# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg00065.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0874.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0874, 899 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7918930 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9664+/-0.000187; mu= 9.5589+/- 0.010 mean_var=91.0350+/-17.435, 0's: 34 Z-trim: 45 B-trim: 145 in 1/66 Lambda= 0.134422 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|148706368|gb|EDL38315.1| ankyrin repeat domain (2041) 5894 1154.0 0 gi|149037368|gb|EDL91799.1| ankyrin repeat domain (2047) 5322 1043.1 0 gi|73962034|ref|XP_859546.1| PREDICTED: similar to (2038) 4749 931.9 0 gi|73962032|ref|XP_537329.2| PREDICTED: similar to (2061) 4749 931.9 0 gi|149720807|ref|XP_001488000.1| PREDICTED: ankyri (2055) 4665 915.7 0 gi|52545871|emb|CAH56382.1| hypothetical protein [ (2039) 4659 914.5 0 gi|74273592|gb|AAS45545.2| ankyrin repeat-containi (2039) 4659 914.5 0 gi|38638919|gb|AAR25662.1| ankyrin repeat-containi (2062) 4659 914.5 0 gi|160358772|sp|Q6UB98.3|ANR12_HUMAN RecName: Full (2062) 4659 914.5 0 gi|114672296|ref|XP_001139090.1| PREDICTED: ankyri (1689) 4655 913.7 0 gi|114672292|ref|XP_001139183.1| PREDICTED: ankyri (2039) 4655 913.7 0 gi|114672284|ref|XP_523867.2| PREDICTED: ankyrin r (2062) 4655 913.7 0 gi|194678116|ref|XP_870680.2| PREDICTED: similar t (2027) 4470 877.8 0 gi|126321835|ref|XP_001364845.1| PREDICTED: simila (2060) 3970 780.9 0 gi|114672298|ref|XP_001139014.1| PREDICTED: ankyri (1913) 3528 695.1 7.6e-197 gi|149639152|ref|XP_001512212.1| PREDICTED: simila (1955) 3500 689.7 3.3e-195 gi|224046083|ref|XP_002190591.1| PREDICTED: ankyri (2029) 3483 686.4 3.4e-194 gi|118086805|ref|XP_423591.2| PREDICTED: similar t (2038) 3255 642.2 6.9e-181 gi|26337699|dbj|BAC32535.1| unnamed protein produc ( 457) 2980 588.5 2.3e-165 gi|220672679|emb|CAX14674.1| novel protein similar (1987) 1723 345.1 1.8e-91 gi|26330502|dbj|BAC28981.1| unnamed protein produc ( 239) 1579 316.6 8.6e-84 gi|126304763|ref|XP_001366533.1| PREDICTED: simila (2701) 1533 308.3 2.9e-80 gi|119587135|gb|EAW66731.1| ankyrin repeat domain (1689) 1516 304.9 2e-79 gi|119587136|gb|EAW66732.1| ankyrin repeat domain (1788) 1516 304.9 2.1e-79 gi|194208906|ref|XP_001917428.1| PREDICTED: ankyri (2667) 1513 304.5 4.2e-79 gi|73956911|ref|XP_546778.2| PREDICTED: similar to (2634) 1511 304.1 5.5e-79 gi|37589479|gb|AAH59876.1| Ankrd11 protein [Mus mu ( 766) 1497 301.0 1.3e-78 gi|215273940|sp|Q6UB99.2|ANR11_HUMAN RecName: Full (2663) 1503 302.5 1.6e-78 gi|56676397|ref|NP_037407.4| ankyrin repeat domain (2663) 1503 302.5 1.6e-78 gi|38638917|gb|AAR25661.1| ankyrin repeat-containi (2664) 1503 302.5 1.6e-78 gi|149411864|ref|XP_001512749.1| PREDICTED: simila (2710) 1502 302.3 1.9e-78 gi|149411862|ref|XP_001512726.1| PREDICTED: simila (2710) 1502 302.3 1.9e-78 gi|148679757|gb|EDL11704.1| mCG131399 [Mus musculu (1535) 1498 301.4 2e-78 gi|76640061|ref|XP_612059.2| PREDICTED: similar to (2599) 1498 301.5 3.1e-78 gi|219521157|gb|AAI72141.1| Unknown (protein for M (2609) 1497 301.4 3.6e-78 gi|187957226|gb|AAI58044.1| Ankrd11 protein [Mus m (2643) 1497 301.4 3.6e-78 gi|124487033|ref|NP_001074848.1| ankyrin repeat do (2664) 1497 301.4 3.6e-78 gi|189521753|ref|XP_001333168.2| PREDICTED: simila (2751) 1477 297.5 5.5e-77 gi|47210637|emb|CAF94451.1| unnamed protein produc ( 469) 1288 260.3 1.4e-66 gi|118106431|ref|XP_423590.2| PREDICTED: similar t ( 174) 1121 227.7 3.6e-57 gi|118119455|ref|XP_001235872.1| PREDICTED: simila ( 575) 1064 216.9 2e-53 gi|198422758|ref|XP_002121278.1| PREDICTED: simila (1195) 911 187.5 3.1e-44 gi|47223040|emb|CAG07127.1| unnamed protein produc (1817) 874 180.4 6.3e-42 gi|51872307|gb|AAU12258.1| hypothetical protein [O ( 139) 841 173.3 6.7e-41 gi|115676752|ref|XP_001175736.1| PREDICTED: simila (1185) 786 163.2 6.1e-37 gi|115929863|ref|XP_001189814.1| PREDICTED: simila (1536) 786 163.3 7.5e-37 gi|212517735|gb|EEB19574.1| ankyrin repeat-contain ( 637) 774 160.7 1.9e-36 gi|110749026|ref|XP_397458.3| PREDICTED: similar t ( 969) 758 157.8 2.2e-35 gi|189242426|ref|XP_969950.2| PREDICTED: similar t ( 762) 741 154.4 1.8e-34 gi|156540459|ref|XP_001599747.1| PREDICTED: simila ( 298) 728 151.6 4.9e-34 >>gi|148706368|gb|EDL38315.1| ankyrin repeat domain 12, (2041 aa) initn: 5894 init1: 5894 opt: 5894 Z-score: 6169.7 bits: 1154.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 5894; 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