FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1115.ptfa, 774 aa vs ./tmplib.26680 library 1768243 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1950+/-0.00802; mu= -13.6415+/- 0.530 mean_var=375.6424+/-92.272, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0662 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1558 ( 502 res) mbg17170 ( 502) 1321 140 5.4e-34 mKIAA0685 ( 814 res) mid13080 ( 814) 614 73 1.6e-13 >>mKIAA1558 ( 502 res) mbg17170 (502 aa) initn: 1573 init1: 1318 opt: 1321 Z-score: 702.7 bits: 140.2 E(): 5.4e-34 Smith-Waterman score: 1427; 48.310% identity (62.148% ungapped) in 503 aa overlap (10-412:1-491) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 APSARSRRPPAQGAMFWKFDLHTSSHLDTLLEKEDLSLPELLDEEDVLQECKVVNRKLLD : .::::::::.:::.:::::.::..: ::.::::::::::. ::::.. mKIAA1 PCFQSMFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 FLLQPSHLQAMVAWVTQEPPASGEERLRYKYPSVACEILTSDVPQINDALGADESLLNRL :::. :. .:... .::: . .:..:::::...::.::::: :.:: :: ::::: .: mKIAA1 FLLKAECLEDLVSFIIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 mKIAA1 YGFLQSGDSLNPLLASFFSKVMGILINRKTDQLVSFLRKKDDFVDLLLRHIGTSAIMDLL :.:: . . ::::::::::::..:::.:: .:.:.::.:: :::::...::::::::::: mKIAA1 YSFLLNESPLNPLLASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKRDFVDLIIKHIGTSAIMDLL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 mKIAA1 LRLLTCVERPQLRQDVFNWLNEEKIVQRLIEQIHPSKDDNQHSNASQSLCDIIRLSREQM ::::::.: :: ::::.::::::.:.:::.: .:::.....:::::::::.:.::::.:: mKIAA1 LRLLTCIEPPQPRQDVLNWLNEERIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQM 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 IQGQDSPEPDQLLATLEKQETIEQLLSNMFEGEQCQSVIVSGIQVLLTLLEPRRPRSDSV .: :.: ::: ::::::::: :::::::.:. :. .:.:::.::.:::::: ::: mKIAA1 LQVQNSTEPDPLLATLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRP----- 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 mKIAA1 TMNNFFSSVDGQLELLAQGALDNALS-SMGALHALRPRLDRFHQLLLEPPK--------- . .:..:. : .: : . ..:.:.: :: ::.::::::: mKIAA1 -------TFEGHIEICPPGMSHSACSVNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPKKSVMKTTWG 290 300 310 320 330 mKIAA1 --------------------VQ-------------------------------------- .: mKIAA1 ILDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTSSINGDLMELNSIGVILDMFFKYTWNNFLHTQVEI 340 350 360 370 380 390 360 370 380 mKIAA1 --------------------------------LLQHCRLVERILASWEENDRVQSGGGPR :.:.:.:.:::: .:. :.. :. :: : mKIAA1 CIALILASPFENAENGTITDQDSTGDNLLLKHLFQKCQLIERILEAWDTNEKKQAEGGRR 400 410 420 430 440 450 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 KGYMGHLTRVANAVVQNAEQGPNAEQLGQLLKELPEEQQQRWEAFVSGPLAETNKKNTVD .::::::::.:: .:.....:::. . ::.: mKIAA1 HGYMGHLTRIANCIVHSTDKGPNSALVQQLIKGKLVNNLITCV 460 470 480 490 500 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 LVNTHHLHSSSDDEDDRLKEFNFPEEAVLQQAFMDFQMQRMTSAFIDHFGFNDEEFGEQE >>mKIAA0685 ( 814 res) mid13080 (814 aa) initn: 1556 init1: 614 opt: 614 Z-score: 335.1 bits: 72.9 E(): 1.6e-13 Smith-Waterman score: 1291; 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