FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0257.ptfa, 1749 aa vs ./tmplib.26680 library 1767268 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9987+/-0.00805; mu= -9.6963+/- 0.531 mean_var=397.6223+/-96.482, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 4 in 1/35 Lambda= 0.0643 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0922 ( 1346 res) mpm05283 (1346) 891 98 1.4e-20 >>mKIAA0922 ( 1346 res) mpm05283 (1346 aa) initn: 785 init1: 681 opt: 891 Z-score: 462.0 bits: 98.2 E(): 1.4e-20 Smith-Waterman score: 987; 27.094% identity (31.605% ungapped) in 1170 aa overlap (605-1741:302-1337) 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 IQQIRSLSEDVRFYYKRLRGNREDLEPGKKSKIANIYFDPGLQCGDHCYIGLPFLSKSE- .: ... :. .:: : ..: ::.: mKIAA0 GIVLNLFTNVFLTTNTGAIFAIPLQIFSAPTKEGSLGFEVLAHCGMHYFMGK---SKTEN 280 290 300 310 320 640 650 660 670 680 690 mKIAA0 PKVQPGVAMQEDLWDADWDAHQSLFKAWMGIKENAGHRLNAMFEVNTDLQKNIVSKVSAE :. . ....... :: : . ..:.. : : . . : :.. .. . :. ... mKIAA0 PNWERSLSLDRSTWDMDSELANKLYERWKKYKSGDACRRNVLGMAQFAFTKK-SKETEPF 330 340 350 360 370 380 700 710 720 730 740 750 mKIAA0 LSW-PSVLSSPRL-LKFPLTNTNCSSEEEISLENPADVPVYVQFIPLALYSNPSVFADKL .:. : :. : : :.: : :. . . ..::. :: .:..::.:: : . : .: mKIAA0 VSFLPRVVPEPNLVLNFSATALRNSAVKYFVVRNPTPQPVSLQLLPLSLYPRPEA-AVRL 390 400 410 420 430 440 760 770 780 790 800 810 mKIAA0 VSRFNLSKVAKLDLRTLEFQVYRNSAHPLQSPTGFTEGLSRHFILNLILKPGEKKFVKVK . .. . . ..: : :::. ..: : :. . .:. :.. :. : . : : mKIAA0 LHKWFGTDMQMVNLSTGEFQL--TQACPYQGEPSEESSLG---ALHVHLQALETRRVGVV 450 460 470 480 490 500 820 830 840 850 860 870 mKIAA0 FTPLHNRTVSSLIIVRNNLTVMDAVMVQGQGTTENLRVAGKLPGPGSSLRFKITEALLKD ::: :.:::..::::::.: : :.: :. : :.:.:.::: :.:::::. :. : : mKIAA0 FTPADYGKVTSLILIRNNLTVVDMVGVEGFGAQELLKVGGRLPGAGGSLRFKVPESTLMD 510 520 530 540 550 560 880 890 900 910 920 930 mKIAA0 CIDRLKLREPNFTLKRTFKVENTGQLEIRVETIEISGYACEGYGFKVVNCQEFALSANAS : .:: . ... ..::::: : : : : ...:.:: :.::::.:..:. :.:: :.: mKIAA0 CHRQLKDSKQILSITKNFKVENIGPLPITVTSLKINGYNCQGYGFEVLDCHPFSLSPNTS 570 580 590 600 610 620 940 950 960 970 980 990 mKIAA0 RDIVILFTPDFTASRVIRELKFVTSSGSEFVFVLNASLPYHMLAACAEALPRPNWELALY ::: :.::::::.: ::::: .::.. :: :.::..::.::: :::..: :.:: ... mKIAA0 RDISIVFTPDFTSSWVIRELTLVTAADLEFHFTLNVTLPHHMLPLCAEVVPGPSWEESFW 630 640 650 660 670 680 1000 1010 1020 1030 1040 1050 mKIAA0 IIISGVMSALFLLVIGTAYLEAQGIWEPF-RRRLSFEASNPPFDVGRPFDLRRIVGISSE . .: .: :: :. .:: : : . : ..:. . : : .. :::. mKIAA0 RLTVFFVSLSLLGVILIAFQQAQYILMEFMKTRQRQNGSSSSQQNGDP-----VAMISSH 690 700 710 720 730 1060 1070 1080 1090 1100 mKIAA0 GNLNTLGCEHSHGRGFYSNASSRPGTGSHRQC---GTSVHPHSSHGSKNSADVDNVRTRN . .: :.. . .. : : ..: : :. .. .... : . . .. mKIAA0 PHKST--CKN------FLDTYSPSDKGRGKSCLPVGPSLSRLQNAAKRSPATYGHSQKKH 740 750 760 770 780 1110 1120 1130 1140 1150 1160 mKIAA0 SSSMS-SRTSPQAAASQSTSKTSPLVSETAAATQGHTASRK--SRGAKQGQHSSQHHSHS . :. :. .:.:.:..:.. :. . .. :.. .:.. . ... : .. : mKIAA0 KCSFYYSKQKPSASAASSANVTTEEKQTVTLASSLSVAKEDICTNVLSENWVSLRYASGI 790 800 810 820 830 840 1170 1180 1190 1200 1210 1220 mKIAA0 HSPLEQHSQPPPPVPQHQEPPPERLSPAPLTHPSHPERASTTRHSSEDSDITSLIEAMDK .. :... : : ...: :. . .:. : . : . . . . : mKIAA0 NGSLQKNLTLPKNVLHKEESS---LKNTVVTN--------TPSECSMKEGVHTYM--FPK 850 860 870 880 890 1230 1240 1250 1260 1270 1280 mKIAA0 DFDHHDSSPLDVFTEQPPSPMSKSKGKGKSLQQRKAKPPK--KQEEKE-KRGKGKPQEDE . : . : . . :: : :.. :: .: . ::. ... : .: .:. :. mKIAA0 ETDSKISENVAELKEQEPCPQKTSKKPPESTLPKT--PPQYLQSDLPEVSRKHGNKQQAP 900 910 920 930 940 950 1290 1300 1310 1320 1330 1340 mKIAA0 LKDALADDDSSSTTTETSNPDTEPLLREDTEKHKGRPAVPEKQESELS-QGKPKSKKLLN ... . :: . . :.:: . :. . . . :::.. . : :. :. :. mKIAA0 VRSEV---DSFEPVRAA---DAEPSSVRKTQGASPEDTCSEKQDTPSAEQEDPSRKRKLQ 960 970 980 990 1000 1350 1360 1370 1380 1390 mKIAA0 AKKEIPTDVKGSSFELPYT---PSLENKQRRNLPTKIPLPTTLASGSKSRNP-PKTKGTN ..: ::. : .. : .::.: ::.. : .: :. .. . mKIAA0 ERRE------GSTQALNWNKTRPCRRNKKR-------------ASAQASSSPRPSEQSEQ 1010 1020 1030 1040 1400 1410 1420 1430 1440 1450 mKIAA0 KLVENRPVALSKFLPSSQELGNTSSSEGEKDSPPPEWDAV-PVHKPSSSTDSLYKLSLQT .:: . . .... . : . : :.: : . :: .. : . mKIAA0 RLVCSDVRSWCAQDGAGEKCKAGTEVSGSSPERREEGDGVSPQNFPSEASVPLSLPQHVC 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1460 1470 1480 1490 1500 1510 mKIAA0 LNADI-FLKQRQTSPTPASPSLPTAPCPFTSRGSYSSVVNSSGSDTKAKQTSSSKSKLTK ..:. : . :: :. :. :.. : ... .: :. ::. mKIAA0 SSTDVSVLPEFTESPCPGLPATPAGA------GEEKGLYPPGG------LWPSQPVCLTS 1110 1120 1130 1140 1150 1520 1530 1540 1550 1560 1570 mKIAA0 AASLPGKNGNPTFAAVAAGYDKSPGGNGFAKISSNKSDFSSSLGISHIPVDSDGSDSSGL . . : .:: : : .. : . :: ::. : mKIAA0 SFNCPVENGAP-------GVSQEP---------------------TSIP-DSSFID---- 1160 1170 1180 1580 1590 1600 1610 1620 1630 mKIAA0 WSPVSNPNSPD-FTP--LNSFSAFGN-SFNLTGAVFSKLSRSCSQSSQRSWNEFNSGPSY :: . . :. . : ::...:: . ..: :.. ::.. : .. .: :: mKIAA0 WSASCEGQFPSVYCPLELNDYNAFPEENMNYTNGF------PCSSKVQTDFIG-HSTPS- 1190 1200 1210 1220 1230 1640 1650 1660 1670 1680 mKIAA0 LWDSPATDPSPSWPASS--SSPTHTATSILGNSRGLWSTTPFSSSIWSSNINSNLPFSTP :..::. :. .: .: .::.. : ..:.: . . .:::. : : mKIAA0 TWNTPASMPA-AWGHASLVNSPSY-----LTSTRSLSPMSGLFGSIWA-------PQSEV 1240 1250 1260 1270 1280 1690 1700 1710 1720 1730 1740 mKIAA0 TNALSSISLMGTENSAAAHTPSASGPADD-LGQTYNPWR------IWSPTVGRRSSDPWS .. :: .::. :.: . . :: .::.: ::. :..: .. : : mKIAA0 YETCCPIS-PATEH--ATHMENQVMCKEYYLG--FNPFRAYMNLDIWTSTANRNANFPLS 1290 1300 1310 1320 1330 mKIAA0 NSHFPHEN mKIAA0 RDSSYCGNM 1340 1749 residues in 1 query sequences 1767268 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:15:57 2006 done: Mon Mar 27 10:15:59 2006 Scan time: 1.370 Display time: 0.170 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]