FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0826.ptfa, 1481 aa vs ./tmplib.26680 library 1767536 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9662+/-0.00497; mu= 12.7999+/- 0.333 mean_var=114.5839+/-26.561, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1198 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4143 ( 1016 res) mbh04327 (1016) 2232 398 5.7e-111 >>mKIAA4143 ( 1016 res) mbh04327 (1016 aa) initn: 3284 init1: 1267 opt: 2232 Z-score: 2084.6 bits: 397.8 E(): 5.7e-111 Smith-Waterman score: 3449; 52.975% identity (56.667% ungapped) in 1059 aa overlap (444-1481:6-1016) 420 430 440 450 460 470 mKIAA0 SNSLRLSLVGDRRGDRRRSNTLDITDGRINHSGSLARTRSLSSLREKGVYDTQPPTEPSN ..: ..::: :::.:. . : . ..:.: mKIAA4 IQACTQQGLSSKTRSNSSLKES-LTDPSHVSHPTN 10 20 30 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 LMATIFWIATSLLESDYEYEYLLALRLLSKLLTHLPLDKSESREKIENVQSKLKWSNFPG 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