FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0656.ptfa, 608 aa vs ./tmplib.26680 library 1768409 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.9829+/-0.00949; mu= -30.8507+/- 0.624 mean_var=530.9499+/-131.274, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0557 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4114 ( 674 res) mia05063 ( 674) 450 51 4.6e-07 mKIAA0618 ( 971 res) mfj10160 ( 971) 332 41 0.00044 mKIAA0023 ( 2112 res) mbg02458 (2112) 316 40 0.0019 mKIAA1071 ( 539 res) mpm04376 ( 539) 293 38 0.0024 >>mKIAA4114 ( 674 res) mia05063 (674 aa) initn: 420 init1: 314 opt: 450 Z-score: 219.2 bits: 50.8 E(): 4.6e-07 Smith-Waterman score: 499; 34.302% identity (40.550% ungapped) in 344 aa overlap (246-579:371-671) 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 VTPTASTAPPVPATAPSPAPTAVAATAATTTAAAAATTTATTSAAAATTAAAPPALDIFG :. ..:.. ..:::.. :: ::.:::. mKIAA4 REKQAALEEEQARLKALKEQRLKELAKKPHTSLTTAASPVSTSAGGIMTA---PAIDIFS 350 360 370 380 390 280 290 300 310 320 mKIAA0 DLFDSAPEVAAAP-------KPDAAPSIDLFGTDAFSSPPRGASPVPESSLTADLLSVDA .:. .. : .: ::. :.:. :.::: . ..: : .:. mKIAA4 TP-SSSNSTSKLPNDLLDLQQPTFHPSVH-----AMSAAPQGASTWGDP-FSATLDAVED 400 410 420 430 440 450 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 FAAPSPASTASPAKAESSGVIDLFGDAFGSGASETQPAPQAVSSSSASADLLAGFGGSFM : :: .: ..::: . : ..: .: . .. . . ....::. : mKIAA4 -AIPS----LNPFLTKSSGDVHL---PIASDVS-------TFTTRTPTHEMFVGFSPS-- 460 470 480 490 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 APSTTPVTPAQNNLLQPSFEAAFGTTPSTSSSSSFDPSGDLLMPTMAPSGQPAPVSMVPP : . : . : :. .::..:: . :.. . : .: :: ::.: ..: ::. .:: mKIAA4 -PVAQPHSSAGLNV---DFESVFG---NKSTNVAVDSGGGLLKPTVASQNQSLPVAKLPP 500 510 520 530 540 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 SPAMAASKGLGSDLDSSLASLVGNLGISGTTSKKGDLQWNA-GEKKLTGGANWQPKVTPA . : ...:::::::.::::::: :. . :.:..:. ::::::::.::::::.:. mKIAA4 N------KLVSDDLDSSLANLVGNLGI-GNGTTKNDVSWSQPGEKKLTGGSNWQPKVAPT 550 560 570 580 590 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 T-WSAGVPPQGTVPPTSSVPPGAGAPSVGQPGA-GFGMPPSGTGMTMMSQQPVMFAQPMM : :::.. : . :: . :.. : :.:.::. .. .:.: ....::.: mKIAA4 TAWSAATMNGMHFPQYA--PPVMAYPATTPTGMIGYGIPPQMGSVPVMTQPTLIYSQPVM 600 610 620 630 640 650 570 580 590 600 mKIAA0 RPPFGAAAVPGTQLSPSPTPATQSPKKPPAKDPLADLNIKDFL ::: . : :.:.. mKIAA4 RPPNPFGPVSGAQIQFM 660 670 >>mKIAA0618 ( 971 res) mfj10160 (971 aa) initn: 238 init1: 96 opt: 332 Z-score: 165.7 bits: 41.4 E(): 0.00044 Smith-Waterman score: 402; 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