FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0458.ptfa, 882 aa vs ./tmplib.26680 library 1768135 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.7236+/-0.0117; mu= -42.6133+/- 0.769 mean_var=879.6404+/-214.449, 0's: 0 Z-trim: 20 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0432 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1471 ( 801 res) mtj02395 ( 801) 488 46 2.2e-05 mKIAA1522 ( 1048 res) mpm09382 (1048) 399 41 0.0013 mKIAA0595 ( 1646 res) mbg04268 (1646) 380 39 0.0041 >>mKIAA1471 ( 801 res) mtj02395 (801 aa) initn: 288 init1: 200 opt: 488 Z-score: 189.0 bits: 46.0 E(): 2.2e-05 Smith-Waterman score: 536; 31.792% identity (39.379% ungapped) in 519 aa overlap (4-438:84-586) 10 20 mKIAA0 EISRPNSPS-----EGEGESSDSRSVNDEGSSD ::..:. . :::. .. .. .: : mKIAA1 RLSPGQPDLWRLALLPCLSLRELKKKAPPPRPTAPKPLLSRREEGEAVEAGDTPEELRSL 60 70 80 90 100 110 30 40 50 60 70 mKIAA0 PKDIDQDNR-------STSPSIPSPQDNESDSDSSAQQQMLQAQPPA-------LQAPSG : :. : .:.: :: : : . : . . ::. :. : . mKIAA1 PPDMMVGPRLPDPFLGTTAPLHFSPGPFPS-STGPATHYLSGPLPPGTYSGPTQLMQPRA 120 130 140 150 160 170 80 90 100 110 mKIAA0 AAS-APST----APPGTPQL---PTQGP------TPSATAVPPQ---GSPATSQPPNQTQ :. ::.: :: : .: : ..: .: : . ::: : : : :: : . mKIAA1 AVPMAPATVLYPAPAYTSELGLVPRSSPQHGIVSSPYAGVGPPQPVVGLP--SAPPPQLS 180 190 200 210 220 230 120 130 140 150 160 mKIAA0 S-----TVAPAAHT--HIQQAPTLHP-PRLPSPHP----PLQPMTAPPSQSSAQPHPQP- . :: ::. : .: . : :: :.: : : :. : :: ::.: : mKIAA1 GPELAMTVRPATTTVDSVQAPISSHTAPR-PNPTPALPQPCFPVPQPVPQSVPQPQPLPV 240 250 260 270 280 170 180 190 200 mKIAA0 ----SLHGQGP-PGPHSLQ-------TGPLLQH---PGPPQPFGLPSQPSQGQGPLGPSP :. . : :.:.. . :::: :: :: : : .: :.:. :.: mKIAA1 PYTYSIGTKQPLPAPYTYSIGTKQHLTGPLPQHQFPPGIPTGFPVPRTGPQAQAQPQPQP 290 300 310 320 330 340 210 220 230 240 250 mKIAA0 A---AAHPHSTIQ-LPASQSALQPQQPPREQ-----PLP---PAPLAMPHIKP---PPTT .:. : : ::: ::: :. : : : : :. ::. : : mKIAA1 QPQPQPQPQPQPQPQPQSQSQPQPQPQPQPQRPAFGPQPTQQPLPFQHPHLFPSQAPGIL 350 360 370 380 390 400 260 270 280 290 300 mKIAA0 PIPQLPAPQAHKHPPHLSGPSPFSLNANLPPPPALKPLSSLSTHHP-PS---AHP-PPLQ : : :.: : . : : .:...: : :. :: : : :: :: : : mKIAA1 PPPP-PTPYHFTPQPGVLGQPPPTLHTQLYPGPSQDPLPPHSGALPFPSPGPPHPHPTLA 410 420 430 440 450 460 310 320 330 340 350 360 mKIAA0 LMPQSQPLPSSPAQPPGLTQSQSLPPPAASHPTTGLHQVPSQSPFPQHPFVPGGPPPITP : .: : .: : : :::: :.:: . : ::: .: : ::. :: : mKIAA1 YGPAPSPRPLGPQATP---VSIRGPPPA-SQPTPSPHLVPSPAPSPGPGPVPSRPPTAEP 470 480 490 500 510 520 370 380 390 400 410 420 mKIAA0 PSCPPTSTPPAGPSSSSQPPCSAAVSSGGSVPGAPSCPLPAVQIKEEALDEAEEPESPPP : : .. : ::: : : . ::. : :. : .: . :...:.. mKIAA1 PPCLRRGAAAADLLSSS--PES---QHGGTQP--PGGGQPLLQPTKVDAAEGRRPQALRL 530 540 550 560 570 430 440 450 460 470 480 mKIAA0 PPRSPSPEPTVVDTPSHASQSARFYKHLDRGYNSCARTDLYFMPLAGSKLAKKREEAIEK ..: .: mKIAA1 IEQDPYEHPERLQQLQQELEAFRGQLGDAGALDAIWRELQEAQEHDARGRSIAIARCYSL 580 590 600 610 620 630 >>mKIAA1522 ( 1048 res) mpm09382 (1048 aa) initn: 232 init1: 111 opt: 399 Z-score: 157.3 bits: 40.5 E(): 0.0013 Smith-Waterman score: 433; 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