FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0964.ptfa, 986 aa vs ./tmplib.26680 library 1768031 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5775+/-0.00655; mu= -3.3428+/- 0.433 mean_var=265.8790+/-63.913, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0787 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4162 ( 990 res) mbg04507 ( 990) 1160 145 4e-35 mKIAA0008 ( 773 res) mph01047 ( 773) 315 49 2.4e-06 >>mKIAA4162 ( 990 res) mbg04507 (990 aa) initn: 2436 init1: 748 opt: 1160 Z-score: 722.9 bits: 145.2 E(): 4e-35 Smith-Waterman score: 2638; 45.796% identity (49.203% ungapped) in 1011 aa overlap (17-986:9-990) 10 20 30 40 50 mKIAA0 PQCPSRAKAPAPRARIMKGLGDSRPRHLSDSLDPPHEPLFAGPDRNPYLLSPTEAF-ARE ::::. :: .: . . . . : :..::::::.. : . mKIAA4 PWDCFQSAMKGLSGSRSHHHGITCEAACDSLSHHSDHKPYLLSPVDHHPADH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 mKIAA0 ARFPGQNTLPGDGLFPLNNQLPPPSSTFPRIHYNSHFEVPEESPFPSHAQATKINRLPAN . .:.. .. . :... : :::::: ::.:. :. .:: . .. ::: ::::.: mKIAA4 PYYTQRNSFQAECVGPFSD--PLASSTFPRRHYTSQQELKDESALVPRTLATKANRLPTN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 mKIAA0 LLDQFEKQLPIHRDGFSTLQFPRGEAKARGESPGRIRHLVHSVQRLFFTKAPSMEG-TAG ::::::.:::. :::. :::. : .. :..:::::::::::::.:: ::. :.:: . : mKIAA4 LLDQFERQLPLSRDGYHTLQYKRTAVEHRSDSPGRIRHLVHSVQKLF-TKSHSLEGPSKG 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 KV-GGNGSKKGGLEDGKGRRAKSKERAKAGEPKRRSR-SNIS----GWWSSDDNLDGEGG .: ::..: . :.:.::::: . : : :: :: : .::::::::::. mKIAA4 SVNGGKASPDESQTLRYGKRSKSKERRS--ESKARSNASNASPTSPSWWSSDDNLDGDMC 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 AFRSGPASGLMTLGRQQERTQPRYFMHAYNTISGHMLKTTKNTTTELTAPPPPPAPPATC ... : ::.::.:: .:. .:::.:::::: . .:...... .:: mKIAA4 LYHT-P-SGVMTMGRCPDRSASQYFMEAYNTISEQAVKASRSNND---------IKCSTC 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 PSLGVGTDTNYVKRGSWS-TLTLSHAHEVCQKTSATLDKSLLKSKSCHQGLAYHYLQVPG .: : :. .:...:: :::.:.:.:: ::.:...:....::..:.: . .::::: mKIAA4 ANLPVTLDAPLLKKSAWSSTLTVSRAREVYQKASVNMDQAMVKSEACQQERSCQYLQVPQ 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 GGGEWSTTLLSPRDMDSTAEGPIPCRRMRSGSYIKAMGDEDSDESGGGSPKPSPKTAARR ::: .:: :. :::::::::::::::::::: .: :::::::.:::: mKIAA4 D--EWSG--YTPRGKDDE----IPCRRMRSGSYIKAMGDEDSGDSDT-SPKPSPKVAARR 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 mKIAA0 QSYLRATQQSLGEQSNPRRSLDRLDSVDMLLPSKCPSW-EDDYNPISDSLNDSSCIS--Q .:: .::: :: : .. . : .. .... : . : . : :::. .. .. . mKIAA4 ESYPKATQPSLTELTTLKISNEHSPKLQIRSHSYLRAVSEVSINRSLDSLDPAGLLTSPK 390 400 410 420 430 440 470 480 490 500 510 520 mKIAA0 VFGQASLIPQLFGHDQQVREADLSDQYEAACESACSEAESTTAEALDLPLPSYFRSRSHS .. . .. .:: : ... :.:..:::. :: :: ..::::::::. :: :::: mKIAA4 FRSRNESYMRAMSTISQVSEMEVNGQFESVCESVFSELESQAVEALDLPLPGCFRMRSHS 450 460 470 480 490 500 530 540 550 560 570 580 mKIAA0 YLRAIQAGCSQEEDSVSLQSLSPPPSTGSLSNSRTLPSSSCLVAYKKTPPPVPPRTTSKP :.:::. ::::... :::.: ::: .: .. . .. :::...:::::::::::::.:: mKIAA4 YVRAIEKGCSQDDECVSLRSSSPPRTTTTVRTIQSSTVSSCITTYKKTPPPVPPRTTTKP 510 520 530 540 550 560 590 600 610 620 630 640 mKIAA0 FISVTVQSSTESAQDTYLDSQDHKSEVTSQSGLSNSSDSLDSSTRPPSVTRGGITP--GP :::.:.:::::::::.:.:.: ..... ::::::::..:::: .. ... . :: mKIAA4 FISITAQSSTESAQDAYMDGQGQRGDMISQSGLSNSTESLDSMKALTAAIEAANAQIHGP 570 580 590 600 610 620 650 660 670 680 690 700 mKIAA0 EAPEPPPKHAALKSEQGTLT-SSESHSEAIPKRKLSSIGIQLSPSSPNRSSAPSHSMSSR . . . ::. . : ..:.... . : . :::::.. . .. : :.. .. mKIAA4 ASQHMGSNAAAVTTTTTIATVTTEDRKKDFKKNRCLSIGIQVDDAEEPEKMAESKTSNKF 630 640 650 660 670 680 710 720 730 740 750 mKIAA0 RDTDSDTQDA--------NDSSCKSSERSLPDCTSHPNSI-SIDAGPRQAPKIAQIKRNL ... .... ..: . . .: . ::. ::. . .: :..:. mKIAA4 QSVGVQVEEEKCFRRFTRSNSVTTAVQADLDFHDNLENSLESIEDNSCPGPMARQFSRDA 690 700 710 720 730 740 760 770 780 790 mKIAA0 SYG-----------------DNSDPALEASSLPPPDPWLETSSSSPAEPAQPGACRRDGY : . :. : .. : :::::::... . .: : .: ..:.:::. mKIAA4 STSTVSIQGSGNHYHACAADDDFDTDFDPSILPPPDPWIDSITEDPLEAVQRSVCHRDGH 750 760 770 780 790 800 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 WFLKLLQAETERLEGWCCQMDKETKENNLSEEVLGKVLSAVGSAQLLMSQKFQQFRGLCE ::::::::: .:.:::: :..: .:::: :..:::. .:::::::::.::: ::: ::: mKIAA4 WFLKLLQAERDRMEGWCKLMEREERENNLPEDILGKIRTAVGSAQLLMAQKFYQFRELCE 810 820 830 840 850 860 860 870 880 890 900 910 mKIAA0 QNLNPDANPRPTAQDLAGFWDLLQLSIEDISMKFDELYHLKANSWQLVETPEKRKEEKKP .::::.:.::::.::::::::.::::::.::::::::..::::.:. .. .:. :.. mKIAA4 ENLNPNAHPRPTSQDLAGFWDMLQLSIENISMKFDELHQLKANNWKQMDPLDKK--ERRA 870 880 890 900 910 920 920 930 940 950 960 970 mKIAA0 PPPVPKKPAKSKAAVSRDKASDAGDKQRQEARKRLLAAKRAASVRQNSATESADSIEIYV ::::::::::. : . :... ... :::::::::.:::::::::::::::::.:::::. mKIAA4 PPPVPKKPAKGPAPLIRERSLESS--QRQEARKRLMAAKRAASVRQNSATESAESIEIYI 930 940 950 960 970 980 980 mKIAA0 PEAQTRL ::::::: mKIAA4 PEAQTRL 990 >>mKIAA0008 ( 773 res) mph01047 (773 aa) initn: 323 init1: 214 opt: 315 Z-score: 206.2 bits: 49.3 E(): 2.4e-06 Smith-Waterman score: 328; 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