FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0434.ptfa, 1170 aa vs ./tmplib.26680 library 1767847 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.7361+/-0.0117; mu= -26.7181+/- 0.775 mean_var=748.8523+/-183.885, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0469 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0559 ( 1592 res) mbg01260 (1592) 754 67 2.5e-11 >>mKIAA0559 ( 1592 res) mbg01260 (1592 aa) initn: 1079 init1: 341 opt: 754 Z-score: 295.6 bits: 67.1 E(): 2.5e-11 Smith-Waterman score: 1337; 31.974% identity (36.392% ungapped) in 1079 aa overlap (80-1076:311-1340) 50 60 70 80 90 100 mKIAA0 ALGRFEKKKPDPLEIGYQAHLPPESLSQLVSRQPPKSPQVLYSPVSPLSPH-RLLDTSFA .. : : .: . :. .: . . : : . mKIAA0 EDQDEWDMPSRSRRKARTGKYGDSTAEGDKTKPPSKVSSVAVQTVAEISVQTEPLGTIRT 290 300 310 320 330 340 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 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