FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0320.ptfa, 1471 aa vs ./tmplib.26680 library 1767546 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2609+/-0.00466; mu= 9.6826+/- 0.311 mean_var=109.0753+/-25.168, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1228 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1027 ( 2564 res) mia05043 (2564) 6543 1171 0 mKIAA4173 ( 381 res) mid20040 ( 381) 369 77 8.1e-15 mKIAA4113 ( 618 res) mpf00134 ( 618) 297 64 8.1e-11 mKIAA0655 ( 1083 res) mfj00059 (1083) 298 65 1.1e-10 >>mKIAA1027 ( 2564 res) mia05043 (2564 aa) initn: 3708 init1: 3285 opt: 6543 Z-score: 6258.6 bits: 1171.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 6889; 73.759% identity (74.622% ungapped) in 1471 aa overlap (1-1469:1108-2563) 10 20 30 mKIAA0 EKCAQDLGSTSKGVGSSMAQLLTCAAQGNE :::.::::...:.:.:..:.:: ::::: mKIAA1 SVVQNLEKDLQEIKAAARDGKLKPLPGETMEKCTQDLGNSTKAVSSAIAKLLGEIAQGNE 1080 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