FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0684.ptfa, 1186 aa vs ./tmplib.26680 library 1767831 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4084+/-0.00624; mu= 6.7228+/- 0.416 mean_var=190.8929+/-43.721, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0928 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0126 ( 1030 res) mib33003 (1030) 593 93 3.3e-19 >>mKIAA0126 ( 1030 res) mib33003 (1030 aa) initn: 525 init1: 297 opt: 593 Z-score: 437.1 bits: 92.7 E(): 3.3e-19 Smith-Waterman score: 947; 26.224% identity (29.790% ungapped) in 919 aa overlap (307-1182:172-1023) 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 STSSLSSLGASGGASNWDSYSDHFTIETCKETDMLNYLIECFDRVGIEEKKAPKMCSQPA : .. :: ::.:. : :.:. : mKIAA0 ARLLLQDPGNHLISMTSSTTLNLSADRDAGERHIFCYLYSCFQRAKEEITKVPENLLPFA 150 160 170 180 190 200 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 V---SQLLSNIRSQCISHTALVLQGSLTQPRSLQQPSFLVPYMLCRNLPYGFIQELVRTT : . .:: :. .. : :. : .:. .. .. ... :..:.... mKIAA0 VQCRNLTVSNTRTVLLTPEIYVDQNIHEQLVDLMLEAIQGAHF--EDVTE-FLEEVIEAL 210 220 230 240 250 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 HQDEEV--FKQIFIPILQGLALAAKECSLESDYFKYPLMALGELCETKFGKTHPMCNLVA :::: : ...::... : :. : . . : . . : . . : .. mKIAA0 LLDEEVRTFPEVMIPVFDILLSRIKDLEL-CQILLYAYLDI----LLYFTRQKDMAKVF- 260 270 280 290 300 310 460 470 480 490 500 mKIAA0 SLPLWLPKSLSPGSGRELQRLSYLGAFFSFSVFAEDDAKVVEK--YFSGPA-ITLENTRV : ::. :..:. :. . ::.....: . . . :::. .: .:. . .. .: mKIAA0 -LEYIQPKD--PSNGQMYQK-TLLGVILNISCLLKTPG-VVENHGFFLNPSRSSPQEIKV 320 330 340 350 360 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 VSQSLQHYLELGRQELFKILHSIL-LNGETREAALSYMAALVNANMKKAQMQADD----- ...... .......:...: :. ::.. : ... ..:: .... :.. mKIAA0 QEANIHQFMAQFHEKIYQMLKNLLQLSPETKHCILFWLGNCLHANAGRTKIWANQMPEIF 370 380 390 400 410 420 570 580 590 600 610 mKIAA0 -RLVSTDGFMLNLLWVLQQLSTKI------KLETVDPTYIFHPRCRITLPNDETRINATM .. ..:.:.::: .: .: . .: : .::: : . ::: : . mKIAA0 FQMYASDAFFLNLGAALLKLCQPFCKPRSSRLLTFNPTY-----CVLKDLNDEER---KI 430 440 450 460 470 620 630 640 650 660 mKIAA0 EDVNER-LTELYGDQPPFSEPKFP------TECFFLTLHAHHLSILPSCRRYIRRLRAIR ..:. : : . : .:: :: :: . :: .. .:.. : . . .. . mKIAA0 KSVHMRGLDKETCLIPAVQEPTFPQSYNLVTENLALTEYTLYLGFH---RLHDQMVKINQ 480 490 500 510 520 530 670 680 690 700 710 720 mKIAA0 ELNRTVEDLKNNESQWKDSPLATRHREMLKRCKTQLKKLVRCKACADAGLLDESFLRRCL .:.: .. ..: ..:: : :: :...:. . ... . ..:. :: mKIAA0 NLHRL--QVAWRDAQQSSSPAADNLRE-------QFERLMTIYLSTKTAMTEPQMLQNCL 540 550 560 570 580 730 740 750 760 770 780 mKIAA0 NFYG----LLIQLMLRILDPAYPDVTLPLNSEVPKVFAALPEFYVEDVAEFLFFIVQYSP :. ::.:: . ....:: . .. : .:::.......::.:. ... mKIAA0 NLQVSMAVLLVQLAIGNEGSQPIELSFPLPDGYSSL-AYVPEFFADNLGDFLIFLRRFAE 590 600 610 620 630 640 790 800 810 820 830 mKIAA0 QVLYEPCT--QDIVMFLVVMLCNQNYIRNPYLVAKLVEVMFMTNPSVQ----PRTQKFFE ..: . .. :.... . . ..::.: :::.::. . : .. : ... :. mKIAA0 DILETSADSLEHVLHFITIFTGSIERMKNPHLRAKLAEVLEAVMPHLDQTPSPLVSSVFH 650 660 670 680 690 700 840 850 860 870 880 890 mKIAA0 ---MIENHPLSTKLLVPSLMKFYTDVEHTGATSEFYDKFTIRYHISTIFKSLWQNIAHHG .. : : . .: . .:.: ..:.: :: .: .::. : . :.. .: mKIAA0 RKRVFCNFPYAPQL-AEALIKVFVDIEFTGDPHQFEQKFNYRRPMYPILRYMW------- 710 720 730 740 750 900 910 920 930 940 950 mKIAA0 TFMEEFNSGKQFVRYINMLINDTTFLLDESLESLKRIHEVQEEMKNKEQWDQLPRDQQQA : . : ::.. :..: ..:. :.. .:..: . .. mKIAA0 --------GTDCYR--------------ESIKYLSKI-KIQQIEKDRGEWESLTPEARRE 760 770 780 790 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA0 RQSQLAQDERVSRSYLALATETVDMFHLLTKQVQKPFLRPELGPRLAAMLNFNLQQLCGP ... : . ...: . ...::. . .::..... :..: :. :. .:::. ::.: :: mKIAA0 KEAGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLSFLTSEIKSLFVHPFLAERIISMLNYFLQHLVGP 800 810 820 830 840 850 1020 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA0 KCRDLKVENPEKYGFEPKKLLDQLTDIYLQL-DCARFAKAIADDQRSYSKELFEEVISKM : :::.. .. :.:..:.... :::.: : : .. : :::: :: ... . mKIAA0 KMGALKVKDFSEFDFKPQQLVSDICTIYLNLGDEENFCATVPKDGRSYSPTLFAQTVRVL 860 870 880 890 900 910 1080 1090 1100 1110 1120 1130 mKIAA0 RKAGIKSTIAIEKFKLLAEKVEEIVAKNARAEIDYSDAPDEFRDPLMDTLMTDPVRLPSG .: . ... . :. :::... .. . . : :.:: ::: ::.:.:::.::: :::. mKIAA0 KKINKPGNMIVA-FSNLAERIKSLADLQQQEEETYADACDEFLDPIMSTLMSDPVVLPSS 920 930 940 950 960 970 1140 1150 1160 1170 1180 mKIAA0 TV-MDRSIILRHLLNSPTDPFNRQMLTESMLEPVPELKEQIQAWMREKQSSDH : .::: : ::::.. ::::::. :: ....: ::::.:: :. :... mKIAA0 RVTVDRSTIARHLLSDQTDPFNRSPLTMDQIRPNTELKEKIQRWLAERKQQKEQPE 980 990 1000 1010 1020 1030 1186 residues in 1 query sequences 1767831 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:26:08 2006 done: Mon Mar 27 10:26:10 2006 Scan time: 1.060 Display time: 0.100 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]