FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA0204.ptfa, 1307 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1767710 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2375+/-0.00804; mu= -10.8277+/- 0.528
 mean_var=483.2555+/-113.106, 0's: 0 Z-trim: 52  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.0583

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
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The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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>>mKIAA4026  ( 986 res)   mbg12171                        (986 aa)
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              70        80        90       100       110        120
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                                     :.: :. .: . ..:.: :::.:..:.. :
mKIAA4                        RCEEGGSPKP-RVLSSRSSSSMAFANFRRILRLSTFE
                                      10         20        30      

               130       140       150       160       170         
mKIAA0 KKK-KQYEHVKRDLNPEEFWEIIGELGDGAFGKVYKAQNKETNVLAAAKVIDTKSEEELE
       :.: ..::::.:::.:.. :::.::::::::::::::.::::..:::::::.::::::::
mKIAA4 KRKSREYEHVRRDLDPNDVWEIVGELGDGAFGKVYKAKNKETGALAAAKVIETKSEEELE
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     180       190       200       210       220       230         
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       ::.:::.:::.:::: ::::: :.::...:::.:::: ::::::.::::.: ::: ::::
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       ::.: :::::.:: ..::::::::::.:.::.:::.:::::::::: .:.:.::::::::
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       ::::::::.::: :: :::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::.:::
mKIAA4 YWMAPEVVLCETMKDAPYDYKADIWSLGITLIEMAQIEPPHHELNPMRVLLKIAKSDPPT
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       :  ::::: .:.:::.  :.:: ..: ...::::::::. : ::: .:::.::::::: :
mKIAA4 LLTPSKWSVEFRDFLKIALDKNPETRPSAAQLLQHPFVSRVTSNKALRELVAEAKAEVME
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mKIAA0 EVEDGKEEDEEEEAENALPIPANKRASSDLSIASSEEDKLSQNACILESVSERTEQSTSE
       :.:::.:. :::.: .:.:  .:.  .:    :.  . .:.                   
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mKIAA0 DKFSNKILNEKPTTDGPEKAVDEHASDVNLETGAELNDQTVGIHENGREKKRPKLENLPD
          :::.:... :   :                                        :: 
mKIAA4 ---SNKLLQDSST---P----------------------------------------LPP
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       .: :. :                  :  : .:                            
mKIAA4 SQPQEPV------------------NGPCSQP----------------------------
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                   ::.:     : :: .  :..:   .  . . :   :      ...:  
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mKIAA0 CEAEGQLTSTSETTRATLEQPETDEVEQVSESNSIEELERLVVTGAEARALGSEGEAAAT
        .:. :.                :: .:. ...                           
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              ::    :  : :..  :.: :.:.   . ...  .:.  :    :.:  : ..
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        :    : :   .: .. :: :  : : . :.:. ::  :..::.::. .. ..::::.:
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       :.:.:::::::.:::::......: ::.::::::::::::::::::.: : ::..: . :
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        ::. .:::::. .::. :: :.::::.:::: .:..::.:. : ..:::::. ::... 
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       .:::. ::. :::                               ...:: ::...:. ..
mKIAA4 AKFQEQLKQMKKEVKSEVEKLPRQQRKESMKQKMEEHSQKKQRLDRDFVAKQKEDLELAM
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mKIAA0 KKIIQQQKAELANIERECLNNKQQLMRAREAAIWELEERHLQEKHQLLKQQLKDQYFMQR
       .:.  ... :. . ::.::..::.:.: ::::.::.::..:::.:::.:::::::::.::
mKIAA4 RKLTTENRREICDKERDCLSKKQELLRDREAALWEMEEHQLQERHQLVKQQLKDQYFLQR
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       :.::..:::: :::::::::..:.:: :: ::.:::::::::..::::::.::::.::..
mKIAA4 HDLLRKHEKEREQMQRYNQRMMEQLKVRQQQEKARLPKIQRSDGKTRMAMYKKSLHINGA
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       .. ...:::::::. ::::::: ::. :.::::.::::.  :::.:. ::.:::::::::
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mKIAA0 LVEHETQKLKELDEEHSQELKEWREKLRPRKKTLEEEFARKLQEQEVFFKMTGESECLNP
       :::::::::: ::: :.: :::::.:::::::.:::.. .: .:::.:::.. :.:   :
mKIAA4 LVEHETQKLKALDESHNQSLKEWRDKLRPRKKALEEDLNQKKREQEMFFKLSEEAEP-RP
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mKIAA0 SAQSRISKFYPIPTLHSTGS
       .. :. :.:.:         
mKIAA4 TTPSKASNFFPYSSGDAS  
      970       980        

>>mKIAA0881  ( 1070 res)   mpm03231                       (1070 aa)
 initn: 661 init1: 176 opt: 723  Z-score: 348.2  bits: 76.4 E(): 3e-14
Smith-Waterman score: 787;  24.261% identity (26.954% ungapped) in 981 aa overlap (116-1066:21-933)

          90       100       110       120       130       140     
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mKIAA0 GDGAFGKVYKAQN-KETNVLAAAKVIDT--KSEEELEDYMVEIDILASCDHPNIVKLLDA
       : :.:: :: :.. ....:.:  :.  .  .:.:. .: . :. .: .  ::: ..    
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       .  :.. :...:.: :.: :  .::. ..:: : .: .: . .:..: :::....::::.
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       ::::::..  : .::.::: ..     .   .::.::::::::::..  .  .  :: :.
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       :::::::: ::.:: .::  ..: : .: .::..: :.: : ..::  :..:. .::.: 
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        . : :.  ::.:        : : .:    ..  ::::      . :  . .:. .:  
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        .  :: : .   : ...:      :..  .  :...    :.:  . ::.: .....  
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        ::.   .  :.  .:.    . .  : ...  .::  : ..  .. :  .:: :   : 
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        .  . ..           :...  .    ::...  :...  . :..:.. : :   : 
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        : .: :.   :   . ..: ..   :.  ..:  :. . ..:..  ::.        : 
mKIAA0 EQLSGYKRMRRQHQKQLLALESRLRGEREEHSGRLQRELEAQRAG-FGTE--------AE
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       .:..  :.            ..:: ... .:    ::    ...  .: ..  :. ::. 
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            ..: .   :: . .:...   . . :. : :.    . .   .: ::.     :.
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       :...  ..  .  ..    .. :  . .:  ..: ...: .. :    : . :.    : 
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mKIAA0 EHEKGNDTDSGTGSTVENSSGDLNLSISSFLSKAKDSGSVSLQETRRQKKTLK----KTR
       .. .. .   .  . ..... .:. ..     . ..  .    ..:.: :.::    . .
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       : . .  ....   : .     ..  :...  .:.: . .. : :    .. .:...  :
mKIAA0 KQFQETCKIQTRQYKALRAHLLETTPKAQHKSLLKRLKEEQTRKLAILAEQYDQSISEML
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mKIAA0 QQQREQIFRRFEQEMLSKKRQYDQEIENLEKQQKQTIERLEQEHTNRLRDEAKRIKGEQE
       ..:  .. .  : :. . ..: .::.: :.  :..   : :..:  .::        : :
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mKIAA0 KELSKFQNVLKNRKKEEQEFVQKQQQELDGSLKKIIQQQKAELANIERECLNNKQQLMRA
       ....  . .:..: .::   .:  ..:    .......:  :.  .. : .         
mKIAA0 QRVALRRALLEQRVEEELLALQTGRSE---RIRSLLERQAREIEAFDAESMRLGFSSMAL
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>>mKIAA1142  ( 597 res)   mph00410                        (597 aa)
 initn: 572 init1: 280 opt: 665  Z-score: 324.8  bits: 71.2 E(): 6e-13
Smith-Waterman score: 676;  31.899% identity (33.871% ungapped) in 395 aa overlap (6-398:206-579)

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        :   ::  :   :..   .: :. :   ::::       ::.:   . :: .  . .:.
mKIAA1 APNGPSAT-GLAAPQSSSSSRPPTRARGAPSPGVL-----GPHASEPQLAPPARALAAPA
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          : :  :  . .    :.  ... :. .   . :    .:. . . . ..:.:. : :
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mKIAA0 YKAQNKETNVLAAAKVIDTKSEEELEDYMVEIDILASCDHPNIVKLLDAFYYENNLWILI
         :  . .. :.:.: .: ..... :  . :. :. .  : :.:.. ...   ..::...
mKIAA1 CIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYRHENVVEMYNSYLVGDELWVVM
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       ::  :::.  .. . .  ..: :: .::  .:.::  :: . .::::.:. .::.: :: 
mKIAA1 EFLEGGALTDIVTHTR--MNEEQIAAVCLAVLQALAVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGR
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       .::.:::  :. .. . :: :..:::::::::..    :.  ::  ..:.::::. .:::
mKIAA1 VKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELI----SR-LPYGPEVDIWSLGVMVIEM
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mKIAA0 AEIEPPHHELNPMRVLLKIAKSEPPTLAQPSKWSSNFKDFLRKCLEKNVDARWTTSQLLQ
       .. :::. .  :....  :  . :: : .  : : ..: :: . : ..   : :...::.
mKIAA1 VDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKASPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLK
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mKIAA0 HPFVTVDSNKPVRELIAEAKAEVTEEVEDGKEEDEEEEAENALPIPANKRASSDLSIASS
       :::.:                                                       
mKIAA1 HPFLTKAGPPASIVPLMRQHRTR                                     
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>>mKIAA4182  ( 225 res)   mfj42218                        (225 aa)
 initn: 617 init1: 294 opt: 634  Z-score: 315.6  bits: 68.2 E(): 1.9e-12
Smith-Waterman score: 634;  44.907% identity (46.860% ungapped) in 216 aa overlap (193-408:4-210)

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mKIAA4                            ELKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEYLAGGSLT
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mKIAA0 AVMLELERPLTESQIQVVCKQTLEALNYLHDNKIIHRDLKAGNILFTLDGDIKLADFGVS
        :. :    . :.:: .::.. :.::..:: :..::::.:. :.:. ..:..::.:::  
mKIAA4 DVVTETC--MDEAQIAAVCRECLQALEFLHANQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLTDFGFC
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mKIAA0 AKNTRTIQRRDSFIGTPYWMAPEVVMCETSKDRPYDYKADVWSLGITLIEMAEIEPPHHE
       :. :   ..:....:::::::::::   : :   :  :.:.:::::  :::.: :::. .
mKIAA4 AQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVV---TRK--AYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLN
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mKIAA0 LNPMRVLLKIAKSEPPTLAQPSKWSSNFKDFLRKCLEKNVDARWTTSQLLQHPFVTVDSN
        ::.:.:  :: .  : : .: : :  :.::: .::: .:. : ....::::::. .   
mKIAA4 ENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHPFLKL--A
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mKIAA0 KPVRELIAEAKAEVTEEVEDGKEEDEEEEAENALPIPANKRASSDLSIASSEEDKLSQNA
       ::.  :                                                      
mKIAA4 KPLSSLTPLILAAKEAMKSNR                                       
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>>mKIAA0213  ( 1502 res)   mbg05341                       (1502 aa)
 initn: 387 init1: 149 opt: 543  Z-score: 264.5  bits: 61.4 E(): 1.4e-09
Smith-Waterman score: 543;  31.442% identity (34.456% ungapped) in 423 aa overlap (2-403:1095-1501)

                                            10          20         
mKIAA0                              GAAGRGRPRRSD--PCGRVRAGDERRGRCSP
                                     ::::  :  .:  :   : .. . ::   :
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       .. : :      . :  ::.  .: . :.  . :   : ::.::  :     ... :.: 
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       .  :.  . . .:      . .  . ..:.   .:.     :.:..: .  :    : :.
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mKIAA0 IIGELGDGAFGKVYKAQNKETNVLAAAKVI-----DTKSEEELEDYMVEIDILASCDHPN
         ...:.: .::::   . .:. : : : :     : :. .:  :   :. :. .  :::
mKIAA0 RGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGELMAMKEIRFQPNDHKTIKETAD---ELKIFEGIKHPN
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mKIAA0 IVKLLDAFYYENNLWILIEFCAGGAVDAVMLELERPLTESQIQVVCKQTLEALNYLHDNK
       .:. . .  ......:..:.:  :... :    .  : :  :..  ::   :.: ::.. 
mKIAA0 LVRYFGVELHREEMYIFMEYCDEGTLEEVS---RLGLQEHVIRLYTKQITVAINVLHEHG
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mKIAA0 IIHRDLKAGNILFTLDGDIKLADFGVSAK---NTRTIQRR-DSFIGTPYWMAPEVVMCET
       :.:::.:..::..: .: :::.::: :.:   :..:.  . .: .::  .:::::.    
mKIAA0 IVHRDIKGANIFLTSSGLIKLGDFGCSVKLKNNAQTMPGEVNSTLGTAAYMAPEVIT--R
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mKIAA0 SKDRPYDYKADVWSLGITLIEMAEIEPPHHEL-NPMRVLLKIAKSEPPTLAQPSKWSSNF
       .: . .   ::.:::: ..:::.  . : ::  . .... :.. .. : .  : . : . 
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mKIAA0 KDFLRKCLEKNVDARWTTSQLLQHPFVTVDSNKPVRELIAEAKAEVTEEVEDGKEEDEEE
       : :: .:::..   :::.::::.: :: : ...                           
mKIAA0 KAFLSHCLESDPKIRWTASQLLDHAFVKVCTDEE                          
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mKIAA0 EAENALPIPANKRASSDLSIASSEEDKLSQNACILESVSERTEQSTSEDKFSNKILNEKP

>>mKIAA1278  ( 1271 res)   mfj16286                       (1271 aa)
 initn: 431 init1: 220 opt: 465  Z-score: 229.9  bits: 54.8 E(): 1.2e-07
Smith-Waterman score: 471;  35.043% identity (37.615% ungapped) in 234 aa overlap (137-368:39-258)

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mKIAA0 SFFNFRKIFKLGSEKKKKQYEHVKRDLNPEEFWEIIGELGDGAFGKVYKAQNKETNVLAA
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mKIAA1 LPDVWNYPWIYSSLSPSSFYLLRDPETLAMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRKKYSAQVVA
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mKIAA0 AKVIDT--KSEEELEDYMVEIDILASCDHPNIVKLLDAFYYENNLWILIEFCAGGAVDAV
        : :    .::.::.. . ::.:. .  :::::..::.:  .... .. ..  :   .  
mKIAA1 LKFIPKLGRSEKELRNLQREIEIMRGLWHPNIVHMLDSFETDKEVVVVTDYAEGELFQ--
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mKIAA0 MLELERPLTESQIQVVCKQTLEALNYLHDNKIIHRDLKAGNILFTLDGDIKLADFGVSAK
       .:: .  : :.:.:..  : . :: :::...:.:::.:  :::..  : ::: ::: .  
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mKIAA0 NTRTIQRRDSFIGTPYWMAPEVVMCETSKDRPYDYKADVWSLGITLIEMAEIEPPHHELN
        . . .   :. ::: .:.::.:     ..::::. ::.::.:  : :.:   :: .  .
mKIAA1 MSTNTMVLTSIKGTPLYMSPELV-----EERPYDHTADLWSVGCILYELAVGTPPFYTTS
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mKIAA0 PMRVLLKIAKSEPPTLAQPSKWSSNFKDFLRKCLEKNVDARWTTSQLLQHPFVTVDSNKP
        ....  : :.       : .: :.                                   
mKIAA1 IFQLVSLILKD-------PVRWPSTISVITEPAGSDLGTPFTSRLPPELQVLKDEQAHRL
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>>mKIAA1901  ( 1234 res)   mpg03874                       (1234 aa)
 initn: 337 init1: 203 opt: 460  Z-score: 227.8  bits: 54.4 E(): 1.5e-07
Smith-Waterman score: 470;  22.608% identity (25.474% ungapped) in 951 aa overlap (144-1051:12-898)

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mKIAA1                    EGTMEKYVRLQKIGEGSFGKAVLVKSTEDGRHYVIKEINIS
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mKIAA0 --SEEELEDYMVEIDILASCDHPNIVKLLDAFYYENNLWILIEFCAGGAV-DAVMLELER
         :..: ..   :. .::.  :::::.  ..:  ...:.:....: :: .   .  .   
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mKIAA0 PLTESQIQVVCKQTLEALNYLHDNKIIHRDLKAGNILFTLDGDIKLADFGVSAKNTRTIQ
        . :.::     :   ::...:: ::.:::.:. ::..: :: ..:.:::..   . :..
mKIAA1 LFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVLNSTVE
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          . :::::...::.  ::   ..::. :.:.:.:: .: :.  ..   .  :   ..:
mKIAA1 LARTCIGTPYYLSPEI--CE---NKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGNMKNLVL
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mKIAA0 KI-AKSEPPTLAQPSKWSSNFKDFLRKCLEKNVDARWTTSQLLQHPFVTVDSNKPVR-EL
       :: . : ::.  .: ..: .....: . ...:   : .....:.. :..   .: .  .:
mKIAA1 KIISGSFPPV--SP-HYSYDLRSLLSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQL
        220          230       240       250       260       270   

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mKIAA0 IAEAKAEVTEEVEDGKEEDEEEEAENALPIPANKRASSDLSIAS-SEEDKLSQNACILES
       :::     :   . : .           :.:. :: .:  ...:    .:... :     
mKIAA1 IAEEFCLKTLS-KFGPQ-----------PLPG-KRPASGQGVSSFVPAQKITKPAA----
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mKIAA0 VSERTEQSTSEDKFSNK-ILNEKPTTDGPEKAVDEHASDVN-LETGAELNDQTVGIHENG
          .     .  :...: .:..::    : :  . :   :. ...: : . ..   .: .
mKIAA1 ---KYGVPLTYKKYGDKKLLEKKP----PPKHKQAHQIPVKKMNSGEERKKMS---EEAA
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mKIAA0 REKKRPKLENLPDTQDQQTVDVNSVSEENENNRVTLETNTDCLKPEEDRNKENQETLESK
       ....   .:.    .::         ...:..:  ::      . .. :..  ...:.. 
mKIAA1 KKRRLEFIEKEKKQKDQIRFLKAEQMKRQEKQR--LE------RINRAREQGWRNVLRAG
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mKIAA0 LIQSEEINDTHIQTMDLVS----QETGEKEADFQAVDNEVGLTKEETQEKLGKDGTAQKV
          : :.. . .     ::    .  :. :  ..:. ...   . : .:   : :   . 
mKIAA1 --GSGEVKASFFGIGGAVSPSPCSPRGQYE-HYHAIFDQMQRLRAEDNEARWKGGIYGRW
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mKIAA0 ITSDRSSEVGTDEA--LDD-TQKAAELSKAAQSGEGDEALAPTQTLAE----KPT--EGP
       .   .........:  ...  :.  :  .    .::  .:   :.::     .:.  .: 
mKIAA1 LPERQKGHLAVERANQVEEFLQRKREAMQNKARAEGHVGL--LQNLASLYGGRPSSSRGG
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       .  . :::   ..    :... . .::  :  ..:.. .. ..  .::    :::   . 
mKIAA1 KPRNNEEEVYLARLRQIRLQNFNERQQIKAKLRGENKEADGTKGQEAT---EETDMRLKK
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mKIAA0 SESNSIEELERLVVTGAE---ARALGSEGEAAATEVDLERKENAQKVPVKAESQAPAASQ
        :: . .   : .:   .    :  . : :  . :  :  . ... ::.  :    ..: 
mKIAA1 MESLKAQTNARAAVLKEQLERKRKEAYEREKKVWEEHLVARVKSSDVPLPLELLETGGS-
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mKIAA0 PSEPHPVLIPSININSETTENKEEMGALPKPETILPPEPEHEKGNDTDSGTGSTVENSSG
       ::. .  . : :...:   :   . :.:   .     : : ::.:.. :.    ..  . 
mKIAA1 PSKQQ--VKPVISVTSALKEVGLD-GSLTDTQ-----EEEMEKSNSAISSKREILRRLNE
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mKIAA0 DLNLSISSFLSKAKDSGS---VSLQETRRQK--KTLKKTRK-------FIVDGVEVSVTT
       .:. .  .   : . :::   :. .. :. .  ..... ::       ...    :.. :
mKIAA1 NLKAQ-EDEKEKQHHSGSCETVGHKDEREYETENAISSDRKKWEMGGQLVIPLDAVTLDT
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mKIAA0 SKIVTDSDSKTEELRFLRRQELRELRLLQKEEQRAQQQLNGKLQQQREQIFRR-FEQEML
       :  .:.. .  : ...      :..   .  ..  .   ...:: : : .    :..:. 
mKIAA1 SFSATEKHTVGEVIKLDSNGSPRKVWGKNPTDSVLKILGEAELQLQTELLENTSFKSEVY
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       .....:   .   :... : : .  .  ..    :.:  :  :   ..:.  :: .    
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mKIAA0 EEQEFVQKQQQELDGSLKKIIQQQKAELANIERECLNNKQQLMRAREAAIWELEERHLQE
       : . . . .. . ::::  ...                                      
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                               : :. :  : :.:  : : .  : :  ::: :  .:
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        : :    :..     :  :: ::             ::::.  :.  :  . .      
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          :: ..     ..::    :. :.::  . ..   .: : .::   .:  ..   : .
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         ... . ::. ...: :::::.   .:  ...::..... .::.:  .. ..    :. 
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          : :  : .. ...::.:.::: :  ::::.::::::. .     ::  :  ..:   
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        . : .:.::: ::::::.     . : ::.:::.::.::: ::.:    :.:.  ::.:
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       :.   ...::.:   .: .    :....:. ..  ::.:. . : :...::.: :    .
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       ::  ..: : .    ..:                ..:::       : ::: ::.. :. 
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           :   .. .::.:  :.     : :   . :..: .  : ...   .   ..  : .
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mKIAA0 DGPEKAVDEHASDVNLETGAELNDQTVGIHENGREKKRPKLENLP--DTQDQQTVDVNSV
       .  . :  . ... . ::   ..  .. .... .: .  ..:  :  :: .  . .. :.
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mKIAA0 SEENENNRVTLETNTDCLKPEEDRNKENQETLESKLIQSEEINDTHIQTMDLVSQETGEK
       .  .  . : . .: . .  : . :.     : :  ... .: :                
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        ::.: .: . :: :::  .: ::.   . :. ...: : .:.: :: . : .. . .. 
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       . : ..     : . :.. .:   :.:::.:. ::..:  . :::.:.:.. : .   . 
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        ....::::.:.::  .:.  :   :..:.:.:..: ...:.  ..      ::. . .:
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       :...     .. :..: .. .... ::... . : ... ::. :..              
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       :..:....:.   : :  :     .::.:.: .   .. .....::: .::::::.: .:
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Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]