FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0325.ptfa, 1999 aa vs ./tmplib.26680 library 1767018 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7173+/-0.00617; mu= 21.9111+/- 0.412 mean_var=173.2251+/-41.243, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 67 in 2/34 Lambda= 0.0974 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1997 ( 1226 res) mtj02423 (1226) 1412 213 4.7e-55 mKIAA3028 ( 1661 res) mtg01195 (1661) 1284 195 1.4e-49 mKIAA1697 ( 814 res) mbp07135 ( 814) 512 86 4.8e-17 mKIAA1603 ( 871 res) mbp01081 ( 871) 362 65 1.1e-10 mKIAA0357 ( 1471 res) mbg05391 (1471) 278 53 5.1e-07 >>mKIAA1997 ( 1226 res) mtj02423 (1226 aa) initn: 1483 init1: 664 opt: 1412 Z-score: 1080.7 bits: 212.8 E(): 4.7e-55 Smith-Waterman score: 1809; 28.831% identity (30.595% ungapped) in 1266 aa overlap (738-1984:1-1212) 710 720 730 740 750 760 mKIAA0 SAEEISDAIREKMKKNYMSNPSYNYEIVNRASLACGPMVKWAIAQLNYADMLKRVEPLRN :: : .:.. :. :...:. .:.:..::.. mKIAA1 ASTAAAPLAAWVKANVQYSHVLERIQPLET 10 20 30 770 780 790 800 810 820 mKIAA0 ELQKLEDDAKDNQQKANEVEQMIRDLEASIARYKEEYAVLISEAQAIKADLAAVEAKVNR : . :: . : .... ..:... .. .... ::.. ::: ..:... .. .. mKIAA1 EQSGLELNLKKTEDRKRKLEDLLNSVGQKVSELKEKFQSRTSEAAKLEAEVSKAQETIKA 40 50 60 70 80 90 830 840 850 860 870 880 mKIAA0 STALLKSLSAERERWEKTSETFKNQMSTIAGDCLLSAAFIAYAGYFDQQMRQNLFTTWSH . .:...:. :..::. . ....:. :.::::.: . . .:.: . :. mKIAA1 AEVLISQLDREHRRWNAQVAEIAEELATLPKRAQLAAAFITYLSAAPEGLRKNCLEEWT- 100 110 120 130 140 890 900 910 920 930 940 mKIAA0 HLQQANIQFRTDIARTEYLSNADERLRWQASSLPADDLCTENAIMLKRFNRYPLIIDPSG . :... . :. : .: . .:.: :.. .::.::: :::... . :..::::. mKIAA1 --KAAGLE-KFDLRR--FLCTESEQLIWKSEGLPSDDLSIENALVILQSRVCPFLIDPSS 150 160 170 180 190 200 950 960 970 980 990 1000 mKIAA0 QATEFIMNEYKDRKITRTSFLDDAFRKNLESALRFGNPLLVQDVESYDPVLNPVLNREVR ::::.. .. :: .. . :. : :: :.:::. :..:.... .::: :.: :.. mKIAA1 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HQVAMGQGQA-DLAIQMLKECARNGDWLCLKNLHLVVSWLPVLEKELNTLQPKDSFRLWL 670 680 690 700 710 720 1480 1490 1500 1510 1520 1530 mKIAA0 TMEINPKVPVNLLRAGRIFVFEPPPGVKANMLRTFSSIPVSRICKSPN-ERARLYFLLAW : :..:. ::... ...: :::.: :..::. : .: : : .::. : ::: mKIAA1 TAEVHPNFTPILLQSSLKITYESPPGLKKNLMRTYESWTPEQISKRDNIHRAHALFSLAW 730 740 750 760 770 780 1540 1550 1560 1570 1580 1590 mKIAA0 FHAIIQERLRYAPLGWSKKYEFGESDLRSACDTVDTWLDDTAKGRQNISPDKIPWSALKT ::: ::: : : ::.: :::. ::::.. ..: .: : .... : .. mKIAA1 FHAACQERRNYIPQGWTKFYEFSLSDLRAGYHVIDRLFD----GTKDVQ-----WEFVHG 790 800 810 820 830 1600 1610 1620 1630 1640 1650 mKIAA0 LMAQSIYGGRVDNEFDQRLLNTFLERLFTTRSFDSEFKLACKVDGHKDIQMPDGIRREEF :. .::::::::: :: :.:...:...:.. .: . : .:..:.. .. mKIAA1 LLENSIYGGRVDNYFDLRVLQSYLKQFFNSSIIDVLNQRNKKSIFPYSISLPNSCSILDY 840 850 860 870 880 890 1660 1670 1680 1690 1700 1710 mKIAA0 VQWVELLPDAQTPSWLGLPNNAERVLLTTQGVDMISKMLKMQM-LEDEDDLAYAETEKKA .: ::. . ::..::: : : ..: :::... :. . .. : . ... mKIAA1 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KFVASWKGRLQEAKLQIKISGLLLEGCSFDGNRLSENQHDSPSVSSVLP-CYMGWTPQGS 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1960 1970 1980 1990 mKIAA0 --AEKKASVVTLPVYLNFTRADLIFTVDFEIATKEDPRSFYERGVAVLCTE . ..:::: . : .. ..: . ..: mKIAA1 YGPYSPDECISLPVYTSAERERVVTNIDVPCGGNQDQWIQCGAALFLKNQ 1180 1190 1200 1210 1220 >>mKIAA3028 ( 1661 res) mtg01195 (1661 aa) initn: 1414 init1: 381 opt: 1284 Z-score: 982.3 bits: 195.0 E(): 1.4e-49 Smith-Waterman score: 2019; 28.800% identity (30.603% ungapped) in 1375 aa overlap (10-1354:308-1631) 10 20 30 mKIAA0 VVLAPVQLGKWLVLFCDEINLPDMDKYGTQRVISFIRQM : :. : :..:.:..::::: ..::: mKIAA3 NFYTTSAMLQGVLEKPLEKKSGRNYGPPGTKKLIYFIDDMNMPEVDKYGTVAPHTLIRQH 280 290 300 310 320 330 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 VEHGGFYRTSDQTWVKLERIQFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPVVYVDYPGPASLTQ ..: .: . : .. :.: :: ::. : .. :. :: : :..:: .::. mKIAA3 MDHRHWYDRQKLTLKDVHNCQYV-ACMNPTS-GSFTIDPRLQRHFCVFAVSFPGQEALTS 340 350 360 370 380 390 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 IYGTF--NRAMLRLIPSL--RTYAEPLTAAMVEFYTMSQERFTQDTQPHYIYSPREMTRW ::.:. .. .: : . : .. .:::.. .: . . :::.. :... mKIAA3 IYNTILAQHLSFRSAPLVIQRLSSHLVTAALALHQKVSATFLPTAIKFHYIFNLRDLSNI 400 410 420 430 440 450 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 VRGIFEALRPLETLPVEGLIRIWAHEALRLFQDRLVEDEERRWTDENIDMVALKHF-PNI .::. . . :.. :.:.: ::: :.. :..: ::. . : . . ....:.: .. mKIAA3 FQGILFSTAEILKTPLD-LVRLWLHEAERVYGDKMV-DEKDQETLHRVTIASVKKFFDDL 460 470 480 490 500 510 220 230 240 250 260 mKIAA0 DKEKAMSRPILYSNWLS----KDYIPV-DQEELRDYVKARLKVFYEEELDVPLVLFNEVL .:. ...: .. .. . :.:: : .: .: : . : . . ::::.... mKIAA3 GEENLFAKPNIFCHFTQGIGDPKYFPVTDVAQLNKLLKDVLDSYNEVNAVMNLVLFEDAV 520 530 540 550 560 570 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 DHVLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGKTTLSRFVAWMNGLSVYQIKVHRKYTGEDFDEDL :. .:.::...:.:. ::.::.:.:: .:::..:....:.:.:: ... :. :. :: mKIAA3 AHICKINRILESPRGNALLVGVGGSGKQSLSRLAAYISALDVFQITLKKGYAIPDLKMDL 580 590 600 610 620 630 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 RTVLRRSGCKNEKIAFIMDESNVLDSGFLERMNTLLANGEVPGLFEGDEYATLMTQCKEG : .:. :: .:.: .:.: . :: .: :::.::.:::: .. ..... . mKIAA3 ATQYIKSAVKNVPSVFLMTDSQVAEEQFLVLINDLLASGEIPGLFGDEDLENIISSMRPQ 640 650 660 670 680 690 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 AQKEGLMLDSHEELYKWFTSQVIRNLHVVFTMNPSSEGLKDRAATSPALFNRCVLNWFGD ... :. :..: .:.: .: :.:.:.. ..: . :. :: ::. : ..::: . mKIAA3 VKSLGIA-DTREACWKFFIEKVRRQLKVILCFSPVGSVLRVRARKFPAVVNCTAINWFHE 700 710 720 730 740 750 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 WSTEALYQVGKEFTSKMDLEKPNYIVPDYMPVVYDKLPQPPTHREAIVNSCVFVHQTLHQ : .:: .:. .: ::. . : :. . .: ..:: :... mKIAA3 WPEDALVSVSARF-----LEETEGIEPEV--------------KTSISLFMAYVHTTVNE 760 770 780 790 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 ANARLAKRGGRTMAITPRHYLDFINHYANLFHEKRSELEEQQMHLNVGLRKIKETVDQVE . : ::. .:. :. : ::. .:: :: . .:. :: :.. :..::. mKIAA3 MSKIYLTIERRYNYTTPKTFLEQIKLYQNLLAKKRMELVAKIERLENGLMKLQSTASQVD 800 810 820 830 840 850 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 ELRRDLRIKSQELEVKNAAANDKLKKMVK-DQQEAEKKKVMSQEIQEQLHKQQEVIADKQ .:. : .. ::. :: : ::: ..: . ... :.:....: . ... .. ...:: mKIAA3 DLKAKLAVQETELKQKNENA-DKLIQVVGVETEKVSKEKAIADEEEMKVEVINKNVTEKQ 860 870 880 890 900 910 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 MSVKEDLDKVEPAVIEAQNAVKSIKKQHLVEVRSMANPPAAVKLALESICLLL---GEST . . :: :.:::.. ::.:. ...:..:.:..:...:: :: . .. .: :. mKIAA3 KACETDLAKAEPALLAAQEALDTLNKNNLTELKSFGSPPDAVVNVTAAVMILTAPGGKIP 920 930 940 950 960 970 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 TD--WKQIRSIIMR-ENFIPTIVNFSAEEISDAIREKMKKNYMSNPSYNYEIVNRASLAC : :: . .. . ..:. .. .:. :.: .: . .: :..::... :.. : : mKIAA3 KDKSWKAAKIMMGKVDTFLDSLKKFDKEHIPEACLKAFKP-YQGNPTFDPEFIRSKSTAA 980 990 1000 1010 1020 1030 750 760 770 780 790 800 mKIAA0 GPMVKWAIAQLNYADMLKRVEPLRNELQKLEDDAKDNQQKANEVEQMIRDLEASIARYKE . . .: : . . .. : : :. :.. . . . :.: ..... : .:.:... mKIAA3 AGLCSWCINIVRFYEVYCDVAPKRQALEEANAELAEAQEKLSRIKNKIAELNANLSNLTS 1040 1050 1060 1070 1080 1090 810 820 830 840 850 860 mKIAA0 EYAVLISEAQAIKADLAAVEAKVNRSTALLKSLSAERERWEKTSETFKNQMSTIAGDCLL . .: . . :.. .. .. :. .:..: :: .. :.::.: :. :: :: mKIAA3 AFEKATAEKIKCQQEADATNRVISLANRLVGGLASENVRWAESVENFKSQGVTLCGDVLL 1100 1110 1120 1130 1140 1150 870 880 890 900 910 mKIAA0 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