# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg01518.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1606.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1606, 2063 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7913143 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3974+/-0.000202; mu= 11.7284+/- 0.011 mean_var=128.1505+/-24.328, 0's: 39 Z-trim: 61 B-trim: 95 in 1/65 Lambda= 0.113296 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|84029265|sp|Q9DB00.2|GON4L_MOUSE RecName: Full= (2260) 13625 2240.0 0 gi|80474411|gb|AAI08378.1| 5830417I10Rik protein [ (2036) 13387 2201.1 0 gi|81909086|sp|Q535K8.1|GON4L_RAT RecName: Full=GO (2256) 12358 2032.9 0 gi|139001696|dbj|BAF51558.1| YY1AP-related protein (2256) 12325 2027.5 0 gi|57340270|gb|AAW50123.1| GON4L isoform B [Rattus (1820) 9873 1626.7 0 gi|109730409|gb|AAI15704.1| Gon-4-like (C. elegans (1529) 5662 938.3 0 gi|55662211|emb|CAH69947.1| gon-4-like (C. elegans 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