FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0716.ptfa, 2035 aa vs ./tmplib.26680 library 1766982 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.0541+/-0.00677; mu= -16.7970+/- 0.442 mean_var=449.7978+/-109.492, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0605 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0209 ( 1567 res) mth00856 (1567) 2643 247 3.6e-65 mKIAA0299 ( 333 res) mbg15779 ( 333) 948 98 3.8e-21 mKIAA0694 ( 1816 res) mbg08921 (1816) 295 42 0.0019 mFLJ00346 ( 1128 res) mph03762 (1128) 266 39 0.0076 >>mKIAA0209 ( 1567 res) mth00856 (1567 aa) initn: 2890 init1: 892 opt: 2643 Z-score: 1262.3 bits: 246.8 E(): 3.6e-65 Smith-Waterman score: 3355; 37.564% identity (40.014% ungapped) in 1552 aa overlap (302-1814:4-1499) 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 GEELEVIFSLFDSKENRPISERFFLRLNRNGLPKAPDKPERHCSLFVDLGSSELRKD-IY :.:: . . .:.:::...: .: :. mKIAA0 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:.. .. ..... ..::.. .:....:..::.::: ::.: ::::.:: . mKIAA0 AMSMVQNRVFLRAINKFAETMNQKFLEHTSFEFQLWNNYFHLAVAFITQDSLQLEQFTHA 730 740 750 760 770 780 1090 1100 1110 1120 1130 1140 mKIAA0 KKKKVLEKYGDMRVTMGCEIFSMWQNLGEHKLHFIPALIGPFLEVTLIPQPDLRNVMIPI : .:.:.:::::: .: : .:: .::..:. :::...::.::.::::. .::.. ::: mKIAA0 KYNKILNKYGDMRRLIGFSIRDMWYKLGQNKICFIPGMVGPILEMTLIPEAELRKATIPI 790 800 810 820 830 840 1150 1160 1170 1180 1190 1200 mKIAA0 FHDMMDWEQRRSGNFKQVEAKLIDKLDSLMSEGKGDETYRELFNSII-PLFGPYPSLLKK : ::: : .:.: ::. : ..: ::: . :.::: : .:..::. . .:.. :. mKIAA0 FFDMMLCEYQRTGAFKKFENEIILKLDHEVEGGRGDEQYMQLLESILMECTAEHPTIAKS 850 860 870 880 890 900 1210 1220 1230 1240 1250 1260 mKIAA0 IERETWRESGVSLIATVTRLMERLLDYRDCMKIGEVDGKKIGCTVSLLNFYKTELNKEEM .: .... : :.:.::::: : : ....:::.:::::: . :.::: mKIAA0 VE---------NFVSLVKGLLEKLLDYRGVMT-DESKDNRMSCTVNLLNFYKDN-NREEM 910 920 930 940 950 1270 1280 1290 1300 1310 mKIAA0 YIRYIHKLYDLHLKAQNFTEAAYTLLLYDELLEWSDRP-----LREFLTYPMQTEWQRKE ::::..:: :::: .:.:::::::::. ::.:::. 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.::::::::.. . :... .:.: :. mKIAA0 FASMWIERTSFLTAYKLPGILRWFEVVHMSQTTISPLENAIETMSTVNEKILMMINQYQS 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1560 1570 1580 1590 1600 1610 mKIAA0 RQMQNINPLTMCLNGVIDAAVNGGVSRYQEAFFVKDYILSHPEDGEKIARLRELMLEQAQ . ::::.: :::..: :: :: ..:..:::...: :::: .:...:..:. : mKIAA0 DESLPINPLSMLLNGIVDPAVMGGFAKYEKAFFTEEYSREHPEDQDKLSHLKDLIAWQIP 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1620 1630 1640 1650 1660 1670 mKIAA0 ILEFGLAVHEKFVPQDMRPLHKKLVDQFFVMK----SSFGIQEFPACIQASPVHFPNGSP .: :. .::: : ...::.: .. . : .: . .:..:.: : . mKIAA0 FLGAGIKIHEKRVSDNLRPFHDRMEECFKNLKMKVEKEYGVREMP--------DFEDR-- 1320 1330 1340 1350 1360 1680 1690 1700 1710 1720 1730 mKIAA0 RVCRNSAPASMSPDGTRVIPRRSPLSYPAVNRYSSSSLSSQASAEVSNITGQSESSDEVF :: : : :: : . : .: .. .:. : :.. :: .. . .. .: mKIAA0 RVGR---PRSM----LRSYRQMSVISLASM--HSDCSTPSKVPAESFDLESAPPKTPKVE 1370 1380 1390 1400 1410 1740 1750 1760 1770 1780 1790 mKIAA0 NMQPSPSTS--SLSSTHSASPNVTSSAPSSARASPLLSDKHKHSRENSCLSPRDRPCSAI . ::... .. .: . . ::. . . . :: .. ::.. .: . : mKIAA0 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