FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1514.ptfa, 1994 aa vs ./tmplib.26680 library 1767023 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3068+/-0.00553; mu= 7.1339+/- 0.369 mean_var=159.9353+/-38.464, 0's: 0 Z-trim: 22 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1014 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00154 ( 1340 res) mfj45154 (1340) 5382 801 0 mKIAA3024 ( 898 res) mfj07190 ( 898) 976 156 4e-38 mKIAA0756 ( 1251 res) mbg20669 (1251) 905 146 6.8e-35 mKIAA0230 ( 1431 res) mbg10262 (1431) 485 84 2.4e-16 mKIAA0343 ( 1202 res) mbg04270 (1202) 415 74 2.5e-13 mKIAA1132 ( 1723 res) mbg00857 (1723) 416 74 3e-13 mKIAA0806 ( 702 res) mfj52037 ( 702) 308 58 8.8e-09 mFLJ00376 ( 931 res) mbg07794 ( 931) 282 55 1.5e-07 mKIAA1628 ( 1294 res) mbg00013 (1294) 254 51 3.3e-06 mKIAA4044 ( 1352 res) mpg00593 (1352) 254 51 3.4e-06 mKIAA4170 ( 1376 res) mbg21326 (1376) 247 50 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:::::::.:: mFLJ00 GLHYSDEDICNKYNGAVLTESVNLKEKSVDGSESEASDSDYE---EALPKHSFVNHYMSD 1230 1240 1250 1260 1270 1910 1920 1930 1940 1950 1960 mKIAA1 PTYYNSWRRQQKGISRAQAYSYTESDSGEPDHVTVPNSNSTQQGSLFRPKASRTPTPQNP :::::::.:. . . . . . ...: :... .... :... : . mFLJ00 PTYYNSWKRRPPAAAPHRYEAVAGAEAGPHLHTVITTQSA---GGVYTPAG--------- 1280 1290 1300 1310 1320 1970 1980 1990 mKIAA1 PNPQSQQSTLYRPPSSLAPGSRAPIAGFSSFV ::.:::..:::::: mFLJ00 ------------------PGARAPLTGFSSFV 1330 1340 >>mKIAA3024 ( 898 res) mfj07190 (898 aa) initn: 663 init1: 185 opt: 976 Z-score: 776.8 bits: 156.1 E(): 4e-38 Smith-Waterman score: 976; 27.704% identity (29.457% ungapped) in 823 aa overlap (1-802:62-856) 10 20 30 mKIAA1 GRYYVQAVNDKNGDNKTSQPITLAVENVGG : : ..: .. . . : : ..: : mKIAA3 NEYPSYQDNRRFVSQETGNLYIAKVEKSDVGNYTCVVTNTVTNHKVLGPPTPLILRN-DG 40 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 mKIAA1 PADPIAPTIIIP-PKNTSVVAGTSEVTMECVANARPLIKLHIVWKK-DGAPLSSGISDY- : : . :... . ::. : .:: : . :. :.:.. :: :.. . mKIAA3 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.:.: : : :. :. . .:.. ::: :.:::. ::... :.. mKIAA0 DQDLAKAYLTVLGRPDRPRD--LELTDLAERSVRLTWIPGDDNNSPITDYVVQFEEDQFQ 690 700 710 720 730 740 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 PWTILLASVDPEATSVMVKGLVPARSYQFRLCAVNDVGKGQFSKDTERVSLPEEPPTAPP : . : : ... : : : .::::. :::.::... : .:: :: . : mKIAA0 PGVWHDHSRFPGSVNSAVLHLSPYVNYQFRVIAVNEVGSSHPSLPSERYRTSGAPPESNP 750 760 770 780 790 800 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 QNVIASGRTNQSIMIQWQPPPESHQNGILKGYIIRYCLAGLPVGYQFKNITDADVNNLLL ..: . : .... : : : . : ::... . ..:.: . .. mKIAA0 SDVKGEGTRKNNMEITWTPMNATSAFGPNLRYIVKW--RRRETRETWNNVTVWG-SRYVV 810 820 830 840 850 860 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 EDLIIWTNYEIEVAAYNSAGLGVYSSKVTEWTLQGVPTVPPGNVHAEATNSTTIRFTWNA . ... :::.: : :. : : . . .. . : . : .:. .. :::.: . :: mKIAA0 GQTPVYVPYEIRVQAENDFGKGPEPDTIIGYSGEDYPRAAPTEVKIRVLNSTAISLQWNR 870 880 890 900 910 920 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 PSPQFINGINQGYKLIAWEPA---QEEEVTMVTARPNFQDSIHVGFVSGLKKFTEYFTSV . ..: . :. :. . .. :.. . .: . : :. : ...: . mKIAA0 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