FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0581.ptfa, 962 aa vs ./tmplib.26680 library 1768055 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7084+/-0.00798; mu= 0.6958+/- 0.531 mean_var=334.6642+/-78.632, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0701 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4098 ( 1048 res) mpg00558 (1048) 1868 204 1.2e-52 mKIAA1516 ( 1364 res) mbg09342 (1364) 635 79 4.9e-15 mKIAA0450 ( 1592 res) mbg09026 (1592) 597 75 7.7e-14 mKIAA1964 ( 801 res) meh02207 ( 801) 571 72 3.1e-13 mKIAA1092 ( 889 res) mbg09321 ( 889) 556 71 9.5e-13 mKIAA1069 ( 1289 res) mfj10223 (1289) 500 65 6e-11 >>mKIAA4098 ( 1048 res) mpg00558 (1048 aa) initn: 2340 init1: 1084 opt: 1868 Z-score: 1037.6 bits: 203.5 E(): 1.2e-52 Smith-Waterman score: 2896; 60.512% identity (65.836% ungapped) in 742 aa overlap (1-690:293-1026) 10 20 30 mKIAA0 RLNEILYPPLKQEQVQVLIEKYEPNSSLAK ::::.:::::.. :...:::::: :... . mKIAA4 KILLEIGAKGKPYLTLEQLMDFINQKQRDPRLNEVLYPPLRSSQARLLIEKYETNKQFLE 270 280 290 300 310 320 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 KGQMSVDGFMRYLSGEENGVVSPEKLDLNEDMSQPLSHYFINSSHNTYLTAGQLAGNSSV . :::..:: :::.:::::.. : :::. ::.:::: :::::::::::::::::: ::: mKIAA4 RDQMSMEGFSRYLGGEENGILPLEALDLSMDMTQPLSAYFINSSHNTYLTAGQLAGPSSV 330 340 350 360 370 380 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 EMYRQVLLSGCRCVELDCWKGRTAEEEPVITHGFTMTTEISFKEVIEAIAECAFKTSPFP :::::.:: :::::::: :::: :::: ::::::::::. ...:.::::: ::::::.: mKIAA4 EMYRQALLWGCRCVELDVWKGRPPEEEPFITHGFTMTTEVPLRDVLEAIAEAAFKTSPYP 390 400 410 420 430 440 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 ILLSFENHVDSPKQQAKMAEYCRLIFGDALLMEPLEKYPLESGVPLPSPMDLMYKILVKN ..::::::::: ::::::::::: :::::::..::.:::: .:.:::::.::: .::::: mKIAA4 VILSFENHVDSAKQQAKMAEYCRSIFGDALLIDPLDKYPLSAGIPLPSPQDLMGRILVKN 450 460 470 480 490 500 220 230 240 250 mKIAA0 KKKSHKSSEG----SGKKKLSEQASNTYSDSSSVFEPSSPGAGEADTES----------- ::. :. : : : .:. ::.... :.::.. ::::: : ...: mKIAA4 KKR-HRPSTGVPDSSVRKRPLEQSNSALSESSAATEPSSPQLGSPSSDSCPGLSNGEEVG 510 520 530 540 550 560 260 270 mKIAA0 -------------------------------DDDDDDD-----DCKKSSMDEGTAGSEAM :...:.. : :: . :::::.::. mKIAA4 LEKTSLEPQKSLGEESLSREPNVPMPDRDREDEEEDEEEEETTDPKKPTTDEGTASSEVN 570 580 590 600 610 620 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 ATEEMSNLVNYIQPVKFESFEISKKRNKSFEMSSFVETKGLEQLTKSPVEFVEYNKMQLS ::::::.::::..::::.::: ..:::: ::::::::::..:::::::.:::::::.::: mKIAA4 ATEEMSTLVNYVEPVKFKSFEAARKRNKCFEMSSFVETKAMEQLTKSPMEFVEYNKQQLS 630 640 650 660 670 680 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 RIYPKGTRVDSSNYMPQLFWNAGCQMVALNFQTVDLAMQINMGMYEYNGKSGYRLKPEFM :::::::::::::::::::::.:::.:::::::.:: ::.: :..::::.::: :::::: mKIAA4 RIYPKGTRVDSSNYMPQLFWNVGCQLVALNFQTLDLPMQLNAGVFEYNGRSGYLLKPEFM 690 700 710 720 730 740 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 RRPDKHFDPFTEGIVDGIVANTLSVKIISGQFLSDKKVGTYVEVDMFGLPVDTRRKAFKT ::::: :::::: ::::::::.: ::.:::::::::::: :::::::::::::::: ..: mKIAA4 RRPDKSFDPFTEVIVDGIVANALRVKVISGQFLSDKKVGIYVEVDMFGLPVDTRRK-YRT 750 760 770 780 790 800 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 KTSQGNAVNPVWEEEPIVFKKVVLPSLACLRIAAYEEGGKFIGHRILPVQAIRPGYHYIC .:::::. ::::.:::. : :::::.:: :::::.::::::.:::::::.::: ::::.: mKIAA4 RTSQGNSFNPVWDEEPFDFPKVVLPTLASLRIAAFEEGGKFVGHRILPVSAIRSGYHYVC 810 820 830 840 850 860 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 LRNERNQPLTLPAVFVYIEVKDYVPDTYADVIEALSNPIRYVNLMEQRAKQLAALTLEDE :::: :::: :::...: :..::.:: . : ::: :::..:.::.::::::::: :.: mKIAA4 LRNEANQPLCLPALLIYTEASDYIPDDHQDYAEALINPIKHVSLMDQRAKQLAALIGESE 870 880 890 900 910 920 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 EEVKKEADPGETSSEAP-SETRTTPAENGVNHTASLAPKPPSQAPHSQPAPGSVKAPAKT ... :. :: . : :. ..:. : .. . : : ... : :...:.. mKIAA4 AQASTETYQ-ETPCQQPGSQLPSNPTPNPLDASPRWPPGPTTSSTSS-----SLSSPGQR 930 940 950 960 970 640 650 660 670 680 690 mKIAA0 EDLIQSVLTEVEAQTIEELKQQKSFVKLQKKHYKEMKDLVKRHHKKTTELIKEHTTKYNE .::: :.:.:: .:::...:..:::.... .....: :.:..:.. : .. mKIAA4 DDLIASILSEVTPTPLEELRSHKAMVKLRSRQDRDLRELHKKHQRKAVALTRRLLDGLAQ 980 990 1000 1010 1020 1030 700 710 720 730 740 750 mKIAA0 IQNDYLRRRAALEKSAKKDSKKKSEPSSPDHGSSAIEQDLAALDAEMTQKLIDLKDKQQQ mKIAA4 ARAEGKCRPSPSAL 1040 >>mKIAA1516 ( 1364 res) mbg09342 (1364 aa) initn: 760 init1: 244 opt: 635 Z-score: 362.4 bits: 79.0 E(): 4.9e-15 Smith-Waterman score: 934; 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