# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg01921.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0637.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0637, 1165 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7919990 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5239+/-0.00019; mu= 13.1280+/- 0.011 mean_var=85.1825+/-16.642, 0's: 40 Z-trim: 42 B-trim: 434 in 1/65 Lambda= 0.138963 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|30353907|gb|AAH52174.1| Zinc finger, BED domain (1168) 7731 1560.7 0 gi|149234328|ref|XP_001480230.1| PREDICTED: simila (1169) 7702 1554.9 0 gi|198278471|ref|NP_001128272.1| zinc finger, BED- (1170) 7365 1487.3 0 gi|109094591|ref|XP_001111467.1| PREDICTED: zinc f (1171) 6446 1303.1 0 gi|6572299|emb|CAB62924.1| zinc finger, BED-type c (1171) 6433 1300.5 0 gi|20532299|sp|O75132.1|ZBED4_HUMAN RecName: Full= (1171) 6432 1300.3 0 gi|108742046|gb|AAI17671.1| Zinc finger, BED-type (1171) 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