# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg00352.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0324.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0324, 1754 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7881182 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6438+/-0.000234; mu= 4.7161+/- 0.013 mean_var=286.1808+/-54.015, 0's: 29 Z-trim: 149 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.075815 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|126157504|ref|NP_780438.2| serine/arginine repe (2607) 11357 1258.1 0 gi|26354955|dbj|BAC41104.1| unnamed protein produc (2607) 11353 1257.6 0 gi|114152161|sp|Q8BTI8.2|SRRM2_MOUSE RecName: Full (2703) 11353 1257.7 0 gi|109487812|ref|XP_220207.4| PREDICTED: similar t (2707) 10879 1205.8 0 gi|143928063|sp|Q9UQ35.2|SRRM2_HUMAN RecName: Full (2752) 8870 986.1 0 gi|168272954|dbj|BAG10316.1| serine/arginine repet (2752) 8870 986.1 0 gi|5821153|dbj|BAA83718.1| RNA binding protein [Ho 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