# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg00975.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0376.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0376, 1135 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7904128 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6801+/-0.000207; mu= 8.0630+/- 0.011 mean_var=146.8726+/-28.820, 0's: 28 Z-trim: 109 B-trim: 929 in 2/65 Lambda= 0.105829 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|91208268|sp|Q2KN98.1|CYTSA_MOUSE RecName: Full= (1118) 7049 1088.9 0 gi|91208270|sp|Q2KN99.1|CYTSA_RAT RecName: Full=Cy (1118) 6938 1072.0 0 gi|109093548|ref|XP_001094607.1| PREDICTED: simila (1117) 6749 1043.1 0 gi|149720178|ref|XP_001488757.1| PREDICTED: simila (1117) 6737 1041.3 0 gi|91208265|sp|Q2KNA0.1|CYTSA_CANFA RecName: Full= (1117) 6726 1039.6 0 gi|91208269|sp|Q2KNA1.1|CYTSA_PANTR RecName: Full= (1117) 6724 1039.3 0 gi|74724515|sp|Q69YQ0.1|CYTSA_HUMAN RecName: Full= (1117) 6723 1039.2 0 gi|194674701|ref|XP_597976.3| PREDICTED: similar t (1119) 6574 1016.4 0 gi|49117524|gb|AAH72595.1| SPECC1-like [Mus muscul (1028) 6482 1002.3 0 gi|224072083|ref|XP_002196744.1| PREDICTED: cytosp (1150) 6466 1000.0 0 gi|62484090|gb|AAX84189.1| cytospin A [Gallus gall (1142) 6455 998.3 0 gi|91208266|sp|Q2KN97.2|CYTSA_CHICK RecName: Full= (1118) 6384 987.4 0 gi|221043634|dbj|BAH13494.1| unnamed protein produ (1078) 6166 954.1 0 gi|194043322|ref|XP_001926206.1| PREDICTED: SPECC1 ( 953) 5500 852.4 0 gi|22766841|gb|AAH37464.1| Specc1l protein [Mus mu ( 776) 4919 763.6 0 gi|91208272|sp|Q2KN96.1|CYTSA_XENTR RecName: Full= (1101) 4596 714.4 8.6e-203 gi|189533722|ref|XP_683059.3| PREDICTED: similar t (1117) 4184 651.5 7.5e-184 gi|91208271|sp|Q2KN95.1|CYTSA_TETNG RecName: Full= (1113) 3648 569.7 3.2e-159 gi|91208267|sp|Q2KN94.1|CYTSA_FUGRU RecName: Full= (1118) 3647 569.5 3.6e-159 gi|118763658|gb|AAI28650.1| LOC733457 protein [Xen (1105) 3558 555.9 4.4e-155 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