FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1294.ptfa, 667 aa vs ./tmplib.26680 library 1768350 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4876+/-0.00581; mu= -5.3423+/- 0.385 mean_var=254.6466+/-60.530, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0804 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1013 ( 989 res) mpg00833 ( 989) 679 92 3e-19 >>mKIAA1013 ( 989 res) mpg00833 (989 aa) initn: 609 init1: 338 opt: 679 Z-score: 437.8 bits: 91.9 E(): 3e-19 Smith-Waterman score: 1043; 35.714% identity (40.780% ungapped) in 644 aa overlap (1-638:362-931) 10 20 30 mKIAA1 LLSSGSQESDSSQSAKKDMLAALKSRQEAL :.:::::.:.. . :.. . ::.... : mKIAA1 MDLTETGTQRGSKLVTLEAKSQFIMASNGSLISSGSQDSEGMEEQKREKILELKKKEKLL 340 350 360 370 380 390 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 EETLRQRLEELKRLCLREAELTGKLPVEYPLDPGEEPPIVRRRIGTAFKLDEQKILPKGE .: : :..::::..:::::::::..: ::::. ::.:: ::::.::.::::.. .:: : mKIAA1 QEKLLQKVEELKKICLREAELTGRMPKEYPLNIGEKPPQVRRRVGTTFKLDDN-LLPTEE 400 410 420 430 440 450 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 EAELERLEREFAIQSQITEAARRLASDPNVSKKLKKQRKTSYLNALKKLQEIENAINENR . :..:: .: ::....:::..:::.:.. : .::.:: .: .:.:.::::::.::: : mKIAA1 DPALQELESNFLIQQKLVEAAKKLASEPDLCKTVKKKRKQDYTDAVKRLQEIENSINEYR 460 470 480 490 500 510 160 170 180 190 200 mKIAA1 IKSGKKPTQRASLVIDDGNIASEDSSLSDALVLED-EDSQVTSTISPLQSPHKGLPPRPP :. ::::.:.:..: . : ::.:::::. . .: .:: . . : . ::. :: mKIAA1 IRCGKKPSQKAAVVPPEDIIPSESSSLSDTTTYDDPNDSFTLAGQRPSSVPHS---PRIL 520 530 540 550 560 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 SSHNRPPPPQSLEGLRQLHYHRTDYDKSPLKPKMWSESSLDEPYEKVKKRSSHGHSSSHK ::.:: :....:... ::..: . . : :. :.: mKIAA1 -------PPKSL-GIERIHFRK---------------SSINEQF--MDTRHSREMLSTH- 570 580 590 600 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 RFPSTGSCTEAGVSSSLQNSPIRSLPHW-NSQSSMPSTPDLRVRSPHYVHSTRSVDISPT .:: ..: . .. :::.:: : .:. . : . : mKIAA1 ------------------SSPYKTLERRPQGGRSMPTTPVL-TRNAY-----SSSHLEPD 610 620 630 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 RLHSLALHFRHRSSSLESQGKLLGSENDTGSPDFYTPRTRSSNGSDPMDDCSSCTSHSSS : . : :.::.:::::..:: :: :. .: : ... :.... .:: :: ::.::: mKIAA1 ---SSSQHCRQRSGSLESQSHLL-SEMDSDKPFFTLSKSQRSSSTEILDDGSSYTSQSSS 640 650 660 670 680 690 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 EHY--YPAQMNANYSTLAEDSPSKARQRQRQRQRAAGALGSASSGSMPNLAARSGAASTG :.: :: . :.: . :. .:: :.:..... .....:::::::: .. . mKIAA1 EYYCVTPAA-SPYYTTQTLDT--RARGRRRSKKHS---VSTSNSGSMPNLAQKDPLRN-- 700 710 720 730 740 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 GGVYLHSQSQPSSQYRIKEYPLYIEGSATPVVVRSLESDQEGHYSVKAQFKTSNSYTAGG ::: ..:. : : : : :: : : . :.: ::.:::. ....: : : mKIAA1 -GVYSKGQDPPPSGYYIAGYPPYAECDLYYSGGYVYENDTEGQYSVNPSYRSSAHY--GY 750 760 770 780 790 800 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 LFKESWRGGGDEGDAGRLTPSRSQILRTP-SLGRDGAH-DKGSGRAAVSDELRQWYQRST .... . : .. :. . :: : . . . : :. .: :...:: :::: mKIAA1 DRQRDYSRSFHEDEVDRVPHNPYATLRLPRKAAVKSEHITKNIHKALVAEHLRGWYQR-- 810 820 830 840 850 860 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 ASHKEHSRLSHTSSTSSDSGSQYSTSSQSTFVAHSRVTRMPQMCKATSAALPQSQRSSTP :: .. . : .: .:: ::: . . : : .: .. ...:. . :.. mKIAA1 ASGQKDQGHSPQTSFDSDRGSQRCLGFAGLQVPCSPSSRASSYSSVSSTNASGNWRTQLT 870 880 890 900 910 920 630 640 650 660 mKIAA1 SSEIGATPPSSPHHILTWQTGEATENSPIMDGSESPTHQSTDE :: . .: : mKIAA1 ---IGLSEYENPVHSPYTSYYGSIYNPLSSPSRQYAETTPLDGTDGSQLEDNLEGSEQRL 930 940 950 960 970 667 residues in 1 query sequences 1768350 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:40:05 2006 done: Mon Mar 27 10:40:06 2006 Scan time: 0.860 Display time: 0.040 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]