FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0705.ptfa, 1252 aa vs ./tmplib.26680 library 1767765 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1270+/-0.0074; mu= 0.1726+/- 0.488 mean_var=351.6842+/-84.800, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0684 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4129 ( 1125 res) mfj49110 (1125) 1233 137 2.4e-32 mKIAA1634 ( 1170 res) mbg16650 (1170) 796 93 2.3e-19 mKIAA4187 ( 562 res) mpm05138 ( 562) 241 38 0.0045 mKIAA1232 ( 950 res) mbg05359 ( 950) 243 39 0.0054 >>mKIAA4129 ( 1125 res) mfj49110 (1125 aa) initn: 2574 init1: 636 opt: 1233 Z-score: 673.2 bits: 136.6 E(): 2.4e-32 Smith-Waterman score: 3149; 47.893% identity (56.663% ungapped) in 1163 aa overlap (1-1074:39-1110) 10 20 30 mKIAA0 YIFITVEEFMELEKSGALLESGTYEDNYYG : :.::.::..::.::.::: :::: :::: mKIAA4 AQKEGLILAIGWAFAGTTRSPREGEVPGVDYSFLTVKEFLDLEQSGTLLEVGTYEGNYYG 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TG--QRVKQILDIQGCPGLCEGDLIVEINQQNVQNLSHTEVVDILKDCPVGSETSLIIHR : ::::::.: : :: :::::::.:..::: :.:..:::.: .:: :::..:...: mKIAA4 GGGGQRVKQIVDSPRCRGLKEGDLIVEVNKKNVQALTHNQVVDMLIECPKGSEVTLLVQR 540 550 560 570 580 590 530 540 550 560 570 mKIAA0 GGFFSPWKTPKPM-MDRWENQGSPQTSLSA-----PAVP----QNLP-FPPALHRSSFPD ::. : :.:: . ..: ..:.: : :.:. : : : :: . :: . :: mKIAA4 GGLPVPKKSPKSQPLERKDSQNSSQHSVSSHRSLHTASPSHGIQVLPEYLPA--DAPAPD 600 610 620 630 640 650 580 590 600 610 620 mKIAA0 STEAFDPRKPDPYELYEKSRAIYESRQQVP-PRTSF-------RMDSSG----PDYKELD .:.. .::::.... .::..::.: . : : ... ...:.. .:.: : mKIAA4 QTDSSGQKKPDPFKIWAQSRSMYENRPMSPSPASGLSKGERDREINSTNFGECQNYQEQD 660 670 680 690 700 710 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 VHLRRMESGFGFRILGGDEPGQPILIGAVIAMGSADRDGRLHPGDELVYVDGIPVAGKTH . : : :.:::::::::.:::.:: :: .. .:.:: ::::. ::::. ::: :: ::.: mKIAA4 IFLWRKETGFGFRILGGNEPGEPIYIGHIVPLGAADTDGRLRSGDELICVDGTPVIGKSH 720 730 740 750 760 770 690 700 710 720 730 mKIAA0 RYVIDLMHHAARNGQVNLTVRRKVLCGGEPCPENGRSPGSVSTHHSS--P-------RSD . :..::..::..:.:::::::::. . : :: . :. .:.:::: : :. mKIAA4 QLVVQLMQQAAKQGHVNLTVRRKVVFA-VPKAEN-EVPSPASSHHSSNQPASLTEEKRTP 780 790 800 810 820 740 750 760 770 780 mKIAA0 YATYSNSNHAAPSSNASPP--------EGFASHSLQTSDVVIHRKENEGFGFVIISSLNR .. .. : .. .:... : .: :: :: :.: :::::::::.::..: mKIAA4 QGSQNSLNTVSSGSGSTSGIGSGGGGGSGVVSAVLQPYDVEIRRGENEGFGFVIVSSVSR 830 840 850 860 870 880 790 800 810 820 830 840 mKIAA0 PESGAT-----ITVPHKIGRIIDGSPADRCAKLKVGDRILAVNGQSIINMPHADIVKLIK ::.:.: ...::::::::.:::::::.::::::::::::: :: : :.:::.::: mKIAA4 PEAGTTFGNACVAMPHKIGRIIEGSPADRCGKLKVGDRILAVNGCSITNKSHSDIVNLIK 890 900 910 920 930 940 850 860 870 880 890 900 mKIAA0 DAGLSVTLRIIPQEELNSPTSAPSSEKQSPMAQQHSPLAQQSPLAQPSPATPNSPVAQPA .:: .::::::: .: .. : ..:: . .. : : mKIAA4 EAGNTVTLRIIPGDESSNATLLTNAEKIATITTTH------------------------A 950 960 970 980 910 920 930 940 950 960 mKIAA0 PPQPLQLQGHENSYRSEVKARQDVKPDIRQPPFTDYRQPPLDYRQPPGGDYSQPPPLDYR : : :: ... :. .: .:: . .... : .. mKIAA4 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::::::::.:. mKIAA1 EDCEDGELPYGWEKIEDPQYGTYYVDHLNQ 10 20 30 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 RTQFENPVLEAKRKLQQHNMPHTELGAKPLQAPGFREKPLFTRDASQLKGTFLSTTLKKS .::::::: ::::: : . ..:. . .. :. :::: :::::... ..:::: mKIAA1 KTQFENPVEEAKRKKQ---LGQAEIHSAKTDV----ERAHFTRDPSQLKGVLVRASLKKS 40 50 60 70 80 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 NMGFGFTIIGGDEPDEFLQVKSVIPDGPAAQDGKMETGDVIVYINEVCVLGHTHADVVKL .:::::::::::.::::::::.:. :::::::::. ::::: :: :::::::::::.. mKIAA1 TMGFGFTIIGGDRPDEFLQVKNVLKDGPAAQDGKIAPGDVIVDINGNCVLGHTHADVVQM 90 100 110 120 130 140 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 FQSVPIGQSVNLVLCRGYPLPFDPEDPANSMVPPLAIMERPPPVMVNGRHNYETYLEYIS :: ::..: :::.:::::::: : :::. ..: :: .::. . . . mKIAA1 FQLVPVNQYVNLTLCRGYPLPDDSEDPVVDIVAAT-------PV-INGQSLTKGETCMNT 150 160 170 180 190 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 RTSQSVPDITDRPPHSLHSMPADGQLDGTYPPPVHDDNVSMASSGATQAELMTLTIVKGA . . . :. .: . . .: .:.: : .. .:.::::..: ::.:. ..:: mKIAA1 QDFKLGAMVLDQNGKSGQILASD-RLNG--PSESSEQRASLASSGSSQPELVTIPLIKGP 200 210 220 230 240 250 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 QGFGFTIADSPTGQRVKQILDIQGCPGLCEGDLIVEINQQNVQNLSHTEVVDILKDCPVG .::::.::::::::.::.::: : : :: .::.: :: .::::::.: .::..::. ::: mKIAA1 KGFGFAIADSPTGQKVKMILDSQWCQGLQKGDIIKEIYHQNVQNLTHLQVVEVLKQFPVG 260 270 280 290 300 310 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 SETSLIIHRGGFFSPWKTPKPMMDRWENQGSPQTSLSAPAVPQNLPFPPALHRSSFPDST ... :.: ::: :: :: : : ::.:: .: .. : .:: .::::.. ::. : mKIAA1 ADVPLLILRGGPCSPTKTAKTKTDTKENSGSLET-INEP-IPQPMPFPPSIIRSGSP--- 320 330 340 350 360 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 EAFDPRKPDPYELYEKSRAIYESRQQVPPRTSFRMDSSGPDYKELDVHLRRMESGFGFRI : :: :.: ::...::.. :: : :.::: ::..:::::::. mKIAA1 ------KLDPSEVYLKSKTLYEDK---PPNT-----------KDLDVFLRKQESGFGFRV 370 380 390 400 640 650 660 670 680 690 mKIAA0 LGGDEPGQPILIGAVIAMGSADRDGRLHPGDELVYVDGIPVAGKTHRYVIDLMHHAARNG :::: : : : :::.: .:.:..::::. .:::. .::::: ::.:. :.::: ::::: mKIAA1 LGGDGPDQSIYIGAIIPLGAAEKDGRLRAADELMCIDGIPVKGKSHKQVLDLMTTAARNG 410 420 430 440 450 460 700 710 720 730 740 750 mKIAA0 QVNLTVRRKVLCGGEPCPENGRSPGSVSTHHSSPRSDYATYSNSNHAAPSSNASPPEGFA .: ::::::.. : : ::. .: . : ...::: . : :. .: : :.. mKIAA1 HVLLTVRRKIFYG-EKQPED-ESHQAFS-QNGSPRLNRAEL-------PTRSA-PQEAY- 470 480 490 500 510 760 770 780 790 800 810 mKIAA0 SHSLQTSDVVIHRKENEGFGFVIISSLNRPESGATITVPHKIGRIIDGSPADRCAKLKVG ::...:::::::::::..: ..: :. .::::::.:::::::::. :::: mKIAA1 -------DVTLQRKENEGFGFVILTSKSKPPPGV---IPHKIGRVIDGSPADRCGGLKVG 520 530 540 550 560 820 830 840 850 860 870 mKIAA0 DRILAVNGQSIINMPHADIVKLIKDAGLSVTLRIIPQEELNSPTSAPSSEKQSPMAQQHS :.: :::::::... : .::.::::::..::: .. .:: ..: :. .: .::: : :: mKIAA1 DHISAVNGQSIVDLSHDNIVQLIKDAGVTVTLTVVAEEEHHGPPSGTNSARQSP-ALQHR 570 580 590 600 610 620 880 890 900 910 920 930 mKIAA0 PLAQQSPLAQPSPATPNSPVAQPAPPQPLQLQGHENSYRSEVKARQDVKPDIRQPPFTDY :..: :: :. : . . :.: .. :. ..: mKIAA1 PMGQ----AQ----------ANHIPGDRIALEG-------------EIGRDV----CSSY 630 640 650 940 950 960 970 980 990 mKIAA0 RQPPLDYRQPPGGDYSQPPPLDYRQHSPDTRQYPLSDYRQPQDFDYFTVDMEKGAKGFGF :. :... .:: :: . :. :.. . :..:.: .:::: mKIAA1 RHSWSDHKH-----LAQP----------DTAVISVVGSRHNQSLGCYPVELERGPRGFGF 660 670 680 690 1000 1010 1020 1030 1040 1050 mKIAA0 SIRGGREYKMDLYVLRLAEDGPAIRNGRMRVGDQIIEINGESTRDMTHARAIELIKSGGR :.:::.::.: :..::::::::::..::..:::::.::::: :. .::.::::::..:: mKIAA1 SLRGGKEYNMGLFILRLAEDGPAIKDGRIHVGDQIVEINGEPTQGITHTRAIELIQAGGN 700 710 720 730 740 750 1060 1070 1080 1090 1100 1110 mKIAA0 RVRLLLKRGTGQVPEYGMVPSSLSMCMKSDKHGSPYFYL------LGHPKDTTNPTPGVL .: :::. ::: .:..:..::.: .: ..: . .: :: ::..:. . . mKIAA1 KVLLLLRPGTGLIPDHGLAPSGLCSYVKPEQHKAFRAFLGLSLKRLGD-WDTNSPSSSNV 760 770 780 790 800 810 1120 1130 1140 mKIAA0 -------PLP---------------TWD-IQREHDVRKPKELSAGGQKKQRL--GEQRE- ::: : : . : . .: .::. :.:. : : : mKIAA1 IYDEQPPPLPSSHSASTFEESHVPATEDSLTRVQICEKAEELKDTVQEKKSTLNGSQPEM 820 830 840 850 860 870 1150 1160 1170 1180 1190 1200 mKIAA0 RSASPQRSARPRLEEVPGGQGRPEAGRPASEAADGKEALRGRREGLGAAGAREAEAKVGV . : ... . . : :.:. : .: .: . . ::: . . :..: .. mKIAA1 KYQSVHKTMSKK--DPPRGSGHGEKSRLKGENGVTR---RGRSASPKKSVNRHSEEHL-- 880 890 900 910 920 930 1210 1220 1230 1240 1250 mKIAA0 RSGARPAARPTGGGPARKATMAPGPWKVPGSDKLPGALQPGASAAGR . :: . : .:. mKIAA1 ----EKIPRPLKSDPKEKSRDRSLSPRKGESKGRLTIKAGSGQDPYRKDRGRSSSPKKQQ 940 950 960 970 980 >>mKIAA4187 ( 562 res) mpm05138 (562 aa) initn: 326 init1: 162 opt: 241 Z-score: 147.6 bits: 38.3 E(): 0.0045 Smith-Waterman score: 250; 23.881% identity (27.826% ungapped) in 268 aa overlap (818-1065:31-280) 790 800 810 820 830 840 mKIAA0 ESGATITVPHKIGRIIDGSPADRCAKLKVGDRILAVNGQSIINMPHADIVKLIKDAG--L :: : . . .::. .... . . : mKIAA4 FWRKMPVRKQDTQRALHLLEEYRSKLSQTEDRQLRSSIERVINIFQSNLFQALIDIQEFY 10 20 30 40 50 60 850 860 870 880 890 900 mKIAA0 SVTLRIIPQEELNSPTSAPSSEKQSPMAQQHSPLAQQSPLAQPSPATPNSPVAQPAPPQP ::: :..: . :.. :. .:.. . :: :. . . : : mKIAA4 EVTL-------LDNPKCVDHSKQCEPV----QPVTTWEIASLPSTAVTSETLPGSLSP-P 70 80 90 100 910 920 930 940 950 mKIAA0 LQLQGHENSYRSEVKARQDVKPDIRQ----PPFTDYRQPPLDYRQPPGGDYSQ------- .. ... :: . ..:.. . : .. . :. . : :. mKIAA4 VEKYRYQDE---EVLPPEHISPQVTNEVLGPELVHVSEKNLSEIENVHGFVSHSHISPIK 110 120 130 140 150 160 960 970 980 990 1000 mKIAA0 --PPPLDYRQHSPDTRQYPLSDYRQPQDFDYFTVDMEKGAKGFGFSIRGGREYKM----- :::. . :. . : :..: . .:.: .:.:::: :: . mKIAA4 ANPPPVLV---NTDSLETPTYVNGTDADYEYEEITLERGNSGLGFSIAGGTDNPHIGDDS 170 180 190 200 210 220 1010 1020 1030 1040 1050 1060 mKIAA0 DLYVLRLAEDGPAIRNGRMRVGDQIIEINGESTRDMTHARAIELIKSGGRRVRLLLKRGT .... .. : : ..::.::.: :...: ..::.::..:.: .: .: ::: .:: mKIAA4 SIFITKIITGGAAAQDGRLRVNDCILRVNEADVRDVTHSKAVEALKEAGSIVRLYVKRRK 230 240 250 260 270 280 1070 1080 1090 1100 1110 1120 mKIAA0 GQVPEYGMVPSSLSMCMKSDKHGSPYFYLLGHPKDTTNPTPGVLPLPTWDIQREHDVRKP mKIAA4 PASEKIMEIKLIKGPKGLGFSIAGGVGNQHIPGDNSIYVTKIIEGGAAHKDGKLQIGDKL 290 300 310 320 330 340 >>mKIAA1232 ( 950 res) mbg05359 (950 aa) initn: 326 init1: 133 opt: 243 Z-score: 146.1 bits: 38.8 E(): 0.0054 Smith-Waterman score: 308; 22.108% identity (28.653% ungapped) in 683 aa overlap (548-1191:181-746) 520 530 540 550 560 570 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