FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1106.ptfa, 1211 aa vs ./tmplib.26680 library 1767806 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9537+/-0.00601; mu= 12.6209+/- 0.397 mean_var=311.4972+/-72.686, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0727 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0535 ( 1049 res) mbg03667 (1049) 2236 249 2.8e-66 mKIAA0835 ( 1129 res) mfj01048 (1129) 1904 214 8.6e-56 mKIAA0312 ( 2934 res) mbf01960 (2934) 238 40 0.0053 mFLJ00158 ( 236 res) msk05209 ( 236) 217 36 0.0068 mKIAA2001 ( 745 res) mfj36052 ( 745) 221 38 0.0091 >>mKIAA0535 ( 1049 res) mbg03667 (1049 aa) initn: 1338 init1: 724 opt: 2236 Z-score: 1282.4 bits: 249.1 E(): 2.8e-66 Smith-Waterman score: 2663; 42.904% identity (51.629% ungapped) in 1219 aa overlap (26-1211:4-1049) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 RELALGLHPAHGVTLPPSSGEKASYKMDVDSEEKRHRTRSKGVRVPVEPAIQELFSCPTP 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