FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0453.ptfa, 1918 aa vs ./tmplib.26680 library 1767099 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.1779+/-0.00428; mu= 23.8222+/- 0.286 mean_var=88.6720+/-20.175, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1362 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA3021 ( 756 res) mbg12853 ( 756) 305 71 1.2e-12 mKIAA0986 ( 921 res) mbp09156 ( 921) 277 66 6.3e-11 mKIAA0532 ( 1603 res) mbg05668 (1603) 195 50 6.1e-06 >>mKIAA3021 ( 756 res) mbg12853 (756 aa) initn: 254 init1: 136 opt: 305 Z-score: 319.2 bits: 71.1 E(): 1.2e-12 Smith-Waterman score: 513; 26.371% identity (29.976% ungapped) in 474 aa overlap (1361-1784:282-748) 1340 1350 1360 1370 1380 mKIAA0 SSYEVEELPVTEQELQKLRNPDTHQELEVLVRLEGGVGVSLINKVPEELVFA-------- :.:... :.. .::: :. . mKIAA3 KQKWKPFSQKQIMSLEQAYSKRLASQDRGWVKLDSNFEVNF-DKVPMEMRLPIRCPIKRD 260 270 280 290 300 310 1390 1400 1410 1420 1430 1440 mKIAA0 SLTGINIHYTQLAASHMLELSIQDVQVDNQLIGTTQPFMLY-VTPLSNENEVIETGPAVQ :.::.... : .. :. . .:::::: :: : ... :.: .. : : .. mKIAA3 FLSGIQVEFKQSPHQRSLRARLYWLQVDNQLPGTMFPVVFHPVAPPKSIALDSEPKPFID 320 330 340 350 360 370 1450 1460 1470 1480 1490 mKIAA0 VNAV-KFPSKSALTNIYKHLMVTAQRFTVQIEEKLLLKLLSFFGYD---QAESE----VE :... .: : . . .:..:: :........ .: ..:.: .:: . .. mKIAA3 VSVITRFNEYSKVLQ-FKYFMVLIQEMALKVDQGFLGAVISLFTPTTDPEAERKRTKLIQ 380 390 400 410 420 1500 1510 1520 1530 1540 mKIAA0 KYDENIHEKTAEQGGTPTRY--YFENLKISIPQIKLSVFT------SNKLPLDLKALKS- . . .. . :.. : .::...:: ...::. :.: .. :..: mKIAA3 QDIDALNTELMESSMTDMSILSFFEHFHISPVKLHLSLSLGSGGEESDKEKQEMIAIHSV 430 440 450 460 470 480 1550 1560 1570 1580 1590 mKIAA0 -----TLGFPLIRFEDAVINLDPFTRVHPYETKEFIINDILKHFQEELLSQAARILGSVD ..: : .: ...: . . . .. .. ....:..:..:.: .. ..: mKIAA3 NLLLKSIGATLTDVDDLIFKLAYYEIRYQFYKRDQLMWSVVRHYSEQFLKQMYVLVLGLD 490 500 510 520 530 540 1600 1610 1620 1630 1640 mKIAA0 FLGNPMGLLNDVSEGVTGLIK---YGNVGG--------------LIRNVTHGVSNSAAKF ::::.::. .:::: .:. : : : :. ... :... .... mKIAA3 VLGNPFGLIRGLSEGVEALFYEPFQGAVQGPEEFAEGLVIGVRSLVGHTVGGAAGVVSRI 550 560 570 580 590 600 1650 1660 1670 1680 1690 1700 mKIAA0 AGTLSDGLGK-TMDNRHQSER-EYIRYHAATSGEHLVAGIHGLAHGIIGGLTSVITSTVE .:... ::. :::...:..: : . . :. :. : .:. .:..::.:..::. :: mKIAA3 TGSVGKGLAAITMDKEYQQKRREEMGRQPKDFGDSLARGGKGFLRGVVGGVTGIITKPVE 610 620 630 640 650 660 1710 1720 1730 1740 1750 1760 mKIAA0 GVKTEGGVSGFISGLGKGLVGTVTKPVAGALDFASETAQAVRDTATLSGPRTQAQRVRKP :.: ::. .::..:.::::::.:..:..: .:.:: : :... .: . ... .: : mKIAA3 GAKKEGA-AGFFKGIGKGLVGAVARPTGGIIDMASSTFQGIQRVAEST---EEVSSLRPP 670 680 690 700 710 720 1770 1780 1790 1800 1810 1820 mKIAA0 RCCTGPQGLLPRYSESQAEGQEQLFKLTDNIQDEFFIAVENIDSYCVLISSKAVYFLKSG : .:.. :.....::.. : mKIAA3 RL-IHEDGIIRPYDRQESEGSDLLEQEMGTQE 730 740 750 >>mKIAA0986 ( 921 res) mbp09156 (921 aa) initn: 315 init1: 131 opt: 277 Z-score: 288.6 bits: 65.7 E(): 6.3e-11 Smith-Waterman score: 443; 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