FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0559.ptfa, 1592 aa vs ./tmplib.26680 library 1767425 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7590+/-0.00834; mu= -1.3212+/- 0.554 mean_var=426.0364+/-101.382, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0621 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0434 ( 1170 res) mbf01942 (1170) 754 83 3.7e-16 >>mKIAA0434 ( 1170 res) mbf01942 (1170 aa) initn: 1079 init1: 341 opt: 754 Z-score: 382.5 bits: 83.2 E(): 3.7e-16 Smith-Waterman score: 1337; 31.974% identity (36.392% ungapped) in 1079 aa overlap (311-1340:80-1076) 290 300 310 320 330 340 mKIAA0 EDQDEWDMPSRSRRKARTGKYGDSTAEGDKTKPPSKVSSVAVQTVAEISVQTEPLGTIRT .. : : .: . :. .: . : : . mKIAA0 ALGRFEKKKPDPLEIGYQAHLPPESLSQLVSRQPPKSPQVLYSPVSPLSPHRL-LDTSFA 50 60 70 80 90 100 350 360 370 380 390 mKIAA0 PSIRARVDAKAKGSQTTSGTQKKVKRTLPNPPPEEASTGTQSTY-STMGTAS--RRRMCR : :.. .. .: .:::::::.:::::: . : . .:: .: . mKIAA0 SS--ERLNKAHVSALPPNGLVRKVKRTLPSPPPEEAHLPLAGQVPSQLYAASLLQRGLAG 110 120 130 140 150 160 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 TNTM--ARAKILQDIDRELDLVERESAKLRKKQAELDEEEKEIDAKLRYLEMGINRRKEA .:. ..:..:...::.: :::.::.::::::::::::::::::::.:::.::..:::. mKIAA0 PTTVPATKASLLRELDRDLRLVEHESTKLRKKQAELDEEEKEIDAKLKYLELGITQRKES 170 180 190 200 210 220 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 LLKEREKRERAYLQGVAEDRDYMSDSEVSSTRPSRVESQHG--IERPRTA--PQTEFSQF : :.: :. :.:..: :::.::::... : . . : .. : .: : : . mKIAA0 LAKDRGGRDYPPLRGLGEHRDYLSDSELNQLRLQGCTTPAGQYVDYPASAAVPATPSG-- 230 240 250 260 270 280 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 IPPQTQTEAQLVPPTSPYTQYQYSSPALPTQAPTPYTQQSHFQQQTLYHQQVSPYQT-QP : : ::..: :: .: . ::: : : . . : . : : : mKIAA0 -PTAFQQPR--FPPAAP--QYTAGSSG-PTQNGFPAHQAPTYTGPSTYPAPTYPPGTGYP 290 300 310 320 330 580 590 600 610 620 mKIAA0 TFQAVATM-SFTPQAQ-PTPTPQPSYQ---LPSQM--MVIQQKPRQTTLY-LEPKITSTY . .. .. .: : .. .:::.:. : .: : . .::::::.: :: :. ..: mKIAA0 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