FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0236.ptfa, 1852 aa vs ./tmplib.26680 library 1767165 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8180+/-0.00715; mu= 8.4568+/- 0.477 mean_var=260.0439+/-62.355, 0's: 0 Z-trim: 51 B-trim: 5 in 1/35 Lambda= 0.0795 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4236 ( 919 res) mfj05191 ( 919) 698 95 1.3e-19 mKIAA0326 ( 885 res) mib10041 ( 885) 585 82 1e-15 mKIAA1588 ( 617 res) mbp00262 ( 617) 570 80 2.7e-15 mKIAA1852 ( 736 res) mej02019 ( 736) 570 80 3e-15 mKIAA1710 ( 461 res) mbg19468 ( 461) 562 79 4.2e-15 mKIAA0628 ( 508 res) msj08164 ( 508) 543 76 2e-14 mKIAA3006 ( 617 res) mbg05721 ( 617) 539 76 3.1e-14 mKIAA1396 ( 481 res) mfj16154 ( 481) 532 75 4.7e-14 mKIAA1559 ( 504 res) mbp01052 ( 504) 531 75 5.2e-14 mKIAA0441 ( 699 res) mbp07087 ( 699) 526 75 9.5e-14 mKIAA4205 ( 653 res) mfj21207 ( 653) 524 74 1.1e-13 mKIAA4196 ( 437 res) mfj00049 ( 437) 503 72 4.4e-13 mKIAA4218 ( 601 res) mpm12334 ( 601) 495 71 1e-12 mKIAA1611 ( 558 res) mph00982 ( 558) 489 70 1.6e-12 mKIAA1948 ( 463 res) mph00578 ( 463) 486 70 1.8e-12 mKIAA0961 ( 486 res) mph04182 ( 486) 482 69 2.5e-12 mKIAA1141 ( 886 res) mef00011 ( 886) 466 68 1.3e-11 mKIAA1703 ( 891 res) mfj09089 ( 891) 465 68 1.4e-11 mKIAA1954 ( 643 res) mpj01436 ( 643) 456 67 2.4e-11 mKIAA4237 ( 519 res) mfj17080 ( 519) 447 65 4.2e-11 mKIAA1431 ( 833 res) mfj27243 ( 833) 446 66 6.1e-11 mKIAA1874 ( 435 res) mbg02924 ( 435) 438 64 7.7e-11 mKIAA0478 ( 1234 res) mib07095 (1234) 422 63 5.3e-10 mKIAA1015 ( 831 res) mbh00453 ( 831) 416 62 6.7e-10 mKIAA1388 ( 523 res) mbg09616 ( 523) 405 61 1.2e-09 mKIAA4222 ( 543 res) mkg04188 ( 543) 347 54 1.2e-07 mKIAA0924 ( 617 res) mbp20088 ( 617) 343 54 1.8e-07 mKIAA4229 ( 450 res) mfj48069 ( 450) 340 53 1.9e-07 mKIAA0426 ( 508 res) mpm11025 ( 508) 333 52 3.6e-07 mFLJ00187 ( 488 res) mbg06919 ( 488) 325 51 6.7e-07 mFLJ00416 ( 522 res) msj08249 ( 522) 311 50 2.1e-06 mKIAA1084 ( 1013 res) mpf00327 (1013) 314 51 2.5e-06 mKIAA0198 ( 506 res) mpm05258 ( 506) 304 49 3.6e-06 mKIAA4227 ( 539 res) mng13251 ( 539) 277 46 3.2e-05 mKIAA4234 ( 105 res) mph00083 ( 105) 261 43 4.2e-05 mFLJ00107 ( 1371 res) mfj24090 (1371) 281 47 4.2e-05 mKIAA1020 ( 642 res) mpm09294 ( 642) 266 45 8.6e-05 mKIAA0760 ( 1400 res) mbg03730 (1400) 259 44 0.00024 mKIAA1572 ( 463 res) mfj40003 ( 463) 230 40 0.0012 mKIAA1221 ( 1249 res) mbg07086 (1249) 236 42 0.0014 mKIAA1803 ( 705 res) mfj24209 ( 705) 222 40 0.003 mKIAA1729 ( 976 res) mpf02083 ( 976) 218 39 0.0051 mKIAA1993 ( 527 res) meh02016 ( 527) 210 38 0.0066 >>mKIAA4236 ( 919 res) mfj05191 (919 aa) initn: 700 init1: 297 opt: 698 Z-score: 444.5 bits: 94.5 E(): 1.3e-19 Smith-Waterman score: 800; 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