FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0284.ptfa, 1629 aa vs ./tmplib.26680 library 1767388 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2667+/-0.0086; mu= -9.8655+/- 0.569 mean_var=407.6360+/-98.138, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0635 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0470 ( 803 res) mfj05195 ( 803) 438 55 6.4e-08 mKIAA4178 ( 1796 res) mtg01289 (1796) 275 41 0.0036 >>mKIAA0470 ( 803 res) mfj05195 (803 aa) initn: 780 init1: 339 opt: 438 Z-score: 234.5 bits: 55.3 E(): 6.4e-08 Smith-Waterman score: 1155; 35.026% identity (38.594% ungapped) in 768 aa overlap (884-1597:3-753) 860 870 880 890 900 mKIAA0 PKKSFVGPGEVDGPGRVVQTSPSARDGLYVSSNGRMVIQLRSGR-SPEPDP------APP .:.: ::: .: : . : : . mKIAA0 HSTSKGDRVIQNESKRRKAEEIPKCQASKGDK 10 20 30 910 920 930 940 950 mKIAA0 KETL-TFARQESFT-KEPTSGPPAPGKLPHI----SSHPLLQDLAAA-----RASRLDFH ::. ...:: ::: .:.:. : .::: :: : :..: :.. :: mKIAA0 KESSKSLVRQGSFTIDKPSSNIPIE-LIPHINKQNSSVPTALALTSASRLRERSDSLDTD 40 50 60 70 80 90 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA0 AQ-DTHLILKETETALAALEARLRSKSADECDGGSTPRPPED-SLSGDSDVDTASTISLL .. :: ::::.::...: :::.:: . .: .:: .: :.: .:::::::::::. mKIAA0 SSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNNKTDEGPDTPSYNRDNSISPESDVDTASTISLV 100 110 120 130 140 150 1020 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA0 SGKNGPSPTTPQTPGPQKESPLSPPTVPDPGGATPGSARERMSERQHRPTPADLGPGDTS .:.. . : . . . . :. . :: ::.. :.. . ::.: . mKIAA0 TGETERKSTQKRKSFTSLYKDRCSTSSPSKDVTKSGS-REKI-EKKAKSRSADIGARADG 160 170 180 190 200 1080 1090 1100 1110 1120 mKIAA0 RRAAMRRGHGSRGSLDWPEEERGSGLAH-----LPSSNHETPEATLAGRQGPRRKPAAPP :. .. :. . :.: .... :.. : . ::..:: :: : . mKIAA0 RKFVQSSGRIRQPSIDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKSHGRT-PLTSADEHN 210 220 230 240 250 260 1130 1140 1150 1160 1170 1180 mKIAA0 PSPAAREEQSRSSATAQKVQQALTRSNSLSTPRPTRASRLRRARLGDASDTEAVDGERGT . .. .: :. .. . ..:..: :::::.: :::::::.:::.: .:..... mKIAA0 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