# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg01823.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0336.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0336, 1693 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7893753 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6779+/-0.000207; mu= 7.8923+/- 0.011 mean_var=164.8816+/-32.086, 0's: 31 Z-trim: 170 B-trim: 0 in 0/68 Lambda= 0.099882 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|32469711|sp|Q8CHG3.2|GCC2_MOUSE RecName: Full=G (1679) 10424 1516.1 0 gi|148710183|gb|EDL42129.1| GRIP and coiled-coil d (1680) 10407 1513.6 0 gi|149038803|gb|EDL93092.1| LIM and senescent cell (1679) 9696 1411.2 0 gi|31563507|ref|NP_852118.1| GRIP and coiled-coil (1684) 8146 1187.8 0 gi|73969994|ref|XP_531770.2| PREDICTED: similar to (1814) 7999 1166.7 0 gi|119574267|gb|EAW53882.1| GRIP and coiled-coil d (1583) 7678 1120.4 0 gi|158931162|sp|Q8IWJ2.3|GCC2_HUMAN RecName: Full= 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