FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
../query/mKIAA0458.ptfa, 882 aa
vs ./tmplib.26680 library
1768135 residues in 2168 sequences
Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.7236+/-0.0117; mu= -42.6133+/- 0.769
mean_var=879.6404+/-214.449, 0's: 0 Z-trim: 20 B-trim: 0 in 0/36
Lambda= 0.0432
FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16
The best scores are: opt bits E(2168)
mKIAA1471 ( 801 res) mtj02395 ( 801) 488 46 2.2e-05
mKIAA1522 ( 1048 res) mpm09382 (1048) 399 41 0.0013
mKIAA0595 ( 1646 res) mbg04268 (1646) 380 39 0.0041
>>mKIAA1471 ( 801 res) mtj02395 (801 aa)
initn: 288 init1: 200 opt: 488 Z-score: 189.0 bits: 46.0 E(): 2.2e-05
Smith-Waterman score: 536; 31.792% identity (39.379% ungapped) in 519 aa overlap (4-438:84-586)
10 20
mKIAA0 EISRPNSPS-----EGEGESSDSRSVNDEGSSD
::..:. . :::. .. .. .: :
mKIAA1 RLSPGQPDLWRLALLPCLSLRELKKKAPPPRPTAPKPLLSRREEGEAVEAGDTPEELRSL
60 70 80 90 100 110
30 40 50 60 70
mKIAA0 PKDIDQDNR-------STSPSIPSPQDNESDSDSSAQQQMLQAQPPA-------LQAPSG
: :. : .:.: :: : : . : . . ::. :. : .
mKIAA1 PPDMMVGPRLPDPFLGTTAPLHFSPGPFPS-STGPATHYLSGPLPPGTYSGPTQLMQPRA
120 130 140 150 160 170
80 90 100 110
mKIAA0 AAS-APST----APPGTPQL---PTQGP------TPSATAVPPQ---GSPATSQPPNQTQ
:. ::.: :: : .: : ..: .: : . ::: : : : :: : .
mKIAA1 AVPMAPATVLYPAPAYTSELGLVPRSSPQHGIVSSPYAGVGPPQPVVGLP--SAPPPQLS
180 190 200 210 220 230
120 130 140 150 160
mKIAA0 S-----TVAPAAHT--HIQQAPTLHP-PRLPSPHP----PLQPMTAPPSQSSAQPHPQP-
. :: ::. : .: . : :: :.: : : :. : :: ::.: :
mKIAA1 GPELAMTVRPATTTVDSVQAPISSHTAPR-PNPTPALPQPCFPVPQPVPQSVPQPQPLPV
240 250 260 270 280
170 180 190 200
mKIAA0 ----SLHGQGP-PGPHSLQ-------TGPLLQH---PGPPQPFGLPSQPSQGQGPLGPSP
:. . : :.:.. . :::: :: :: : : .: :.:. :.:
mKIAA1 PYTYSIGTKQPLPAPYTYSIGTKQHLTGPLPQHQFPPGIPTGFPVPRTGPQAQAQPQPQP
290 300 310 320 330 340
210 220 230 240 250
mKIAA0 A---AAHPHSTIQ-LPASQSALQPQQPPREQ-----PLP---PAPLAMPHIKP---PPTT
.:. : : ::: ::: :. : : : : :. ::. : :
mKIAA1 QPQPQPQPQPQPQPQPQSQSQPQPQPQPQPQRPAFGPQPTQQPLPFQHPHLFPSQAPGIL
350 360 370 380 390 400
260 270 280 290 300
mKIAA0 PIPQLPAPQAHKHPPHLSGPSPFSLNANLPPPPALKPLSSLSTHHP-PS---AHP-PPLQ
: : :.: : . : : .:...: : :. :: : : :: :: : :
mKIAA1 PPPP-PTPYHFTPQPGVLGQPPPTLHTQLYPGPSQDPLPPHSGALPFPSPGPPHPHPTLA
410 420 430 440 450 460
310 320 330 340 350 360
mKIAA0 LMPQSQPLPSSPAQPPGLTQSQSLPPPAASHPTTGLHQVPSQSPFPQHPFVPGGPPPITP
: .: : .: : : :::: :.:: . : ::: .: : ::. :: :
mKIAA1 YGPAPSPRPLGPQATP---VSIRGPPPA-SQPTPSPHLVPSPAPSPGPGPVPSRPPTAEP
470 480 490 500 510 520
370 380 390 400 410 420
mKIAA0 PSCPPTSTPPAGPSSSSQPPCSAAVSSGGSVPGAPSCPLPAVQIKEEALDEAEEPESPPP
: : .. : ::: : : . ::. : :. : .: . :...:..
mKIAA1 PPCLRRGAAAADLLSSS--PES---QHGGTQP--PGGGQPLLQPTKVDAAEGRRPQALRL
530 540 550 560 570
430 440 450 460 470 480
mKIAA0 PPRSPSPEPTVVDTPSHASQSARFYKHLDRGYNSCARTDLYFMPLAGSKLAKKREEAIEK
..: .:
mKIAA1 IEQDPYEHPERLQQLQQELEAFRGQLGDAGALDAIWRELQEAQEHDARGRSIAIARCYSL
580 590 600 610 620 630
>>mKIAA1522 ( 1048 res) mpm09382 (1048 aa)
initn: 232 init1: 111 opt: 399 Z-score: 157.3 bits: 40.5 E(): 0.0013
Smith-Waterman score: 433; 28.386% identity (34.852% ungapped) in 539 aa overlap (7-469:437-951)
10 20 30
mKIAA0 EISRPNSPSEGE-GESSDSRSVNDEGSSDPKDIDQD
::: : .:.::. :. . :. . ....
mKIAA1 SSKGGSEGQPEGSVASNNVAPPPPGGSGRGSPSGGSTAETSDTASIRSSGQLSGRSVSLR
410 420 430 440 450 460
40 50 60 70 80 90
mKIAA0 NRSTSPSIPSPQDNESDSDSSAQQQMLQAQPPALQAPSGAASAPSTAP-PGTPQLPTQGP
. . : : :. . : .: .: : ..: : : : :. :: :
mKIAA1 KMKRPP--PPPRRTYS------LHQRGSAVP---DGPLGLPPKPERKQQPQLPRPPTAGG
470 480 490 500 510
100 110 120 130
mKIAA0 TPSATAV--PPQG--------SPATSQ-PPNQTQSTVAPAAHTHIQQA-PTLHP------
. .. :: ::.. ::. :. :: . . :..:.. :.. ::: :
mKIAA1 SSGVGAVSCPPSSAGTWGSGLSPGGSRRPPRSPERTLSPSSGYSSQSGTPTLPPKGLAVA
520 530 540 550 560 570
140 150 160 170 180
mKIAA0 PRLPSPHPPLQP-----MTAP--------PSQSSAQPHPQPSLHGQGPPGPHSLQTGPLL
: :. : .: . .: : :.. : : : .:: :. ..
mKIAA1 PASPGKAQPPKPDRVTSLRSPGASVSSSLTSLCSSSSDPTP-LDRSGPQMSTPLSDRFVI
580 590 600 610 620 630
190 200 210 220 230
mKIAA0 Q-HPGPPQPFGLP---SQPSQGQGPLGPSPAAAHPH-STIQL-PASQSALQPQQPPREQP
:: : ::. : :. :. .:. .::.: . :::. ::: : : : ..
mKIAA1 PPHPKVPAPFSPPPSKSKSSNQAAPVLAAPAVAPGQVSTIDTSPASPSMPQTTLTPAQE-
640 650 660 670 680 690
240 250 260 270 280 290
mKIAA0 LPPAPLAMPHIKPPPTTPIPQLPAPQAHKHPPHL--SGPSPFSL-----NANLPPPPALK
.:.: .:::. : : : :.: : . : : . . . ::::
mKIAA1 ---SPVASKDESPPPSPPPSYHPPPPPTKKPEVLEEAPPPPEAAVEILPDPSWPPPPPPA
700 710 720 730 740 750
300 310 320 330 340
mKIAA0 PL-SSLSTHHPPSAHPPPLQLM----PQSQPLPSSPAQ---PPGLTQSQSLPPPAASHPT
: ..:: . ::: ... :. :: : .. ::. . ::. :::: :.
mKIAA1 PEEQDLSM----ADFPPPEEVFFNAGPELGPLESCSSEAAVPPAASLSQT-PPPAPP-PS
760 770 780 790 800
350 360 370 380
mKIAA0 TG---LHQVPSQSPFPQHPFVP---GGPPPITPPSCP---------PTSTPPAGPSSSS-
.: : ..:... .: .: .: : .:: :. : .:.::.
mKIAA1 SGSEPLARLPQKDSVGKHSGAPREDSGTPLVTPSLLQMVRLRSVGASTGIPNPSPGSSAP
810 820 830 840 850 860
390 400 410 420 430 440
mKIAA0 QPPCSAAVSSGGSVPGAPSCPL-PAVQIKEEALDEAEEPESPPPPPRSPSPEPTVVDTPS
: : :.:. .: ::: : ::..: .: .: : : : : :: ..:.
mKIAA1 QKPLRRALSGRASPVTAPSSGLHAAVRLKASSLAASESPASALPTG-IPEAEPRSPQSPA
870 880 890 900 910 920
450 460 470 480 490 500
mKIAA0 HASQSARFYK-----HLDRGYNSCARTDLYFMPLAGSKLAKKREEAIEKAKREAEQKARE
.. : : : .:.: . :..::
mKIAA1 -SKASFIFSKGTKKLQLERPVSPEAQADLQRNLVAELRSISEHRPPPQAQKKPSKAPPPV
930 940 950 960 970 980
>>mKIAA0595 ( 1646 res) mbg04268 (1646 aa)
initn: 210 init1: 115 opt: 380 Z-score: 148.2 bits: 39.5 E(): 0.0041
Smith-Waterman score: 440; 23.017% identity (28.142% ungapped) in 895 aa overlap (14-818:562-1383)
10 20 30 40
mKIAA0 EISRPNSPSEGEGESSDSRSVNDEGSSDPKDIDQDNRSTSPSI
... . :.:: ...: .:. .. ::..
mKIAA0 GSENLERSAGQDSPAEEDALDLCPKLLETSQANPTLSLNDSAQADSMPVDS-VEGDSPAV
540 550 560 570 580 590
50 60 70 80 90
mKIAA0 PSPQDNESDSDSSAQQQMLQAQP----PALQAPSGAASAPSTAPPGTPQL-PTQGPTPSA
. ... :... : . : :.: .: :..: : . .: :.. . ..
mKIAA0 GNAAPGDQASSGTELVGSLPVGPNLTSPVLADKKGIE--PAVAVPTSDNLSPADVLANTV
600 610 620 630 640
100 110 120 130 140
mKIAA0 TAVPPQGSPATSQP------PNQTQSTVAPAAHTHIQQAPTLHP---PRLPSPHPP--LQ
.: : ..:: ..: :.. . ..: :: . . :.:. :.. ::. .
mKIAA0 AADPVPNDPAPADPVLVKCRPTDPRRAAAAAAAAAQGSRPSLQSADHPKVVSPEGKDVVG
650 660 670 680 690 700
150 160 170
mKIAA0 PMTAPPSQSS----AQPHP----------------------QPSLHGQGPPGPHS---LQ
:. . : :. :.:.: :: . :. : :.. :
mKIAA0 PLKVEGSTSATTQEAKPRPLSLSEYRQRRQQRQTEAEDRNSQPPVVGKWPSLPETPTELA
710 720 730 740 750 760
180 190 200 210 220 230
mKIAA0 TGPLLQHPGP-----PQ--PFGLPSQPSQGQGPLGPSPAAAHPHSTIQLPASQSALQPQQ
: : .: :: :...: : :..:..:.: .: .. . ...: :
mKIAA0 DIPCLVPSAPARKTAPQRSPIAVPETVSVGSNPVSPTP---EPSASKLMVSTHSE---QV
770 780 790 800 810 820
240 250 260 270 280 290
mKIAA0 PPREQPLPPAPLAMPHIKPPPTTPIPQLPAPQAHKHPPHLSGPSPFSLNANLPP-PPALK
.:.:: ..::: :.:.. .: .:: : .. : ::: ::..
mKIAA0 SSHEMPLA--------VRPPPP-PLPSV-SP---------AGPIPSTVPAPLPPFPPSVP
830 840 850 860
300 310 320 330 340
mKIAA0 PLSSLST--HHPPSAHPPPLQLMPQSQPLPSSPAQPPGLTQSQSLPP----PAASHPTTG
:: :: . : : ::::: : . :. : :: .:: :..: : :
mKIAA0 PLLSLPSGGHGVPRLPPPPLQ--PPGLPVSMRQMPPDPYTQYAPVPPWSCYPSVSPP--G
870 880 890 900 910
350 360 370 380 390 400
mKIAA0 LHQVPSQSPFPQHPFVPGGPPPIT-PPSCPPTSTPPAGPSSSSQPPCSAAVSSGGSVPGA
.: : : :.: : : . ::.: .:: .: : . : : .: : ::
mKIAA0 YSCLP---PPPTMPIVSGTPGTYAVPPTCNVPWVPPPAPVSPYSSSC--AYGSLGWGPGL
920 930 940 950 960 970
410 420 430 440 450 460
mKIAA0 PSCPLPAVQIKEEALDEAEEPESPPPPPRSPSPEPTVVDTPSHASQSARFYKHLDRGYNS
. :. .. .. :. . .. :: : :: .:. .: . . :. : :
mKIAA0 QQPPFWST-VSPPPLSSVPTGRAVPPTPVEPSGDPA---SPPEDVLPGPVTPSLSSGPAS
980 990 1000 1010 1020 1030
470 480 490 500 510 520
mKIAA0 CARTDLYFMPLAGSKLAKKREEAIEKAKREAEQKAREEREREKEKEKEREREREREREAE
: : : : .. . ..:. . . : . :
mKIAA0 ---------PAAPPVEPTKPEAQPVPVSPQPKHKVSTLVQSPQIKAPPTLSTEGVVFEES
1040 1050 1060 1070 1080
530 540 550 560 570 580
mKIAA0 RAAKASSSAHEGRLSDPQLSGPGHMRPSFEPPPTTIAAVPPDTPA-LRTLSEYARPHVMS
. . .: ..:.: .. .: . : : ...: .: :: :: :: :....
mKIAA0 VSERLKSETQENRPKEKPISTAIKSVPV--PKQSAVAKLPAVHPARLRKLSFLPTPRAQG
1090 1100 1110 1120 1130
590 600 610 620 630
mKIAA0 PTNRNHPFYMPLNPTDPLLAYHMPGLYNVDPTIRERELREREIRER---EIRERELRERM
: . . : . :. : . ..... : ... :
mKIAA0 PEDVVQAFISEI------------GIEASDLSSLLEQFEKSEAKKECPLPASADSLAVGN
1140 1150 1160 1170 1180
640 650 660 670 680 690
mKIAA0 KPGFEVKPPELDPLHPATNPMEHFARHSALTIPPAAGPHPFASFHPGLNPLERERLALAG
. .... : : :: : ..: ..:: :::. :: . . ... : . . .
mKIAA0 SGSIDI-PQEKKPLDRLQAP--ELANVAGLT-PPATPPHQLWKPLAAVSLLAKAKSPKST
1190 1200 1210 1220 1230 1240
700 710 720 730 740
mKIAA0 PQ---LRPE---MSYPDRLAA--ERIHAERMASLTSD----------PLARLQMFNVTPH
: :.:: . : : : :. . . : : :. . ..
mKIAA0 AQEGTLKPEGITEAKPPATACLQEGAHSPSPVHVGSGDHDYCVRSRTPPKRMPALVISEV
1250 1260 1270 1280 1290 1300
750 760 770 780 790
mKIAA0 HHQHSHIHSHLHLHQQDPLHQGSAGPVHPLV----DPLTAGPHLARF-PYPPGTLPNPLL
. . .. : . . : :::.: : . .:: . . : : :. ::
mKIAA0 GSRWN-VKRHQDITIKPVLSLGSAAPPLPCTATSQEPLDHRTSVEQADPSAPCFAPSTLL
1310 1320 1330 1340 1350 1360
800 810 820 830 840 850
mKIAA0 GQ--PPHEHEM-LRHPVFGTPYPRDLPGAIPPPMSAAHQLQAMHAQSAELQRLAMEQQWL
. : . :: : : : : :
mKIAA0 SPEASPCRSEMNARTP----PEPSDKQQSMRCYRKACRSVSPSSRGWQGRRGRSSRSVSS
1370 1380 1390 1400 1410
882 residues in 1 query sequences
1768135 residues in 2168 library sequences
Scomplib [34t11]
start: Mon Mar 27 10:21:15 2006 done: Mon Mar 27 10:21:16 2006
Scan time: 0.960 Display time: 0.160
Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]