FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1058.ptfa, 2072 aa vs ./tmplib.26680 library 1766945 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2611+/-0.00445; mu= 16.0140+/- 0.297 mean_var=95.8414+/-22.724, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1310 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0694 ( 1816 res) mbg08921 (1816) 3498 673 1.7e-193 mKIAA1771 ( 727 res) mbg08859a ( 727) 1237 246 3.9e-65 mFLJ00346 ( 1128 res) mph03762 (1128) 1137 227 2.6e-59 mKIAA1395 ( 1930 res) mpf00633 (1930) 1136 227 4.2e-59 mKIAA2028 ( 1392 res) mib04094 (1392) 148 40 0.0055 >>mKIAA0694 ( 1816 res) mbg08921 (1816 aa) initn: 6391 init1: 1580 opt: 3498 Z-score: 3566.4 bits: 673.3 E(): 1.7e-193 Smith-Waterman score: 6368; 54.039% identity (57.567% ungapped) in 1795 aa overlap (359-2071:5-1771) 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 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1190 1200 1210 1510 1520 1530 1540 1550 1560 mKIAA1 EVLKCCNSKLSSIRTEASQLLYFLMRNNFDYTGKKSFVRTHLQVIISVSQLIADVVGIGG ::::::: . . ::: ::::.::.::... .::.::.:::.: .:::::::. :::: mKIAA0 EVLKCCNHRSRLTQMEASALLYFFMRKNFEFNKQKSIVRSHLQLIKAVSQLIADA-GIGG 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1570 1580 1590 1600 1610 1620 mKIAA1 TRFQQSLSIINNCANSDRIIKHTSFSSDVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHENDREMLVDLQ .:::.::.: :: ::.:. .:...: ..::::::::::::::::::::::.: ::::::: mKIAA0 SRFQHSLAITNNFANGDKQMKNSNFPAEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLVDLQ 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1630 1640 1650 1660 1670 1680 mKIAA1 YSLAKSYASTPELRKTWLDSMARIHVKNGDLSEAAMCYVHVTALVAEYLTRKGMFRQGCT ::::.:::::::::.:::.:::.::..:::::::::::.:..::.:::: ::::: .: mKIAA0 YSLANSYASTPELRRTWLESMAKIHARNGDLSEAAMCYIHIAALIAEYLKRKGMFSMGWP 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1690 1700 1710 1720 1730 1740 mKIAA1 AFRVITPNIDEEASMMEDVGMQDVHFNEDVLMELLEQCADGLWKAERYELIADIYKLIIP :: ::::: ::..: :: ::::. .::..:.: : .:.. :::.::::::::. : :: mKIAA0 AFLSITPNIKEEGAMKEDSGMQDTPYNENILVEQLYMCVEFLWKSERYELIADVNKPIIA 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1750 1760 1770 1780 1790 1800 mKIAA1 IYEKRRDFERLAHLYDTLHRAYSKVTEVMHSGRRLLGTYFRVAFFGQAAQYQFTDSETDV ..::.:::..:. :: .::.: ::.::..: .::.: :.::::.:::. mKIAA0 VFEKQRDFKKLSDLYYDIHRSYLKVAEVVNSEKRLFGRYYRVAFYGQAV----------- 1460 1470 1480 1490 1500 1810 1820 1830 1840 1850 1860 mKIAA1 EGFFEDEDGKEYIYKEPKLTPLSEISQRLLKLYSDKFGSENVKMIQDSGKVNPKDLDSKF ::::.:.:::::::::::: ::::::::::::.::::..:::.::::.:::::::: :. mKIAA0 -GFFEEEEGKEYIYKEPKLTGLSEISQRLLKLYADKFGADNVKIIQDSNKVNPKDLDPKY 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1870 1880 1890 1900 1910 1920 mKIAA1 AYIQVTHVTPFFDEKELQERRTEFERCHNIRRFMFEMPFTQTGKRQGGVEEQCKRRTILT ::::::.:::::.:::...:.:.:: ::: ::.:: ::: .::..::: :::::::.:: mKIAA0 AYIQVTYVTPFFEEKEIEDRKTDFEMHHNINRFVFETPFTLSGKKHGGVAEQCKRRTVLT 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1930 1940 1950 1960 1970 1980 mKIAA1 AIHCFPYVKKRIPVMYQHHTDLNPIEVAIDEMSKKVAELRQLCSSAEVDMIKLQLKLQGS . : :::::::: :. : :.::::::::::::.::.:: :::.. :::::.:::::::: mKIAA0 TSHLFPYVKKRIQVISQSSTELNPIEVAIDEMSRKVSELNQLCTTEEVDMIRLQLKLQGS 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1990 2000 2010 2020 2030 2040 mKIAA1 VSVQVNAGPLAYARAFLDDTNTKRYPDNKVKLLKEVFRQFVEACGQALAVNERLIKEDQL :::.:::::.:::::::..::.:.::::.::::::.::::..:::::: ::::::::::: mKIAA0 VSVKVNAGPMAYARAFLEETNAKKYPDNQVKLLKEIFRQFADACGQALDVNERLIKEDQL 1690 1700 1710 1720 1730 1740 2050 2060 2070 mKIAA1 EYQEEMKANYREMAKELSDIMREQMG :::::....:..: .::: :: ::. mKIAA0 EYQEELRSHYKDMLSELSAIMNEQLCRGPCLYSFCASVSSISLSTVSKSDYGQGRPSKVR 1750 1760 1770 1780 1790 1800 >>mKIAA1771 ( 727 res) mbg08859a (727 aa) initn: 1219 init1: 649 opt: 1237 Z-score: 1261.8 bits: 245.6 E(): 3.9e-65 Smith-Waterman score: 1486; 37.758% identity (40.063% ungapped) in 678 aa overlap (1408-2071:48-700) 1380 1390 1400 1410 1420 1430 mKIAA1 YIARTGMMHARLQQLGSLDNSVTFNHSYGHSEADVVHQSLLEANIATEVCLTALDTLSLF :.:.. :..:...:.:::. : :::: .. mKIAA1 PSGSAFGSQENLRWRKDMTHWRQNSEKLDKSRAEIEHEALIDGNLATEANLIILDTLEII 20 30 40 50 60 70 1440 1450 1460 1470 1480 1490 mKIAA1 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