FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0818.ptfa, 600 aa vs ./tmplib.26680 library 1768417 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.2534+/-0.00723; mu= -31.3889+/- 0.471 mean_var=571.3733+/-139.341, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0537 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1781 ( 1140 res) mbg19640 (1140) 386 45 5e-05 mKIAA0815 ( 835 res) mpm01062 ( 835) 381 44 5.1e-05 mKIAA0149 ( 827 res) msp04035 ( 827) 331 40 0.00074 mKIAA0533 ( 1702 res) mpf00729 (1702) 302 38 0.0061 mFLJ00070 ( 1167 res) mbg01449 (1167) 292 37 0.0079 >>mKIAA1781 ( 1140 res) mbg19640 (1140 aa) initn: 207 init1: 93 opt: 386 Z-score: 182.6 bits: 44.8 E(): 5e-05 Smith-Waterman score: 436; 32.967% identity (41.667% ungapped) in 273 aa overlap (202-438:366-617) 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 ESPDRSSNSSGVPPTAPVTEAPTSPPPEHMCNCSEVGSLDVKRCNQTTGQCDCHVGYQGL :.: . : .:. .:: :.:. ::.: mKIAA1 GQCHCTAGYMGDRCQEECPFGTFGFLCSQRCDCHNGG-----QCSPATGACECEPGYKGP 340 350 360 370 380 390 240 250 260 270 280 mKIAA0 HCDT--CKEGFYLNHTVGLCLPCHCSPHGAVSILCNS-SGNCQCKVGVTGSMCDK-CQDG :. : ::. : : ::: :. ....: :. .: : :. : .: .:.. : : mKIAA1 SCQERLCPEGL---HGPGCTLPCPCDTENTIS--CHPVTGACTCQPGWSGHYCNESCPAG 400 410 420 430 440 290 300 310 320 330 340 mKIAA0 HYGFGKTGC-LPCQCNNRSDSCDVHTGACLNCQENSKGEHCE-ECKEGFYPSPDAAKQCH .:: .:: ::: :.: .: : ::.: .: . :: : : : : .:. .. : mKIAA1 YYG---NGCQLPCTCQNGAD-CHSITGSC-TCAPGFMGEVCAVPCAAGTY-GPNCSSVCS 450 460 470 480 490 350 360 370 380 390 mKIAA0 RCP----CSAVTSTGNCTIESGELEPTCD-QCKDGYTGQNCNK---CENGY----YNSDS : :: : :.:: . : :. : .: : :::. : :: .... mKIAA1 -CSNGGTCSPVD--GSCTCREGWQGLDCSLPCPSGTWGLNCNETCICANGAACSPFDGSC 500 510 520 530 540 550 400 410 420 430 mKIAA0 ICT------QCE-----------CHGHVDPIKTPKICKPESGECINCLHNTTGFWCEK-C :: .:: : : : .. : : .:.: :: . ::. :.. : mKIAA1 ACTPGWLGDSCELPCPDGTFGLNCSEHCDCSHADG-CDPVTGHCC-CLAGWTGIRCDSTC 560 570 580 590 600 610 440 450 460 470 480 490 mKIAA0 LEGYVRDLQRNCIKQEVIVPTPEGSTILVSNASLTTSVPTPVINSTFAPTTLQTIFAVSS : mKIAA1 PPGRWGPNCSVSCSCENGGSCSPEDGSCECAPGFRGPLCQRICPPGFYGHGCAQPCPLCV 620 630 640 650 660 670 >>mKIAA0815 ( 835 res) mpm01062 (835 aa) initn: 140 init1: 95 opt: 381 Z-score: 182.4 bits: 44.3 E(): 5.1e-05 Smith-Waterman score: 427; 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