FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0695.ptfa, 738 aa vs ./tmplib.26680 library 1768279 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8537+/-0.00478; mu= 16.0319+/- 0.319 mean_var=112.1363+/-26.000, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 25 in 1/35 Lambda= 0.1211 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0617 ( 792 res) mpm06204 ( 792) 682 131 5.7e-31 mKIAA4106 ( 748 res) mid05034 ( 748) 441 89 2.6e-18 mKIAA4122 ( 790 res) mbg19439a ( 790) 347 72 2.4e-13 mKIAA1406 ( 838 res) mph00927 ( 838) 153 38 0.004 >>mKIAA0617 ( 792 res) mpm06204 (792 aa) initn: 1230 init1: 262 opt: 682 Z-score: 648.3 bits: 130.7 E(): 5.7e-31 Smith-Waterman score: 1506; 35.390% identity (39.577% ungapped) in 794 aa overlap (19-738:9-792) 10 20 30 40 50 mKIAA0 ATSQQEQQQQLKTKSILISSVASVHHANGLAKSS-TAVSSFANSKPGSAKKLVIKNFKDK ...:.: : : . :. . .:. ..:. . :. :. : mKIAA0 HRRLRVRAAAAAAVSAAAGEGPSTMSNLSKGTGSRKDT--KMRIRAF--- 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 mKIAA0 P-KLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSHKISANLYKQLRQIC : . :.:.. :. ::.:.. :: ... ..::::. . .. :: . .:: ::.. mKIAA0 PMTMDEKYVNSIWDLLKNAIQEIQRKNNSGLSFEELYRNAYTMVLHKHGEKLYTGLREVV 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 mKIAA0 EDHIKAQIHQFREDSLDSVL--FLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLP .:. :.. ::: :.:. ::. ... :..: :.:::.:....::.:: ::.. mKIAA0 TEHL---INKVREDVLNSLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMVMIRDILMYMDRVYVQQNNV-E 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 SIWDMGLELFRAHIISDQKVQTKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSMLSDL---- .....:: .:: ... .. . . .: .: :::.::..::. .:. .:: : mKIAA0 NVYNLGLIIFRDQVVRYGCIRDHLRQTLLDMIARERKGEVVDRGAIRNACQMLMILGLEG 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 -QIYQDSFEQQFLQETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTTQ ..:...:: ::. . ... :.::.. : . :...:. :..:: .:.. ::..:. mKIAA0 RSVYEEDFEAPFLEMSAEFFQMESQKFLAENSASVYIKKVEARINEEIERVMHCLDKSTE 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 mKIAA0 KSLIASVEKQLLGEHLTAILQ---KGLNSLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQW . .. ::..:...:. .:.. .:: .: ... .::. .:.::::: .:.... . mKIAA0 EPIVKVVERELISKHMKTIVEMENSGLVHMLKNGKTEDLACMYKLFSRVPNGLKTMCECM 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 mKIAA0 IEYIKAFGSTIVINPEKDKT---MVQELLDFKDKVDHIIDTCFLKNEKFINAMKEAFETF :.. :...: . . :. ..: :::.:.. :.... : ... : ... :: : mKIAA0 SCYLREQGKALVSEEGEGKNPVDYIQGLLDLKSRFDRFLQESFNNDRLFKQTIAGDFEYF 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 mKIAA0 INKRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDL .: .: : .. ..:.::. : : :..:.: .::: :..:::. ::::: .::. : mKIAA0 LNLNSRSP-EYLSLFIDDKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVLFRFMQEKDVFERYYKQHL 410 420 430 440 450 460 470 480 490 mKIAA0 AKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLK-----------------------------HYMQNQNV :.:::..::.: :.::.:.:::: ...: .: mKIAA0 ARRLLTNKSVSDDSEKNMISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMSISNTTMDEFRQHLQATGV 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 mKIAA0 P-GNIELTVNILTMGYWPTY-VPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGH :...::: .:: ::::: . . ..:: . :::. :::.:::::.: : .: mKIAA0 SLGGVDLTVRVLTTGYWPTQSATPKCNIPPAPRHAFEIFRRFYLAKHSGRQLTLQHHMGS 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 mKIAA0 CVLKAEF-----KEGKKE-----------------LQVSLFQTMVLLMFNEGEEFSLEEI :.: : :: .: :::: :: .:..::. :....::: mKIAA0 ADLNATFYGPVKKEDGSEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQMTILMLFNNREKYTFEEI 590 600 610 620 630 640 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 KHATGIEDGELRRTLQSLACGKA--RVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQ .. : : . :: :.:::::::: :::.:.::.:.::.: : ::.: :: :.::. mKIAA0 QQETDIPERELVRALQSLACGKPTQRVLTKEPKSKEIESGHIFTVNDQFTSKLHRVKIQT 650 660 670 680 690 700 660 670 680 690 700 mKIAA0 IQMK--ETVEEQASTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLK--FPV . : :. :. : ..: .::...:.:::::::: :: ..::.::.:: .::: : mKIAA0 VAAKQGESDPERKETRQKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQHNVLVAEVTQQLKARFLP 710 720 730 740 750 760 710 720 730 mKIAA0 KPADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQSNYIA .:. .:::::.::.:.:. : :. . .:.: mKIAA0 SPVVIKKRIEGLIEREYLARTPEDRKVYTYVA 770 780 790 >>mKIAA4106 ( 748 res) mid05034 (748 aa) initn: 703 init1: 219 opt: 441 Z-score: 421.0 bits: 88.6 E(): 2.6e-18 Smith-Waterman score: 900; 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