FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1455.ptfa, 1828 aa vs ./tmplib.26680 library 1767189 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0651+/-0.00422; mu= 16.0024+/- 0.283 mean_var=84.7401+/-19.296, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 25 in 1/35 Lambda= 0.1393 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1302 ( 1198 res) mbg04788 (1198) 5677 1153 0 mKIAA1127 ( 253 res) mbg00243 ( 253) 1022 216 8.1e-57 >>mKIAA1302 ( 1198 res) mbg04788 (1198 aa) initn: 4654 init1: 3740 opt: 5677 Z-score: 6160.6 bits: 1152.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 5677; 67.723% identity (68.121% ungapped) in 1199 aa overlap (636-1828:1-1198) 610 620 630 640 650 660 mKIAA1 LAASPDGTLYIADLGNIRIRAVSKNKPLLNSMNFYEVASPTDQELYIFDINGTHQYTVSL ..:.::..:: :::::.:: .: : :: :: mKIAA1 TQNMYELSSPIDQELYLFDTSGKHLYTQSL 10 20 30 670 680 690 700 710 720 mKIAA1 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