FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1206.ptfa, 1374 aa vs ./tmplib.26680 library 1767643 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8363+/-0.00487; mu= 14.6282+/- 0.325 mean_var=118.4071+/-27.175, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 16 in 1/35 Lambda= 0.1179 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0620 ( 1746 res) mpf00920 (1746) 1373 246 6.1e-65 mKIAA0407 ( 1207 res) mpm02292 (1207) 1305 234 1.4e-61 mKIAA0315 ( 1299 res) mbg03309 (1299) 1132 204 1.1e-52 mKIAA4053 ( 1400 res) mbg07434 (1400) 852 157 2.4e-38 mKIAA0463 ( 1529 res) mbg07539 (1529) 818 151 1.4e-36 mKIAA4078 ( 609 res) mic26093 ( 609) 812 150 1.5e-36 mKIAA1550 ( 199 res) mfj03098 ( 199) 643 120 3.2e-28 mKIAA1745 ( 871 res) mid29072 ( 871) 228 51 1.5e-06 >>mKIAA0620 ( 1746 res) mpf00920 (1746 aa) initn: 2207 init1: 690 opt: 1373 Z-score: 1258.3 bits: 245.6 E(): 6.1e-65 Smith-Waterman 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.:. :::: .::::..: mKIAA0 LLGEWNIPEHCRPSMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHALEQQKDFAVRDRCSLASLLTIA 1220 1230 1240 1250 1260 1270 910 920 930 940 950 960 mKIAA1 LHSKLEYLTDIMRTLLGDLAAHYVHKNPKLMLRRTETMVEKLLTNWLSICLYTFLKEVAG ::.:::: :.::. :: :: . :::::::::::..:::.::::.:::.: :.:..: mKIAA0 LHGKLEYYTSIMKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVVEKMLTNWMSICMYGCLRETVG 1280 1290 1300 1310 1320 1330 970 980 990 1000 1010 1020 mKIAA1 EPLYMLFRAIKYQVDKGPVDAVTGKAKRTLNDSHLLREDVEFQPLTLMALVGPEADRAAG ::...:. ::: :..:: .::.::::. :::. ::::..: .: .: . . mKIAA0 EPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLNEEWLLRENIEAKPRNL--------NVSFQ 1340 1350 1360 1370 1380 1030 1040 1050 1060 1070 1080 mKIAA1 NSGVHRVPARVLDTDTITQVKEKVLDQIYKGTPFSQRPSVHSLDVP----DGATVVL--- . :. . .:..::::.::::::.:. . :..:.:: : ....:. . . :: mKIAA0 GCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYVLRDL 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1090 1100 1110 1120 mKIAA1 --IPQVHNGGTVSQSLGQTGCPSGENTPM-LEDGEE---GGVR------LWHLVKATEE- :..: ..:.. : : . : : : .. : :. .::: :.: mKIAA0 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mKIAA0 AHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALM 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1370 mKIAA1 EYKVTDL : .. mKIAA0 ENNIYECYSEA 1740 >>mKIAA0407 ( 1207 res) mpm02292 (1207 aa) initn: 2929 init1: 1116 opt: 1305 Z-score: 1197.8 bits: 233.9 E(): 1.4e-61 Smith-Waterman score: 2990; 45.535% identity (56.262% ungapped) in 1243 aa overlap (332-1374:2-1207) 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 YGEHCPEGEKAVYSAQEVDILVRGPEACPQVEGLASPQLVPVGWESHVTLHIQNLHYFQG :: . . :.:: : .: :. .:: :: mKIAA0 CVETVQGSLLIPVHVEREVQLRGRNLWLFQD 10 20 30 370 380 390 400 410 mKIAA1 LPALYHCWLELPGKLQKLPASLEETSRDSGLIH--CQAQQFYPSMSQWELPVPIYVTRGE : .: ::: .. . :..: . . : :: .:: . :: : ... . mKIAA0 GPRSSECVLELGSREVAVEAQVECAPPPDVWCHIKCQQHQFSYEALKPELQVGLFLRWAG 40 50 60 70 80 90 420 430 440 450 460 470 mKIAA1 IQRLDNAGDLHVTLYDCAMGHPDCSHCQAANGSLSCLWCGDGQPACRYGPLCPPG-AVEQ :.:.: :::.::::..:: :::.::.: . .:.:: .: : : . .: mKIAA0 GLRVDSADGLHVVLYDCSVGHGDCSRCQTAMPQYDCVWCEGERPRCVAREACNEAETVAT 100 110 120 130 140 150 480 490 500 510 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:::::.::::: : :. ::.:::..:..::::::.::::: .::::::. ::: mKIAA0 SDQEMNSVLAELSRNCSADLGARVALHELYKYINKYYDQIITALEEDGTAQKMQLGYRLQ 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1370 mKIAA1 QVAALVEYKVTDL :.:: :: ::::: mKIAA0 QIAAAVENKVTDL 1200 >>mKIAA0315 ( 1299 res) mbg03309 (1299 aa) initn: 2128 init1: 952 opt: 1132 Z-score: 1038.4 bits: 204.5 E(): 1.1e-52 Smith-Waterman score: 2166; 33.567% identity (39.734% ungapped) in 1424 aa overlap (47-1374:1-1299) 20 30 40 50 60 70 mKIAA1 YPCGDEHTPSPIAGRQPLEAQPLLQLGQSISAVAALQTDGHTIAFLGDTQGQLHKVFLNS .::.. . ::.:::: ..:.. ::.: mKIAA0 TAVTVTAENDHTVAFLGTSDGRILKVYLAP 10 20 30 80 90 100 110 120 130 mKIAA1 SHGQVYHSQQVGPPGSAISPDLLVDSNGDHLYVLTAQQVDRILVAACPQFPNCTTCLQAR . .. ... .. :. :: ...: . ::..: ..: :. : : .. .:. : ... mKIAA0 DGTSAEYGSIPVDINKKIKQDLALSGNLSSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYVTCAQCRDSQ 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 mKIAA1 DPLCGWCILQGRCTRRGECGRAAQPNHWLWSYEDNHCPYIQSLLPAQHPRQEQGQIILSV :: ::::...:::::..::.:: . .::::: : . : : . .: . :. ::.. ::: mKIAA0 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:::.:::::...::.::::... :: :::: :::::.::. ::: :..:::.::.: mKIAA4 SKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAIT 930 940 950 960 970 980 1000 1010 1020 1030 1040 1050 mKIAA1 GKAKRTLNDSHLLREDVEFQPLTLMALVGPEADRAAGNSGVHRVPARVLDTDTITQVKEK :.:. .:....:.:...... ::: :.:: . : .::.. :. ::.:::::: mKIAA4 GEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLNC-VNPEHENAP------EVPVKGLNCDTVTQVKEK 990 1000 1010 1020 1030 1060 1070 mKIAA1 VLDQIYKGTPFSQRPSVHSLD------------------------------------VPD .:: .:::.:.::::.. ..: : : mKIAA4 LLDAVYKGVPYSQRPKAGDMDLEWRQGRMARIILQDEDVTTKIDNDWKRLNTLAHYQVTD 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1080 1090 1100 1110 1120 mKIAA1 GATVVLIPQ------VHNGGTVSQSLGQ-------TGCPSG--ENTPMLEDGEEGGVRLW :..:.:.:. . :..: ..::.. .. :.. :::. :.:..:: mKIAA4 GSSVALVPKQTSAYNISNSSTFTKSLSRYESMLRTASSPDSLRSRTPMITPDLESGTKLW 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1130 1140 1150 1160 1170 1180 mKIAA1 HLVKATEEAEGAKVRRSSLRDRERERSRAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDTFQAILS :::: .. : .:: .:. .: . ::::::::. :::::::::: :..:.: mKIAA4 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