# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg00965.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0599.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0599, 762 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7919277 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1772+/-0.000197; mu= 8.9292+/- 0.011 mean_var=102.6846+/-20.151, 0's: 37 Z-trim: 38 B-trim: 1399 in 2/66 Lambda= 0.126567 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|167621502|ref|NP_722499.4| pleckstrin homology (1341) 4989 922.0 0 gi|81908024|sp|Q4VAC9.1|PKHG3_MOUSE RecName: Full= (1341) 4972 918.9 0 gi|21411439|gb|AAH31136.1| Plekhg3 protein [Mus mu ( 728) 4778 883.3 0 gi|109478374|ref|XP_234320.4| PREDICTED: similar t (1544) 4505 833.7 0 gi|109479543|ref|XP_001080822.1| PREDICTED: simila (1546) 4505 833.7 0 gi|49258130|gb|AAH73907.1| PLEKHG3 protein [Homo s ( 760) 3487 647.6 5.2e-183 gi|18676686|dbj|BAB84995.1| FLJ00242 protein [Homo ( 804) 3485 647.2 7.1e-183 gi|55749621|ref|NP_056364.1| pleckstrin homology d (1163) 3485 647.4 9.4e-183 gi|158706157|sp|A1L390.1|PKHG3_HUMAN RecName: Full (1219) 3485 647.4 9.8e-183 gi|119601275|gb|EAW80869.1| pleckstrin homology do ( 761) 3475 645.4 2.4e-182 gi|119601276|gb|EAW80870.1| pleckstrin homology do (1022) 3475 645.5 3e-182 gi|119601277|gb|EAW80871.1| pleckstrin homology do (1219) 3475 645.5 3.5e-182 gi|120537866|gb|AAI29953.1| PLEKHG3 protein [Homo ( 752) 3472 644.8 3.5e-182 gi|119601279|gb|EAW80873.1| pleckstrin homology do ( 752) 3470 644.5 4.5e-182 gi|168278669|dbj|BAG11214.1| pleckstrin homology d (1340) 3470 644.7 7e-182 gi|114653522|ref|XP_510005.2| PREDICTED: similar t (1446) 3455 641.9 5e-181 gi|39645480|gb|AAH63554.1| PLEKHG3 protein [Homo s ( 724) 3348 622.2 2.2e-175 gi|194225096|ref|XP_001915635.1| PREDICTED: plecks (1158) 3240 602.6 2.8e-169 gi|33873913|gb|AAH11891.2| PLEKHG3 protein [Homo s ( 694) 3202 595.5 2.3e-167 gi|149051495|gb|EDM03668.1| rCG61902 [Rattus norve ( 519) 3111 578.8 1.8e-162 gi|194038425|ref|XP_001926828.1| PREDICTED: plecks (1154) 2818 525.6 4.3e-146 gi|79153776|gb|AAI08132.1| Pleckstrin homology dom ( 743) 2615 488.4 4.4e-135 gi|194671016|ref|XP_001790438.1| PREDICTED: plecks (1152) 2615 488.5 6.2e-135 gi|73964205|ref|XP_854222.1| PREDICTED: similar to (1192) 2574 481.0 1.1e-132 gi|126282962|ref|XP_001378010.1| PREDICTED: simila (1332) 2137 401.3 1.3e-108 gi|149589465|ref|XP_001506571.1| PREDICTED: simila (1331) 1722 325.5 8.5e-86 gi|13279161|gb|AAH04298.1| PLEKHG3 protein [Homo s ( 294) 1151 220.7 6.3e-55 gi|119601278|gb|EAW80872.1| pleckstrin homology do ( 243) 1017 196.2 1.3e-47 gi|28375607|emb|CAD66586.1| unnamed protein produc ( 705) 886 172.6 4.6e-40 gi|74187441|dbj|BAE36687.1| unnamed protein produc ( 776) 738 145.6 6.8e-32 gi|47230286|emb|CAG10700.1| unnamed protein produc ( 373) 332 71.3 8e-10 gi|220673365|emb|CAX14350.1| novel protein similar ( 526) 315 68.3 8.9e-09 gi|189532833|ref|XP_683782.3| PREDICTED: similar t (2023) 315 68.7 2.6e-08 gi|47213346|emb|CAF92969.1| unnamed protein produc (2481) 248 56.5 0.00014 gi|194196183|gb|EDX09759.1| GD14126 [Drosophila si (1194) 211 49.5 0.0088 >>gi|167621502|ref|NP_722499.4| pleckstrin homology doma (1341 aa) initn: 4989 init1: 4989 opt: 4989 Z-score: 4920.6 bits: 922.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 4989; 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