FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1775.ptfa, 918 aa vs ./tmplib.26680 library 1768099 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7087+/-0.00534; mu= 2.0549+/- 0.352 mean_var=179.1854+/-43.632, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0958 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1400 ( 1098 res) mbh01141 (1098) 348 61 8.6e-10 mKIAA1621 ( 810 res) mbg08078 ( 810) 315 56 1.6e-08 mKIAA0327 ( 933 res) mfj34062 ( 933) 305 55 4.7e-08 mKIAA1313 ( 969 res) mbh01521 ( 969) 302 55 6.5e-08 mKIAA1562 ( 1135 res) mfj24085 (1135) 267 50 2.1e-06 mKIAA0345 ( 962 res) mbg19517 ( 962) 264 49 2.4e-06 mKIAA0811 ( 1654 res) mbg07446 (1654) 243 47 2.7e-05 >>mKIAA1400 ( 1098 res) mbh01141 (1098 aa) initn: 184 init1: 184 opt: 348 Z-score: 268.1 bits: 61.1 E(): 8.6e-10 Smith-Waterman score: 534; 26.250% identity (30.000% ungapped) in 640 aa overlap (149-738:129-738) 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 NGTDPEGDPISYHISFDPSTRSVFSVDPNFGNITLVEELDRER--EDEIEAIISISDGLN : . . :..:::. .. .. . :. mKIAA1 LGLDITKLSARRFQTVANSRTPYLDLNLETGVLYVNEKIDREQICKQSPSCVLHLEVFLE 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 --LVAEKVVILVTDANDEAPRFIQEPYIIRVPENIPAGSSIFKVQAEDKDTGSGGSVTYS : .: : : : ::. : : . ... :. :. . .: : :.:... : mKIAA1 NPLELFRVEIEVLDINDNPPSFPEPDLTVEISESATPGTRFPLESAFDPDVGTNSLRDYE 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 mKIAA1 LQNLHSSKFSMDRHS-G----VLRLQAGATLDYEKSRAHYITVIAKDGGGRLRGAD---- . .: ::.: .. : .: :: :.. .: .. : :::: :.. mKIAA1 ITP--NSYFSLDVQTQGDGNRFAELVLEKPLDREQQAVHRYVLTAVDGGGGGGGGEGGGG 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 mKIAA1 ---------MVFSATTTVTINVEDVQDTAPIFVGTPYYGYVYEDTLPGSEVLTVVAIDGD . ..:. .:: : : .:..: : : . :.. ::. :. . : : : mKIAA1 GGGAGLPPQQQRTGTALLTIRVLDSNDNVPAFDQPVYTVSLPENSPPGTLVIQLNATDPD 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 RGKPNHILYRLLNE----SDGIFEINETSGAISVLQSPALLRREVYELHVQVTEVNSPGS .:. ....: . .. . .: .. .: . : . ::...::. .. : mKIAA1 EGQNGEVVYSFSSHISPRARELFGLSPRTGRLEVSGELDYEESPVYQVYVQAKDL---GP 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 PAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQNKFELSMFEHPPQGEILRGLKITVNDSDQG :. : : .:..: :.. : . : : .: : : .. ...: ::.. mKIAA1 NAVPAHCKVLVRVLDANDNAPEI---SFSTVKEAVSEGAAP--GTVVALFSVTDRDSEE- 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 ANAKFNLRLVGPGGIFRVVPQTVLNEAQVTIIVENSAAIDFEKSKLLTFKLLAIEVNTPE :.. . .:.: ::. . . ::..: : .: : . :. ..: . . : mKIAA1 -NGQVQCELLGDVP-FRLKSSF---KNYYTIVTE--APLDREAGDSYTLTVVARDRGEPA 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 KFSSTADIVIQLLDTNDNVPKFTSHYYIARIPENAPGGSNVVAVTAVDPDTGPWGKVHYS .:.. .: .:. :.:::.:.:.. : . . :: :. . ::.:.: : : .:. :: mKIAA1 -LSTSKSIQVQVSDVNDNAPRFSQPVYDVYVTENNVPGAYIYAVSATDRDEGANAKLTYS 510 520 530 540 550 580 590 600 610 620 mKIAA1 IYGT---GSDLFL---IHPSTGLIYTQPWASLDAEGTSRYNFYVKAEDMDGRYSLA---E : : ..: :. ..: .:. :.: : . ..: :.:.: . .:: mKIAA1 ILECQIQGMSVFTYVSINSDNGYLYAL--RSFDYEQIKDFSFQVEARDAGSPQALAGNAT 560 570 580 590 600 610 630 640 650 660 mKIAA1 VFVTLLDVNDHYPQFSVQEKTMVLGTP---------------LKIEATDQDAEEPNNLVD : . ..: ::. : . : ::: .. :.: : : : . mKIAA1 VNILIVDQNDNAPAI-VAPLPGRNGTPAREVLPRSAEPGYLLTRVAAVDADDGE-NARLT 620 630 640 650 660 670 670 680 690 700 710 720 mKIAA1 YSITRAEPVNVFDIDAHTGEIRLKNSIRSLEALHNITPSGDYSWSLQVQAKDRGSPSFST :::.:.. .:.: .: .:::.: . : . : .. :. : : ....:.:.: .:. mKIAA1 YSIVRGNEMNLFRLDWRTGELR---TARRVPAKRD--PQRPYE--LVIEVRDHGQPPLSS 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 mKIAA1 TALLKIDITDTERLSRGSMAAFLIQTKDNPMKAVGVLAGVMAIVVAITVLISTATFWRNK :: : ....: mKIAA1 TATLVVQLVDGAVEPQGGGGDRGGGSGEHLRPSRSGGGETSLDLTLILIIALGSVSFIFL 730 740 750 760 770 780 >>mKIAA1621 ( 810 res) mbg08078 (810 aa) initn: 400 init1: 197 opt: 315 Z-score: 245.2 bits: 56.5 E(): 1.6e-08 Smith-Waterman score: 496; 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