FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1132.ptfa, 1723 aa vs ./tmplib.26680 library 1767294 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4352+/-0.00678; mu= -6.4610+/- 0.443 mean_var=468.3240+/-117.077, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0593 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA3024 ( 898 res) mfj07190 ( 898) 587 66 4.3e-11 mKIAA0343 ( 1202 res) mbg04270 (1202) 568 65 1.6e-10 mKIAA0756 ( 1251 res) mbg20669 (1251) 553 63 4e-10 mKIAA1514 ( 1994 res) mbf03631 (1994) 416 52 1.8e-06 mKIAA1355 ( 1189 res) mpm05201 (1189) 403 50 2.8e-06 mFLJ00154 ( 1340 res) mfj45154 (1340) 386 49 8.3e-06 mKIAA0230 ( 1431 res) mbg10262 (1431) 351 46 6.9e-05 >>mKIAA3024 ( 898 res) mfj07190 (898 aa) initn: 403 init1: 154 opt: 587 Z-score: 291.4 bits: 66.1 E(): 4.3e-11 Smith-Waterman score: 762; 23.187% identity (25.763% ungapped) in 910 aa overlap (98-961:6-870) 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 TRKAQTAQDFAIIVLEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPP-----TVTWAL : :. . :.:. ::: . .: . mKIAA3 RSTVSVRRGQGMVLLCG----PPPHSGELSYAWIF 10 20 30 130 140 150 160 170 mKIAA1 DDEPVVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNSVGSAE---PPSIR .. : .:. . ..: : ... .. . : : : :.. :.: . . ::. mKIAA3 NEYPSYQDNRRFVSQET-------GNLYIAKVEKSDVGNYTCVVTNTVTNHKVLGPPTPL 40 50 60 70 80 180 190 200 210 220 mKIAA1 AMRN------------------ITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYK-DALLLPDNHR .:: . : : . ..: ..: : .: : . :. . . : mKIAA3 ILRNDGVMGEYEPKIEVQFPETVPAEKGTTVKLECFALGNPVPTILWRRADGKPIARKAR 90 100 110 120 130 140 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 QVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIG . :: :.. . :. : : : : . . ..... . : .: .. ... mKIAA3 RHK-SNGILEIPNFQQ-EDAGSYECVAENSRGKNVAKGQLTFYAQPNWVQIINDIHVAME 150 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 QLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCI . .. : ... : : :.:. ... . . ::. ..:.:. :.:. : : :. mKIAA3 ESVFWECKANGRPKPTY-RWLKNGDPLLTRDRIQIEQ----GTLNITIVNLSDAGMYQCV 210 220 230 240 250 350 360 370 380 390 mKIAA1 ASNAAATV--SRERQLIVRVPP--RFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHA : : ... : : ..:.. : : ... . . :.. :..:. . : : :. mKIAA3 AENKHGVIFSSAELSVIAESPDFSRTLLKRVTLVKVGGEV-VIECKPKASPRPVYTWR-- 260 270 280 290 300 310 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 KGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKAMFLTVK :: .. . :: : ...: : .: . : : : : :.: :: : . . :: mKIAA3 KGREILRENE------RITISEDGNLRIINVTKSDAGSYTCIATNHFGTASSTGNVI-VK 320 330 340 350 360 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 IPAMITSHPNTTIAIKGHPKELNCTARGER--PIIIRWEKGDTVIDPDRVMRY--AIATK :. . :.. . :. : : . .. :.. : . .:: :. . .. . mKIAA3 DPTKVMVPPSSMDVTVGESIVLPCQVTHDHSLDIVFTWTFNGHLIDFDKDGDHFERVGGQ 370 380 390 400 410 420 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 DN-GDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPE-LEIREVKA :. :: .. ...:: : . . : . .: . .: :. :: ::: . : :. mKIAA3 DSAGDLMIRNIQLKHAGK-----YVCMVQTSVDKLSVAADLIVRGPPGPPEAVTIDEITD 430 440 450 460 470 480 580 590 600 610 620 mKIAA1 RSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNK-SDSWDFKQSTRNISPTIN----QANIVDLHPA . .: : :..: :: . :. .. : .: :.. .. .. :..: :.: mKIAA3 TTAQLSWRPGPDNHSPITMYVIQARTPFSVGW---QAVNTVPDLVDGKTFTATVVGLNPW 490 500 510 520 530 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 SVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTIS-TEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKEL : .: . : :: .:::. :::: :. : .:. ... . .::.. .:: mKIAA3 VEYEFRTVAANVIGIGEPSRPSEKRRTEEALPEVTPANVSGGGGSKSELVITWETVPEEL 540 550 560 570 580 590 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 QNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGT ::: :: ...: . :. . : .: .. :. .... :. . : : .:: : mKIAA3 QNGRGFGYVVAFRPH--GKMIWMLTVLASADASRYVFRNESVRPFSPFEVKVGVFNNKGE 600 610 620 630 640 650 750 760 770 780 790 800 mKIAA1 GPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSIT-SDVAVISWSEPPRTTLNGVLKGYRVIFWSL :: : . . :. :..:: .. : :.. .:. :. :. : . : ..::.: .: mKIAA3 GPFSPTTLVYSAEEEPTKPPASIFARSLSATDIEVF-WASPIGKN-RGRIQGYEVKYWRH 660 670 680 690 700 710 810 820 830 840 850 860 mKIAA1 YVDGEWGEMQNVTTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGP : .. .. .. ... ... . : ..: ::..:: : :... . :.. :. mKIAA3 DDKEENAKKIRTVGNQTSTKITNLKGSALYHLSVKAYNSAGTGPSSATVNVTTRKPPPSQ 720 730 740 750 760 770 870 880 890 900 910 920 mKIAA1 PAGIKAVPSSASSVVVSW--LPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAPSEYETSPEQLFYR : : :: :.....: . .. .. : .. . : . : ::. .. mKIAA3 PPGNIIWNSSDSKIILNWDQVKALDNESEVKGYKVLYR--WNRQSSTSVIETNKTSVELS 780 790 800 810 820 830 930 940 950 960 970 980 mKIAA1 IAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPC . ..:.. . ...: :.:::.. : ... :. mKIAA3 LPF---DEDYIIEIKPFSDGGDGSSSEQIRIPKISNSYARGSGASTSNACTLSAISTIMI 840 850 860 870 880 890 990 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA1 NSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSLDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGF mKIAA3 SLTARSSL >>mKIAA0343 ( 1202 res) mbg04270 (1202 aa) initn: 543 init1: 164 opt: 568 Z-score: 281.3 bits: 64.6 E(): 1.6e-10 Smith-Waterman score: 906; 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