FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0606.ptfa, 1318 aa vs ./tmplib.26680 library 1767699 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0319+/-0.00714; mu= -6.8796+/- 0.471 mean_var=341.5846+/-84.747, 0's: 0 Z-trim: 19 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0694 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0862 ( 584 res) mpj01572 ( 584) 415 56 2e-08 mKIAA4018 ( 606 res) mej02761 ( 606) 374 52 3.5e-07 mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694) 316 47 4e-05 mKIAA1225 ( 1401 res) mbg04842 (1401) 289 44 0.00023 mKIAA4175 ( 360 res) mfj00074 ( 360) 251 40 0.0012 mKIAA1365 ( 1497 res) mbg05137 (1497) 260 41 0.0018 >>mKIAA0862 ( 584 res) mpj01572 (584 aa) initn: 286 init1: 173 opt: 415 Z-score: 243.7 bits: 56.2 E(): 2e-08 Smith-Waterman score: 477; 26.964% identity (29.330% ungapped) in 471 aa overlap (268-728:90-532) 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 HLPANLFYSQDLTHLNLKQNFLRQTPTLPAARGLGELQRFTKLKS--LNLSNNHLGAFPS :. . ::.. . .: :.::. . .: mKIAA0 SAAQPGVAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMRLDLSKRSIHILPP 60 70 80 90 100 110 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 AVCSIPTLAELNVSCNALREVPAAVGDMQNLQTFLLDGNFLQSLPAELESMHQLSYLGLS .: . :.:: . : :. .:: :: . ::.:. :. : : ::: :.....: .: : mKIAA0 SVKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLR 120 130 140 150 160 170 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 FNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMAGNCVETLRLQALRRMPHIKHVDLRLNILRKLMADEVD :.. .:: :. .: .. : . : . :.. . .. .:... ...: : ...: : :. mKIAA0 HNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVE-KDIKNLPKLSMLSIRENKIKQLPA-EIG 180 190 200 210 220 230 420 430 440 450 460 470 mKIAA0 FVQHVTQLDLRDNKLGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLNVCGYFLKALYASSNELAQL- . .. ::. :.: : :. .: .:...:.. . :.: .: mKIAA0 ELCNLITLDVAHNQLEHLPK------EIGNC--TQITNLDL----------QHNDLLDLP 240 250 260 270 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 DVYPVPNYLSYMDVSRNCLESVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCN-SSLRKLL :. . :. . . : : ..:. . . :: :.. .:.: :: :. . .: .: mKIAA0 DTIGNLSSLNRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLT 280 290 300 310 320 330 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 AGHNRLARLPER--LERTSVEVLDVQHNQITELPPNLLMKADSLRFLNASANKLETLPPA ..: . : . ... :...::.:...: ... .: : :: . :.: .:: mKIAA0 LARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLP-- 340 350 360 370 380 390 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 TLSEETSSILQELYLTNNCLTDKCVPL-LTGHPRLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELE :. : . . :: :..: :: .: ..: :..: .. : :...: . ...:..:. mKIAA0 -LDFGTWTSMVELNLATNQLTK--IPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHG-LGNLRKLR 400 410 420 430 440 450 660 670 680 690 700 mKIAA0 EIDISGNKLKAIPTTIMNCRRMHTVIAHSNCIEVFPE-VMQLPEVKCVDLSCNELSEITL :.:. :::...:. : . .. .. .: . ..:. . .: .. . :. : :.. : mKIAA0 ELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLSTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTH--L 460 470 480 490 500 510 710 720 730 740 750 760 mKIAA0 PENLP--PKLQELDLTGNPRLALDHKSLELLNNIRCFKIDQPSAGDASGAPAVWSHGYTE ::.. .:.:: :. :: : mKIAA0 PEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFII 520 530 540 550 560 570 >>mKIAA4018 ( 606 res) mej02761 (606 aa) initn: 271 init1: 149 opt: 374 Z-score: 221.3 bits: 52.1 E(): 3.5e-07 Smith-Waterman score: 394; 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