FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0578.ptfa, 1553 aa vs ./tmplib.26680 library 1767464 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1305+/-0.00459; mu= 11.9689+/- 0.305 mean_var=121.3554+/-27.769, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1164 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0921 ( 1555 res) mbg05450 (1555) 6788 1153 0 mKIAA0743 ( 1211 res) mbg16847 (1211) 5323 906 0 mKIAA1763 ( 1330 res) mfj36281 (1330) 382 77 4e-14 mKIAA0868 ( 1399 res) mbg15527 (1399) 374 75 1.1e-13 mKIAA0279 ( 1484 res) meh01738 (1484) 257 56 9.1e-08 mKIAA0813 ( 1557 res) mbg05377 (1557) 236 52 1.1e-06 mKIAA4041 ( 1671 res) mpf01333 (1671) 202 46 6e-05 mKIAA4087 ( 1285 res) meg00461 (1285) 192 45 0.00016 >>mKIAA0921 ( 1555 res) mbg05450 (1555 aa) initn: 5343 init1: 4263 opt: 6788 Z-score: 6160.1 bits: 1152.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 7087; 68.252% 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: : : ::.:.:.::.::::.:::: mKIAA0 VRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGICREGWNRFVCDCI 700 710 720 730 740 750 750 760 770 780 790 800 mKIAA0 GTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDS :::.::: ::::::::::::::.:::.::..:::::::::::: ::::::..::::::.: mKIAA0 GTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPTAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRES 760 770 780 790 800 810 810 820 830 840 850 860 mKIAA0 ADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKL :::::::::.:...:::::::.:..: ::::::::::..::::::::::::::::::.: mKIAA0 ADTLRLELDGGQMRLTVNLDCLRVGCAPSKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQL 820 830 840 850 860 870 870 880 890 900 910 920 mKIAA0 TVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLC .::. .. ::::: :::::::::::::.::::..: :::::::::..:.:::. :.: : mKIAA0 SVDNV-TVEGQMAGAHTRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQC 880 890 900 910 920 930 930 940 950 960 970 980 mKIAA0 KNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLIL :.::: :::::::::.: :.:::::::..:::.::::::::.:::::::::::. :::.: mKIAA0 KDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLL 940 950 960 970 980 990 990 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA0 YNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTV .:::.::::::.::::::.::::::::: .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::. mKIAA0 FNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTL 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1050 1060 1070 1080 1090 1100 mKIAA0 KIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLP :::.. .:: . ::::::::..:::::..:. ...::::: ...:::::::::::::::: mKIAA0 KIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLP 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1110 1120 1130 1140 1150 1160 mKIAA0 DLISDALFCNGQIERGCEGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPG :::.::: ::.::::.:::::: :.::.::::::::::::.:::.:::..::.::::: mKIAA0 DLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPG 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1170 1180 1190 1200 1210 1220 mKIAA0 TTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIH :::::.:::. ::: :::::::::: ::::.:::: :. ::::::::.:::::::.::: mKIAA0 TTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHID 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1230 1240 1250 1260 1270 1280 mKIAA0 QGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNND :: .:: ::::::::.:.: :::..::::::::::::::::::::::::: ::::::: : mKIAA0 QGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGNFD 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1290 1300 1310 1320 1330 1340 mKIAA0 NERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :::..::.:::: .:::::: mKIAA0 NERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQG-VSGLYYN 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1350 1360 1370 1380 1390 1400 mKIAA0 GLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATST ::::: .:::.: :. :..::::: :: . ..:.:::.. ..:.:.:::::::.::.: mKIAA0 GLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTT 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1410 1420 1430 1440 1450 1460 mKIAA0 ARRGKPPT-KEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSGGLANPTRVGGREPYPGSA .:::. :: .. .:.:::.:::::::::::::.. ::::. :::: : : : ::.. mKIAA0 TRRGRSPTMRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPST---ANPTGPGERGP-PGAV 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 mKIAA0 EVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::: mKIAA0 EVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGA 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 mKIAA0 VVKEKQPSSAKSANKNKKNKDKEYYV ::::: :.. :. .: :::::::::: mKIAA0 VVKEKAPAAPKTPSKAKKNKDKEYYV 1530 1540 1550 >>mKIAA0743 ( 1211 res) mbg16847 (1211 aa) initn: 3998 init1: 2537 opt: 5323 Z-score: 4831.6 bits: 906.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 6241; 74.700% identity (78.535% ungapped) in 1249 aa overlap (321-1553:8-1211) 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 CSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNPIQSS . ...:: .:::.::::.:::::::::::: mKIAA0 QIPNSSVQPRAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSS 10 20 30 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 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