# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg00521.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0203.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0203, 1467 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7897292 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4177+/-0.000201; mu= 9.5106+/- 0.011 mean_var=143.5245+/-27.520, 0's: 34 Z-trim: 144 B-trim: 5 in 1/66 Lambda= 0.107056 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|148682314|gb|EDL14261.1| RB1-inducible coiled-c (1588) 8227 1283.9 0 gi|187956415|gb|AAI50775.1| RB1-inducible coiled-c (1588) 8227 1283.9 0 gi|81868393|sp|Q9ESK9.2|RBCC1_MOUSE RecName: Full= (1588) 8205 1280.5 0 gi|149060966|gb|EDM11576.1| RB1-inducible coiled-c (1588) 7896 1232.7 0 gi|109086354|ref|XP_001102539.1| PREDICTED: simila (1542) 7416 1158.6 0 gi|109086352|ref|XP_001102620.1| PREDICTED: simila (1594) 7416 1158.6 0 gi|114620092|ref|XP_519756.2| PREDICTED: Rb1-induc 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