FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1463.ptfa, 961 aa vs ./tmplib.26680 library 1768056 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3965+/-0.00379; mu= 18.6848+/- 0.255 mean_var=81.1161+/-18.159, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1424 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0934 ( 1179 res) mfj03019 (1179) 5271 1094 0 mKIAA0184 ( 1483 res) mbg08693 (1483) 5207 1081 0 >>mKIAA0934 ( 1179 res) mfj03019 (1179 aa) initn: 5269 init1: 4411 opt: 5271 Z-score: 5847.2 bits: 1093.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 5271; 78.252% identity (78.333% ungapped) in 961 aa overlap (1-961:220-1179) 10 20 30 mKIAA1 HWAMMAHRDQRDVSLSSLRMLIVTDGANPW :::..::::::::.:::::::::.:::::: mKIAA0 YSLMKVNPLSWIQKVCQYKAKVACVKSRDMHWALVAHRDQRDVNLSSLRMLIVADGANPW 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 SVSSCDAFLSLFQSHGLKPEAICPCATSAEAMTVAIRRPGVPGAPLPGRAILSMNGLSYG :.:::::::..:::.::. :.:::::.: ::.::::::: . :::..:::.::.:: mKIAA0 SISSCDAFLNVFQSKGLRQEVICPCASSPEALTVAIRRPTDDSNQPPGRGVLSMHGLTYG 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 VIRVNTEDKNSALTVQDVGHVMPGGMMCIVKPDGLPQLCRTDEIGEICVSSRTGGMMYFG ::::..:.: :.::::::: ::::..:: :::::.:::::::::::.:: . . : :.: mKIAA0 VIRVDSEEKLSVLTVQDVGLVMPGAIMCSVKPDGIPQLCRTDEIGELCVCAVATGTSYYG 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 LAGVTKNTFEVIPVTSSGSPVGDVPFIRSGLLGFVGPGSLVFVVGKMDGLLMVSGRRHNA :.:.:::::::.:.::::.:... ::::.:::::::::.:::::::::::..:::::::: mKIAA0 LSGMTKNTFEVFPMTSSGAPISEYPFIRTGLLGFVGPGGLVFVVGKMDGLMVVSGRRHNA 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 DDIVATGLAVESIKTVYRGRIAVFSVSVFYDERIVVVAEQRPDASEEDSFQWMSRVLQAI ::::::.:::: .: :::::::::::.:..:::::.:::::::..::::::::::::::: mKIAA0 DDIVATALAVEPMKFVYRGRIAVFSVTVLHDERIVIVAEQRPDSTEEDSFQWMSRVLQAI 430 440 450 460 470 480 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 DSIHQVGVYCLALVPANTLPKTPLGGIHISQTKQLFLEGSLHPCNILMCPHTCVTNLPKP ::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::.:::::::::::::: mKIAA0 DSIHQVGVYCLALVPANTLPKTPLGGIHLSETKQLFLEGSLHPCNVLMCPHTCVTNLPKP 490 500 510 520 530 540 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 RQKQPGVGPASVMVGNLVAGKRIAQAAGRDLGQIEENDLVRKHQFLAEILQWRAQATPDH ::::: .:::::::::::.:::::::.::::::::.:: .:: ::.:.::::::.:::: mKIAA0 RQKQPEIGPASVMVGNLVSGKRIAQASGRDLGQIEDNDQARKFLFLSEVLQWRAQTTPDH 550 560 570 580 590 600 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 VLFMLLNAKGTTVCTASCLQLHKRAERIASVLGDKGHLNAGDNVVLLYPPGIELIAAFYG .:. ::: .:: . . .:.:::::::.:: .: ..:::. ::.:.:.:::::.::::::: mKIAA0 LLYTLLNCRGTIANSLTCVQLHKRAEKIAVMLMERGHLQDGDHVALVYPPGIDLIAAFYG 610 620 630 640 650 660 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 CLYAGCIPVTVRPPHAQNLTATLPTVRMVVDVSKAACVLTTQTLMRLLKSREAAAAVDVK ::::::.:.:::::: ::...:::::.:.:.::..::..::: . .::.::::::::::. mKIAA0 CLYAGCVPITVRPPHPQNIATTLPTVKMIVEVSRSACLMTTQLICKLLRSREAAAAVDVR 670 680 690 700 710 720 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 TWPAIIDTDDLPRKRLPQLYKPPTPEMLAYLDFSVSTTGMLTGVKMSHSAVNALCRAIKL ::: :.::::::.:: :.::: .:. ::::::::::::::.::::::.:..:.::.::: mKIAA0 TWPLILDTDDLPKKRPAQIYKPSNPDTLAYLDFSVSTTGMLAGVKMSHAATSAFCRSIKL 730 740 750 760 770 780 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 QCELYSSRQIAICLDPYCGLGFALWCLCSVYSGHQSVLIPPMELENNLFLWLATVNQYKI ::::: ::..::::::::::::.:::::::::::::.:::: :::.: ::: .:.:::. mKIAA0 QCELYPSREVAICLDPYCGLGFVLWCLCSVYSGHQSILIPPSELETNPALWLLAVSQYKV 790 800 810 820 830 840 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 RDTFCSYSVMELCTKGLGNQVEVLKTRGINLSCIRTCVVVAEERPRVSLQQSFSKLFKDI ::::::::::::::::::.:.: ::.::..:: .::::::::::::..: :::::::::. mKIAA0 RDTFCSYSVMELCTKGLGSQTESLKARGLDLSRVRTCVVVAEERPRIALTQSFSKLFKDL 850 860 870 880 890 900 700 710 720 730 740 750 mKIAA1 GLSPRAVSTTFGSRVNVAICLQGTSGPDPTTVYVDLKSLRHDRVRLVERGAPQSLLLSES :: ::::::.:: :::.::::::::::::::::::...::::::::::::.:.:: : :: mKIAA0 GLHPRAVSTSFGCRVNLAICLQGTSGPDPTTVYVDMRALRHDRVRLVERGSPHSLPLMES 910 920 930 940 950 960 760 770 780 790 800 810 mKIAA1 GKILPGVKVVIVNPETKGPVGDSHLGEIWVNSPHTASGYYTIYDSETLQADHFNTRLSFG :::::::...:.:::::::.::::::::::.: :.::::.::: .:.::.::::.::::: mKIAA0 GKILPGVRIIIANPETKGPLGDSHLGEIWVHSAHNASGYFTIYGDESLQSDHFNSRLSFG 970 980 990 1000 1010 1020 820 830 840 850 860 870 mKIAA1 DAAQTLWARTGYLGFVRRTELTAATGERHDALYVVGALDETLELRGLRYHPIDIETSVSR :. ::.:::::::::.:::::: :.:::::::::::::::..::::.::::::::::: : mKIAA0 DT-QTIWARTGYLGFLRRTELTDANGERHDALYVVGALDEAMELRGMRYHPIDIETSVIR 1030 1040 1050 1060 1070 1080 880 890 900 910 920 930 mKIAA1 VHRSIAECAVFTWTNLLVVVVELCGSEQEALDLVPLVTNVVLEEHYLIVGVVVVVDPGVV .:.:..::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::: ::. mKIAA0 AHKSVTECAVFTWTNLLVVVVELDGSEQEALDLVPLVTNVVLEEHYLIVGVVVVVDIGVI 1090 1100 1110 1120 1130 1140 940 950 960 mKIAA1 PINSRGEKQRMHLRDSFLADQLDPIYVAYNM :::::::::::::::.::::::::::::::: mKIAA0 PINSRGEKQRMHLRDGFLADQLDPIYVAYNM 1150 1160 1170 >>mKIAA0184 ( 1483 res) mbg08693 (1483 aa) initn: 5205 init1: 4344 opt: 5207 Z-score: 5775.0 bits: 1080.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 5207; 77.419% identity (77.500% ungapped) in 961 aa overlap (1-961:524-1483) 10 20 30 mKIAA1 HWAMMAHRDQRDVSLSSLRMLIVTDGANPW ::...:.: :::: :::::::::.:::::: mKIAA0 YALMKVNPLSWIQKVCSYKARAALVKSRDMHWSLLAQRGQRDVCLSSLRMLIVADGANPW 500 510 520 530 540 550 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 SVSSCDAFLSLFQSHGLKPEAICPCATSAEAMTVAIRRPGVPGAPLPGRAILSMNGLSYG :.:::::::..:::.::.::.:::::.: ::.::::::: :.: : .:.::::::::: mKIAA0 SISSCDAFLNVFQSRGLRPEVICPCASSPEALTVAIRRPPDLGGPPPRKAVLSMNGLSYG 560 570 580 590 600 610 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 VIRVNTEDKNSALTVQDVGHVMPGGMMCIVKPDGLPQLCRTDEIGEICVSSRTGGMMYFG ::::.::.: :.:::::::.::::. .:.:: :: : ::.:::::::::.: . : :.: mKIAA0 VIRVDTEEKLSVLTVQDVGQVMPGASVCVVKVDGAPYLCKTDEIGEICVNSVATGTAYYG 620 630 640 650 660 670 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 LAGVTKNTFEVIPVTSSGSPVGDVPFIRSGLLGFVGPGSLVFVVGKMDGLLMVSGRRHNA : :.::::::..:::..: ::.: :: :.:::::.:: .:::::::.:::..:. ::::: mKIAA0 LLGITKNTFETVPVTADGVPVSDRPFTRTGLLGFIGPDNLVFVVGKLDGLMVVGVRRHNA 680 690 700 710 720 730 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 DDIVATGLAVESIKTVYRGRIAVFSVSVFYDERIVVVAEQRPDASEEDSFQWMSRVLQAI ::::::.:::: .: :::::::::::.:..:.:::.:::::::::::::::::::::::: mKIAA0 DDIVATALAVEPMKFVYRGRIAVFSVTVLHDDRIVLVAEQRPDASEEDSFQWMSRVLQAI 740 750 760 770 780 790 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 DSIHQVGVYCLALVPANTLPKTPLGGIHISQTKQLFLEGSLHPCNILMCPHTCVTNLPKP :::::::::::::::::::::.::::::::.::: ::::.:::::.:::::::::::::: mKIAA0 DSIHQVGVYCLALVPANTLPKAPLGGIHISETKQRFLEGTLHPCNVLMCPHTCVTNLPKP 800 810 820 830 840 850 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 RQKQPGVGPASVMVGNLVAGKRIAQAAGRDLGQIEENDLVRKHQFLAEILQWRAQATPDH ::::: :::::..:::::::::::::.::.:...:..: .:: :::..:::::..:::: mKIAA0 RQKQPEVGPASMIVGNLVAGKRIAQASGRELAHLEDSDQARKFLFLADVLQWRAHTTPDH 860 870 880 890 900 910 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 VLFMLLNAKGTTVCTASCLQLHKRAERIASVLGDKGHLNAGDNVVLLYPPGIELIAAFYG ::.:::::::.. ::.:.::::::::.:..: .::.:.:::.:.:.::::..::::::: mKIAA0 PLFLLLNAKGTVTSTATCIQLHKRAERVAAALMEKGRLDAGDHVALVYPPGVDLIAAFYG 920 930 940 950 960 970 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 CLYAGCIPVTVRPPHAQNLTATLPTVRMVVDVSKAACVLTTQTLMRLLKSREAAAAVDVK ::: ::.:::::::: ::: .:::::.:.:.:::.::::.::.. :::::.::::::::. mKIAA0 CLYCGCVPVTVRPPHPQNLGTTLPTVKMIVEVSKSACVLSTQAITRLLKSKEAAAAVDVR 980 990 1000 1010 1020 1030 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 TWPAIIDTDDLPRKRLPQLYKPPTPEMLAYLDFSVSTTGMLTGVKMSHSAVNALCRAIKL :::.:.::::.:.:.. ....::.:..::::::::::::.:.::::::.:..::::.::: mKIAA0 TWPTILDTDDIPKKKVASIFRPPSPDVLAYLDFSVSTTGILAGVKMSHAATSALCRSIKL 1040 1050 1060 1070 1080 1090 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 QCELYSSRQIAICLDPYCGLGFALWCLCSVYSGHQSVLIPPMELENNLFLWLATVNQYKI ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::.:. :::..:.::: mKIAA0 QCELYPSRQIAICLDPYCGLGFALWCLCSVYSGHQSVLVPPLELESNVSLWLSAVSQYKA 1100 1110 1120 1130 1140 1150 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 RDTFCSYSVMELCTKGLGNQVEVLKTRGINLSCIRTCVVVAEERPRVSLQQSFSKLFKDI : :::::::::.:::::: :. .:. .:.::::.:::.::::::::.:: :::::::::. mKIAA0 RVTFCSYSVMEMCTKGLGAQTGALRMKGVNLSCVRTCMVVAEERPRISLTQSFSKLFKDL 1160 1170 1180 1190 1200 1210 700 710 720 730 740 750 mKIAA1 GLSPRAVSTTFGSRVNVAICLQGTSGPDPTTVYVDLKSLRHDRVRLVERGAPQSLLLSES :: :::::::: :::::::::::.::::::::::...::::::::::::.:.:: : :: mKIAA0 GLPARAVSTTFGCRVNVAICLQGTTGPDPTTVYVDMRALRHDRVRLVERGSPHSLPLMES 1220 1230 1240 1250 1260 1270 760 770 780 790 800 810 mKIAA1 GKILPGVKVVIVNPETKGPVGDSHLGEIWVNSPHTASGYYTIYDSETLQADHFNTRLSFG :::::::::.:.. :::::.::::::::::.:::.:.::::.: :::.::::..::::: mKIAA0 GKILPGVKVIIAHTETKGPLGDSHLGEIWVSSPHNATGYYTVYGEETLHADHFSARLSFG 1280 1290 1300 1310 1320 1330 820 830 840 850 860 870 mKIAA1 DAAQTLWARTGYLGFVRRTELTAATGERHDALYVVGALDETLELRGLRYHPIDIETSVSR :. ::.:::::::::.:::::: :.:::::::::::.:::::::::.::::::::::: : mKIAA0 DT-QTIWARTGYLGFLRRTELTDASGERHDALYVVGSLDETLELRGMRYHPIDIETSVIR 1340 1350 1360 1370 1380 1390 880 890 900 910 920 930 mKIAA1 VHRSIAECAVFTWTNLLVVVVELCGSEQEALDLVPLVTNVVLEEHYLIVGVVVVVDPGVV .:::::::::::::::::::::: : ::.::::: ::::::::::::.:::::.:::::. mKIAA0 AHRSIAECAVFTWTNLLVVVVELDGLEQDALDLVALVTNVVLEEHYLVVGVVVIVDPGVI 1400 1410 1420 1430 1440 1450 940 950 960 mKIAA1 PINSRGEKQRMHLRDSFLADQLDPIYVAYNM :::::::::::::::.::::::::::::::: mKIAA0 PINSRGEKQRMHLRDGFLADQLDPIYVAYNM 1460 1470 1480 961 residues in 1 query sequences 1768056 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:45:47 2006 done: Mon Mar 27 10:45:48 2006 Scan time: 0.990 Display time: 0.200 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]