FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0548.ptfa, 1059 aa vs ./tmplib.26680 library 1767958 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9843+/-0.00459; mu= 17.0277+/- 0.307 mean_var=129.4449+/-30.328, 0's: 0 Z-trim: 15 B-trim: 128 in 1/35 Lambda= 0.1127 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0534 ( 1444 res) mpf00179 (1444) 2937 490 8.1e-139 mKIAA1781 ( 1140 res) mbg19640 (1140) 271 57 2.3e-08 mKIAA0818 ( 600 res) mbg02936 ( 600) 236 51 8.4e-07 mKIAA0815 ( 835 res) mpm01062 ( 835) 219 48 6.9e-06 mKIAA0817 ( 1399 res) mbg09915 (1399) 207 46 3.6e-05 mFLJ00344 ( 1032 res) msh20362 (1032) 202 45 5.3e-05 mKIAA0533 ( 1702 res) mpf00729 (1702) 189 44 0.0003 mFLJ00193 ( 475 res) mng09109 ( 475) 164 39 0.0025 >>mKIAA0534 ( 1444 res) mpf00179 (1444 aa) initn: 3896 init1: 1950 opt: 2937 Z-score: 2584.6 bits: 490.4 E(): 8.1e-139 Smith-Waterman score: 4707; 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