FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
../query/mKIAA0581.ptfa, 962 aa
vs ./tmplib.26680 library
1768055 residues in 2168 sequences
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Lambda= 0.0701
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10 20 30
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. :::..:: :::.:::::.. : :::. ::.:::: :::::::::::::::::: :::
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:::::.:: :::::::: :::: :::: ::::::::::. ...:.::::: ::::::.:
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..::::::::: ::::::::::: :::::::..::.:::: .:.:::::.::: .:::::
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220 230 240 250
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::. :. : : : .:. ::.... :.::.. ::::: : ...:
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510 520 530 540 550 560
260 270
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:...:.. : :: . :::::.::.
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::::::.::::..::::.::: ..:::: ::::::::::..:::::::.:::::::.:::
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:::::::::::::::::::::.:::.:::::::.:: ::.: :..::::.::: ::::::
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::::: :::::: ::::::::.: ::.:::::::::::: :::::::::::::::: ..:
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.:::::. ::::.:::. : :::::.:: :::::.::::::.:::::::.::: ::::.:
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:::: :::: :::...: :..::.:: . : ::: :::..:.::.::::::::: :.:
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870 880 890 900 910 920
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... :. :: . : :. ..:. : .. . : : ... : :...:..
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.::: :.:.:: .:::...:..:::.... .....: :.:..:.. : ..
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1040
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10 20 30 40
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... .:.:.::. :. ..: .: .:: :.
mKIAA1 IESTSLGIFGVGILQLNDFLVNCQGEHCTYDEILSIIQKFEPSVSMCHQGLLSFEGFARF
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170 180 190 200 210 220
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560 570 580 590 600 610
230 240 250 260
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:.: . :: .... ... :.: . : : :.. : : ::.
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270 280
mKIAA0 -C----------------KK---SSMDEGTAGSEAMATE---------------EMSNLV
: :: :: ..: . . .. : :.:.::
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: : ::: .. :.:.. : : . : .:.:
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320 330 340
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: . ..: ...... .:: : ::
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.::.:::: : .:: : :.::::.:: :: ...: .:.: :: :: ::: . .
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410 420 430 440 450
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..:.:. . . :.. :. ::::: . :.. . .:::..:.:.:. . :.
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920 930 940 950 960
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. ::: .:. : ..:: ... . .:. ..... .:
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.. .. : .:::: .: ....: : . . :. .: : : . .:.
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1090 1100 1110 1120 1130 1140
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mKIAA0 HTASLAPKPPSQAPHSQPAPGSVKAPAKTEDLIQSVLTEVEAQTIEELKQQKSFVKLQKK
... : :. . : . . : : .. .. . ..: .... ::...
mKIAA1 PEEDIVQILNSWFPE-EGYVGRIVLKPQQETLEEKSIVFDDKEVILSSEEESFFVQVHDV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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.. . ..: . .:.. . ..: .:. ..: . ::. : ..:::
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1210 1220 1230 1240 1250 1260
730 740 750 760 770 780
mKIAA0 SSPDHGSSAIEQDLAALDAEMTQKLIDLKDKQQQQLLNLRQEQYYSEKYQKREHIKLL--
:.: .. . .. ...:. : . .:.:. :: . . .::. :..
mKIAA1 STPKSSQRILLDQECVFQAQSKWK------GAGKFILKLK-EQVQASREDKRRGISFASE
1270 1280 1290 1300 1310
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..::: ... .. :: . . ::.:
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1320 1330 1340 1350 1360
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10 20 30
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: : . . . .::. ...::.::::::::.:::::::..
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:::::.:: ..: :. .::::
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.. . .: : :... . . :.. .: : . .:.
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: .:..:: . ::.. .: . .:.::.: .
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: .. :: . .:...::: :::. . : ..:......:. :::::::.. :::::::
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:: ::::::::::::.:. .:.: . . :: :: :::. : . :.: .:
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. : . . :...::::: :.:. . .:::...::::: .. .:.. .
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:. ::.::: .:: : .: .: .:. .... : :::.: : ..: :::... :
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.. . ..::.. :.: . . ...: . .: . : : .
mKIAA0 EG-----MEEASIFVHVAVSDISGKVKQTLGLKGLFLRGTKPGSLDSHAAGQPLPRPSVS
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.. ... :. . :.:. ::. :. . .:.... .: .:.: .:: .:
mKIAA0 QRLLRRTAS-APTKSQKPSRKGFPELALGTQDAGSEGAADDVAPSSPNPALEAP-TQERS
930 940 950 960 970 980
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mKIAA0 GSV----KAPAKTEDLIQSVLTEVEAQTIEELKQQKSFVKLQKKHYKEMKDLVKRHHKKT
:: :::. : . .:..:.. . :
mKIAA0 GSSSPRGKAPGG-EATEERTLAQVRSPNAPEGPGPAGMAATCMKCVVGSCAGMDVEGLRR
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10 20 30 40
mKIAA0 RLNEILYPPLKQEQVQVLIEKYEPNSSLAKKGQMSVDGFMRYLSG
: ::. :: : . .. :..:::: :: .
mKIAA1 YSGEDRVLSASELLEFLEDQGEDGATLACAQQLIQTYELNETGEQHELMTLDGFMMYLLS
280 290 300 310 320 330
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mKIAA0 EENGVVSPEKLDLNEDMSQPLSHYFINSSHNTYLTAGQLAGNSSVEMYRQVLLSGCRCVE
:..... . . .::.:::.::::.:::::::: .:..:.::.: : ... .::::::
mKIAA1 PEGAALNVAHTCVFQDMGQPLAHYFISSSHNTYLTDSQIGGTSSTEAYIRAFAQGCRCVE
340 350 360 370 380 390
110 120 130 140 150 160
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::::.: .: ::: :: :.:..: :..::.:. . :: .::.:..::.::: .::
mKIAA1 LDCWEGPGGE--PVIYHGHTLTSKILFRDVIQAVRDHAFTSSPYPVILSLENHCGL-EQQ
400 410 420 430 440 450
170 180 190 200 210 220
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: ::.. : :.:: :. . :. . : : :::: ..: .::::.:: ::
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460 470 480 490 500
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mKIAA0 KKLSEQASNTYSDSSSVFEPSSPGAGEADTESDDDDDDDDCKKSSMDEGTAGSEA-MATE
:. .. ........ . ... . :.: . .
mKIAA1 -------------------------GRILSDREEEEEEEEEAEEALEAAEQRSRAKQISP
510 520 530
290 300 310 320 330 340
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