 420 430 780 790 800 810 820 830 mKIAA0 TARCFGHLTRQLMTLAGGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQK ::.::::::.::::::.:::.:::::::::::::::::::..:::. : ::.: .:.:. mKIAA0 TAKCFGHLTKQLMTLANGRVALALEGGHDLTAICDASEACINALLGNEPGPLEEDALHQS 440 450 460 470 480 490 840 850 860 870 880 890 mKIAA0 PSVNAVATLEKVIEIQSKHWSCVQRFAAGLGCSLREAQTGEKEEAETVSAMALLSVGAEQ ..::.:.:.:.:.::::.:. .. ::. : .: .: .::.:::::.: :.: .:: mKIAA0 VNTNAAASLQKTIDIQSKYWKSIKMVAAARGGALPASQL--QEETETVSALASLTVDVEQ 500 510 520 530 540 550 900 910 mKIAA0 AQAVATQEHSPRPAEEPMEQEPAL : :: . : : ::::.:::: mKIAA0 PFA---QEDG-RTAGEPMEEEPAL 560 570 >>mFLJ00062 ( 852 res) mpm11169 (852 aa) initn: 1707 init1: 1415 opt: 1455 Z-score: 871.5 bits: 172.4 E(): 2.1e-43 Smith-Waterman score: 1592; 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