FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
../query/mKIAA0578.ptfa, 1553 aa
vs ./tmplib.26680 library
1767464 residues in 2168 sequences
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Lambda= 0.1164
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: :::: : :::: :. :::.:. .: .: .:.::.:.: ..:.:
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.::.:: : ::::::.:. :::.: :.. ::::::: :::: : :: : . :. : :
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.: .: .::. .::.::::.: : : :::::.::..: .:: ::..:. . ::.: . .
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.... :: . : .: . . .:: :::.:.:. : ::
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::.::: :: ::.:.. .:: ::: . : :. .:::::..:
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::::.:.::::::.::::::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: :::
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:::::::::::.::::.::::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::
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..: ..:.::.::.:::.:::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:.
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..: . ..:.::.:.:::.:::::::::: ::..: ..::::::: ::::::::
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:.:.::::. ::. : ::::.:::..:::::::::. .. : .: ::::: : :::::
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:::.::: ::::::::::::::.:::.::..:::::::::::: ::::::..::::::.:
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1050 1060 1070 1080 1090 1100
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:::.::: ::.::::.:::::: :.::.::::::::::::.:::.:::..::.:::::
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:: .:: ::::::::.:.: :::..::::::::::::::::::::::::: ::::::: :
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :::..::.:::: .::::::
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1350 1360 1370 1380 1390 1400
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::::: .:::.: :. :..::::: :: . ..:.:::.. ..:.:.:::::::.::.:
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::
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1470 1480 1490 1500 1510 1520
1530 1540 1550
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::::: :.. :. .: ::::::::::
mKIAA0 VVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV
1530 1540 1550
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. ...:: .:::.::::.::::::::::::
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:::::::::: :::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::::
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:::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::.::::::::. :: ::::.: :.::::::::::::.:
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::::..:::::::.:. ::::::::::::::::::.::::...::.. . ::::::.:
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.:::.:::::::::::::.:: :::.:::::::::.::::::::::::. :::.:: :::
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:::::. ..::::::::.:::..:::.:::.::::::::::::::::.::.:::.::.:.
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.:::: :::. .:: : : :::::..:.:::::..:::.:::: ::.:::::..::::::
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:.::. .:.::::::::::.:: ::::::.:.::::::::::::::::.::::: :::::
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::::::::::::::.:: .::::::::::::::::::::::::. : : :.::::::::
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:::::::.::.::.: :::.:::::::: :::. :::::::::::::::.::::.:::::
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:::::::::::..:::::::::::::::::::: ::.::.:::::::::.:::::::.::
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::::::: :.:::.:..::::::::::.:.::.:: :..:.:::..::. ::.:::::.
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:::..:.:. :..::::: ...:::::::::::::::::::.::: .::::::::
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:::::::::::.:::::.:::.::.:::::::.:: :::::.::::.:.:: :
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: :: :::::::.::::.::::. :...:::.::. ::::.:.:::.:::::: ::.::
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::.:.: . .::::::::::::.:::::::::.::: :.::.:
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:::::::.:: : ::::..:. ::::::::::.:::::::::::.
mKIAA0 ---------------RQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENN
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:: : :.::::::::: : .: :.: ::::..::::::.::.:.:... . :.
mKIAA0 PNIKINGSVRLVGEVPSVSGTTQT-TSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNR--STASIQ
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:.:: ::.:::: :::::. ::::. . ::::. : :. ::..:::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::...::::
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:: ::..:..:::::::::
mKIAA0 SS-KSGHKKQKNKDKEYYV
1200 1210
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Smith-Waterman score: 883; 24.376% identity (27.602% ungapped) in 1001 aa overlap (329-1275:205-1142)
300 310 320 330 340 350
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