# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg02269.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1784.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1784, 1379 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7917272 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2004+/-0.000196; mu= 10.9155+/- 0.011 mean_var=112.3060+/-22.645, 0's: 33 Z-trim: 42 B-trim: 3065 in 1/66 Lambda= 0.121024 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|41945524|gb|AAH65125.1| BTB (POZ) domain contai (1565) 9098 1600.5 0 gi|109487792|ref|XP_220211.4| PREDICTED: similar t (1578) 6701 1182.0 0 gi|109489730|ref|XP_001079342.1| PREDICTED: simila (1775) 6701 1182.1 0 gi|148664800|gb|EDK97216.1| mCG126175 [Mus musculu ( 901) 6122 1080.7 0 gi|76652301|ref|XP_589654.2| PREDICTED: similar to (1828) 2695 482.6 1e-132 gi|148664801|gb|EDK97217.1| mCG126186 [Mus musculu ( 476) 2308 414.6 8.4e-113 gi|27503115|gb|AAH42798.1| Btbd12 protein [Mus mus ( 306) 2121 381.7 4e-103 gi|109127456|ref|XP_001094220.1| PREDICTED: simila (1838) 2040 368.2 2.8e-98 gi|73959308|ref|XP_536992.2| PREDICTED: similar to (1819) 1841 333.5 8e-88 gi|26334229|dbj|BAC30832.1| unnamed protein produc ( 260) 1608 292.1 3.3e-76 gi|26335431|dbj|BAC31416.1| unnamed protein produc ( 250) 1602 291.1 6.6e-76 gi|149042675|gb|EDL96312.1| rCG64292 [Rattus norve ( 300) 1448 264.2 9.4e-68 gi|114660647|ref|XP_001167578.1| PREDICTED: BTB (P (1475) 1382 253.3 9.2e-64 gi|114660645|ref|XP_510772.2| PREDICTED: BTB (POZ) (1834) 1382 253.4 1.1e-63 gi|119605752|gb|EAW85346.1| BTB (POZ) domain conta (1475) 1363 250.0 9.1e-63 gi|119605751|gb|EAW85345.1| BTB (POZ) domain conta (1522) 1363 250.0 9.3e-63 gi|119605753|gb|EAW85347.1| BTB (POZ) domain conta (1818) 1363 250.0 1.1e-62 gi|205371796|sp|Q8IY92.3|BTBDC_HUMAN RecName: Full (1834) 1363 250.0 1.1e-62 gi|194219284|ref|XP_001499328.2| PREDICTED: BTB (P (1824) 978 182.8 1.8e-42 gi|149042676|gb|EDL96313.1| rCG49827 [Rattus 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