FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0594.ptfa, 773 aa vs ./tmplib.26680 library 1768244 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8968+/-0.00643; mu= 5.7492+/- 0.427 mean_var=226.6327+/-54.007, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 42 in 1/35 Lambda= 0.0852 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4151 ( 1916 res) mpf01376 (1916) 228 42 0.00062 mKIAA4103 ( 978 res) mfj45234 ( 978) 220 41 0.00082 >>mKIAA4151 ( 1916 res) mpf01376 (1916 aa) initn: 147 init1: 71 opt: 228 Z-score: 163.0 bits: 42.2 E(): 0.00062 Smith-Waterman score: 248; 21.633% identity (24.754% ungapped) in 698 aa overlap (19-695:246-876) 10 20 30 40 mKIAA0 EKSTDIKEASQKCKQRQDLIERKDRQIKELQQALTVKQNEELDRQKRI : : :.. ..::... . :. : . :.. mKIAA4 DKLIAEMDRFLLENQSLSGSCESLKLALGGLTEDKEKLMEELESVRSSKMAESTEWQEKH 220 230 240 250 260 270 50 60 70 80 90 100 mKIAA0 SNTRKMIEDLQSELKTAENCENLQPQIDTVTNDLRRVQEEKALCEGEIIDKQREKEMLEK .. .: : : :.. :: : .:. :....: ::.. :. : : : .. mKIAA4 KELQKEYEVL---LQSYENVSNEAERIQHVVESVR--QEKQ-----ELYAKLRSTESDKR 280 290 300 310 320 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 QRRSVSDHITRFDNLMNQKEDKLRQRYRDTYDAVLWLRNNRDRFKQRVCEPIMLTINMKD .:.. .. .. :.. ..:.:. .. . .: :... ::.. .. .:. : mKIAA4 EREK---QLQDAEQEMEEMKEKMRKFAKSKQQKILELEEENDRLRAEA-QPVGGT----- 330 340 350 360 370 170 180 190 200 210 220 mKIAA0 NKNAKYVENHISSNDLRAFVFESQEDMEIFLREVRDNKKLRVNAVIAPKISYADKAPSRS .. .: .:::. .:..: . : . .: . .:..: : . .... . . mKIAA4 ---GESMEALLSSNS------SLKEELEKITLEHKTLSK-EFEALMAEKDALSEETRNLK 380 390 400 410 420 230 240 250 260 270 280 mKIAA0 L----NDLKQYGFFSYLRELFDAPDPVMSYLCCQYHIHEVPVGTERTRERIERVIQETRL : . ::: .. . : : : :. .. .. :: . :. . . mKIAA4 LQVEAQVLKQASLEA--TEKSDEPKDVIE------EVTQAVVGKSQERDALSDSAKLEDS 430 440 450 460 470 290 300 310 320 330 340 mKIAA0 KQIYTAEEKYVLKTSVYSNKVISSNTSLKVAQFLTVTVDLEQRRHLEEQLKEMNRQL-EA . : .. : .: ....::. ..: ..: .:. : :. :. .:.: .: mKIAA4 EAILMGDGA---KPGV--SETFSSHDDIK--NYLQQLDQLKGRIAELEMEKQKDRELSQA 480 490 500 510 520 530 350 360 370 380 390 400 mKIAA0 VDSGLAALRDTNRHLELKDNELRLKKKELLERKTRKRQLEQKIS--SKLASIRLMEQDTC ... :: .. ::.::.: ..:. .: : ..:..... .:: :.: mKIAA4 LENEKNALLT---QISAKDSELKLLEEEVTKRTTLNQQIQEELCRVTKLKETAEEEKD-- 540 550 560 570 580 410 420 430 440 450 mKIAA0 NLEEE------ERKAST-----KIKEINVQKAKLVTELTGLVKICTSFQIQKVDLILQNT .:::. : ..: . . .... .: .:. .: . . .. .: .:. ..: mKIAA4 DLEERLMNQLAELNGSIGNYYQDVTDAQIKNEQLESEMRNLQRCVSELEEEKQQLVKEKT 590 600 610 620 630 640 460 470 480 490 500 mKIAA0 TVISEKNKLEADYMASSSQLRVTEQQFIELDDNRQRLLQKCKELMKKA-RQVCNLSADQA : :: : . . .... ..... ::.. .. :. :.:.: : . .:: . mKIAA4 KVESEIRKEYMEKIQGAQKGPANKSHAKELQELLREKQQEVKQLQKDCIRYLERISALEK 650 660 670 680 690 700 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 VPQEFQTVSIKISNSSPPMAFQDLPNTLDEIDALLTEERSRASCFTGLNPSVVEEYSKRE . . .. : . . .:: : .. : .:.:..:. . .... ... mKIAA4 TVKALEFVHTESQ--------KDLDVTKGNL-AQAVEHRKKAQAELSSFKILLDDTQSEA 710 720 730 740 750 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 VEIQQLTEELQGKKVELDEYRENI-SQVKERWLNPLKELVEKINEKFSNFFSSMQCAGEV ... :...:. :: ::. .:.: ::.:.. . :..: :. .:: . ..:: .. mKIAA4 ARV--LADNLKLKK-ELQSNKESIKSQIKQKDEDLLRRL-EQAEEKHRKEKKNMQEKLDA 760 770 780 790 800 810 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 DLHTENEEDYDKYGIRIRVKF-RSSTQLHELTPHHQSGGERSVSTMLYLMALQELNRCPF :: :. . .. .:.:.. :.. ...:: .: . .. . .::. .: mKIAA4 -LHREKAH-VEETLAEIQVSLTRKDQEMKELQGSLDSTLAQLAAFTKSMSSLQD-DRD-- 820 830 840 850 860 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 RVVDEINQGMDPINERRVFEMVVNTACKENTSQYFFITPKLLQNLPYSEKMTVLFVYNGP ::.:: .. mKIAA4 RVIDEAKKWERRFGDAIQTKEEEVRLKEENCIALKDQLRQMAIHMEELKITVSRLEHDKE 870 880 890 900 910 920 >>mKIAA4103 ( 978 res) mfj45234 (978 aa) initn: 269 init1: 191 opt: 220 Z-score: 160.8 bits: 40.9 E(): 0.00082 Smith-Waterman score: 373; 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