FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1479.ptfa, 1009 aa vs ./tmplib.26680 library 1768008 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2298+/-0.00645; mu= -5.5084+/- 0.425 mean_var=260.3465+/-63.400, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0795 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1869 ( 774 res) mph01643 ( 774) 1677 206 1.3e-53 mKIAA4055 ( 794 res) mfj06069 ( 794) 938 122 4.4e-28 mKIAA4225 ( 868 res) mfj58259 ( 868) 846 111 7e-25 mKIAA0331 ( 574 res) mph02015 ( 574) 790 104 4.4e-23 mKIAA1739 ( 755 res) mtj00724 ( 755) 635 87 1.2e-17 mKIAA1745 ( 871 res) mid29072 ( 871) 574 80 1.7e-15 mKIAA1619 ( 240 res) mpg02927 ( 240) 236 41 0.00031 >>mKIAA1869 ( 774 res) mph01643 (774 aa) initn: 1690 init1: 1199 opt: 1677 Z-score: 1054.7 bits: 206.3 E(): 1.3e-53 Smith-Waterman score: 1839; 40.771% identity (47.226% ungapped) in 856 aa overlap (165-993:1-766) 140 150 160 170 180 190 mKIAA1 VFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLRTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFADGKL . .:::.:: ::::::: :..::.::.:.: mKIAA1 QQEGEELSGQARCPFDATQSTVAIFAEGSL 10 20 30 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 YSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREIAVE ::::.::: :::::.:::.: ::. ::::::..::::..:.:.:..:::::::..:: mKIAA1 YSATAADFQASDAVVYRSLGPQPPLRSAKYDSKWLREPHFVYALEHGEHVYFFFREVSVE 40 50 60 70 80 90 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 HNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSITDI ::.. .:::::.:: ::::: :.:..::::::: :::::::::: ::::::::.: mKIAA1 DARLGRVQFSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTSFLKLRLNCSVPGDSTFYFDVLQSLTGP 100 110 120 130 140 150 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 IQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPEDKVP ....: .. :::::: ::::::::::: .::::. :.:.::::.. :..:: : ::::: mKIAA1 VNLHGRSALFGVFTTQTNSIPGSAVCAFYLDDIERGFEGKFKEQRSLDGAWTPVSEDKVP 160 170 180 190 200 210 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 KPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDDTLAFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYRLTA .:::: :: : : ....: :.:::.: :::.:::.: :::: . .: .: : : :: mKIAA1 SPRPGSCAGVGAAASFSSSQDLPDDVLLFIKAHPLLDPAVPPATHQPLLTLTS-RALLTQ 220 230 240 250 260 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 IEVDRSAGPYQNYTVIFVGSEAGVVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNPAKCSAES-- . :: :::..: ::.:.::. :.::::: . .. ..::::.::. :.::.. mKIAA1 VAVDGMAGPHRNTTVLFLGSNDGTVLKVLPPGGQSLGSEPIVLEEIDAYSHARCSGKRSP 270 280 290 300 310 320 500 510 520 530 540 550 mKIAA1 EEDRKVVSLQLDKDHHALYVAFSSCVVRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGVC . :....:.:: . : :.::: .:.: . :::: :.:.:..::.:: :::::: . : mKIAA1 RAARRIIGLELDTEGHRLFVAFPGCIVYLSLSRCARHGACQRSCLASLDPYCGWHRSRGC 330 340 350 360 370 380 560 570 580 590 mKIAA1 ERVTLGMLPGGYEQDTEYGN---TAHLGDC---------------HGVRWEVQSGESNQM . : ::: . : :: : : ::: .::: ... . ... mKIAA1 MSIR-G--PGGTDVDLT-GNQESTEH-GDCQDGATGSQSGPGDSAYGVRRDLSPASASRS 390 400 410 420 430 440 600 610 620 630 640 650 mKIAA1 VHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAES-AQSCTDSSGSFAKL . . .:..:: :::.::: ..:. : : : ::. :: :. . : :.:.: mKIAA1 IPIPLLLACVAAAFALGASVSGLLVSC---ACRRANRRRSKDIETPGLPRPLSLRSLARL 450 460 470 480 490 500 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 NGLFDSPVKEYQQN--IDSPKLYSNLLTSRKELPPNTDTKSMAVDHRGQPPELAALPTPE .: : ... ..:.::...: ::. :.::::: ::::: mKIAA1 HGGGPEPPPPPKDGDAAQTPQLYTTFLP-----PPDG----------GSPPELACLPTPE 510 520 530 540 720 730 740 750 760 770 mKIAA1 STPVLHQKTLQAMKSHSEKAHSHGASRKEHPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATH .:: : : :.: . : ...: . .: : . :: . : : ..: : mKIAA1 TTPELPVKHLRASGGPWEW-NQNGNNASEGP----GRPPRGCSGAGGPAPRVLVRP---- 550 560 570 580 590 780 790 800 810 820 830 mKIAA1 DYNTSFSNSNAHKAEKKLQSMDHPLTKSSSKREHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKA : .. .:. .::..::..:. :. :. mKIAA1 -----------------------PPPGCPGQ-----AVEV-TTLEELLRYLHGPQP-PRK 600 610 620 840 850 860 870 880 890 mKIAA1 ILGEIHMAHQTLMLDPVGPMAEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNS-PTKRVDVPTTPGVP : .: . : : .: :. :::. : .::.. : :.::: : mKIAA1 --GSEPLASAPFTSRP--PASE-----PG--ASLFVDSSPMPRDGVPPLRLDVP--P--- 630 640 650 660 670 900 910 920 930 940 mKIAA1 MTSLERQRGYHKNSSQRHSISAVPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMP-TPTGAKVDYIQ .: . : : ..:: :. .. : : . .:.:. . : . mKIAA1 -------EGKRAAPSGRPALSAPAPRLGVGGSRRLPFPTHRAPPGLLTRVPSGGPARY-S 680 690 700 710 720 950 960 970 980 990 1000 mKIAA1 GTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDV--PPKPSFVPQTTSVRPLNKY : : . :: :.: .. . .: :. .: : :: . ::.:. mKIAA1 GGP-GRHLL-YLGRPEGHRGR-SLKRVDVKSPLSPKPPLASPPQPAPHGGHFNF 730 740 750 760 770 mKIAA1 TY >>mKIAA4055 ( 794 res) mfj06069 (794 aa) initn: 653 init1: 217 opt: 938 Z-score: 596.6 bits: 121.6 E(): 4.4e-28 Smith-Waterman score: 1110; 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