# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg00096.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1011.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1011, 1666 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7914331 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8147+/-0.000193; mu= 12.7732+/- 0.011 mean_var=100.8772+/-19.563, 0's: 36 Z-trim: 64 B-trim: 452 in 1/65 Lambda= 0.127696 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|50370122|gb|AAH76568.1| Syne2 protein [Mus musc (2152) 10908 2021.6 0 gi|148704524|gb|EDL36471.1| mCG10044, isoform CRA_ (1541) 10081 1869.1 0 gi|118918407|ref|NP_878918.2| spectrin repeat cont (6907) 8663 1608.4 0 gi|194225084|ref|XP_001916097.1| PREDICTED: spectr (6871) 8613 1599.2 0 gi|119223888|gb|AAI26523.1| Unknown (protein for I (1999) 8289 1539.1 0 gi|52221184|gb|AAH82586.1| Syne2 protein [Mus musc (1874) 7920 1471.1 0 gi|145699091|ref|NP_001005510.2| synaptic nuclear 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