FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4128.ptfa, 1002 aa vs ./tmplib.26680 library 1768015 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8117+/-0.00472; mu= 13.3963+/- 0.315 mean_var=117.2091+/-26.739, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1185 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0704 ( 824 res) mbg11653 ( 824) 871 160 9.3e-40 mKIAA4220 ( 516 res) mia04077 ( 516) 752 140 9e-34 mKIAA1534 ( 493 res) mph00515 ( 493) 322 66 1.2e-11 mKIAA0772 ( 324 res) mib22030 ( 324) 267 57 5.8e-09 mKIAA1451 ( 429 res) mth01486 ( 429) 263 56 1.1e-08 >>mKIAA0704 ( 824 res) mbg11653 (824 aa) initn: 2224 init1: 861 opt: 871 Z-score: 806.1 bits: 160.4 E(): 9.3e-40 Smith-Waterman score: 2928; 52.791% identity (57.982% ungapped) in 860 aa overlap (77-926:32-824) 50 60 70 80 90 100 mKIAA4 HKTSTPTHRSASSSTSSQRESRQSIHVLERTASSSTEPSVSRQLLEPEPIPLS------K : :. . .::..:. : : . mKIAA0 LAPACEDFILSAPPSSNGILTALSPKDQLFTMSDEKNLGVSQKLVSPSRSTSSCSSKQGS 10 20 30 40 50 60 110 120 130 140 150 160 mKIAA4 EADSWEIIEGLKIGQTNVQKPDRHEGFMLKKRKWPLKGWHKRFFVLDNGMLKYSKAPLDI . ::::..:::. .: .:.: ..::.:::::::::::::::: :..:.:::.:. :: mKIAA0 RQDSWEVVEGLRGEMTYTQEPPVQKGFLLKKRKWPLKGWHKRFFCLEKGILKYAKSQADI 70 80 90 100 110 120 170 180 190 200 210 220 mKIAA4 QKGKVHGSIDVGLSVMSIKKKARRIDLDTEEHIYHLKVKSQDWFDAWVSKLRHHRLYRQN .. :.:: :::::::::.::... ::::::::::::::::.. :: :::::::::.:::: mKIAA0 EREKLHGCIDVGLSVMSVKKSSKCIDLDTEEHIYHLKVKSEELFDEWVSKLRHHRMYRQN 130 140 150 160 170 180 230 240 250 260 270 280 mKIAA4 EIVRSPRDASFHIFPATSTAESSPAANVSVVDGKMQPNSFPWQSPLPCSNSLPATCTTGQ ::. :::.. :.: ..:...:.:.. :: . : .:. :. .: ...: .: :. mKIAA0 EIAMFPRDVN-HFFSGSSVTDSAPGVFESVSSRKR--SSLSKQNSFPPGSNLSFSCG-GD 190 200 210 220 230 290 300 310 320 330 340 mKIAA4 SKVAAWLQDSEEMDRCAEDLAHCQSNLVELSKLLQNLEILQRTQSAPNFTDMQANCVDIS ..: :::.::.:..:..:::::.. :.:.:.::.....:.:: ::: .. .:.. . mKIAA0 TRVPFWLQSSEDMEKCSKDLAHCHAYLLEMSQLLESMDVLHRTYSAPAINAIQGGAFESP 240 250 260 270 280 290 350 360 370 380 390 400 mKIAA4 KKDKRVTRRWRTKSVSKDTKIQLQEGPPAKGQFNTTRRRQRLAAAVATTVPFSATMSPVR ::.:: ::::.....:: ::: ... . :::. ::: mKIAA0 KKEKRPHRRWRSRAIGKD----------AKGTLQVPK-------------PFSG---PVR 300 310 320 330 410 420 430 440 450 460 mKIAA4 LHSSNPNLCADIEFQTPPSHLTDPLESSTDYTKLQEEFCLIAQKVHSLLKSAFNSIAIEK :::::::: . ..: :. .: :.:....:.::..: .:.::. :.::::::..:. mKIAA0 LHSSNPNL-STLDFGEEKSY-SDGSEASSEFSKMQEDLCHVAHKVYFALRSAFNSISVER 340 350 360 370 380 470 480 490 500 510 520 mKIAA4 EKLKQVVSEQDHNKGHSTQMARLRQSLSQSEGAGKSWALNQNAELRSRLNRIHSESTICD :::::.. : : . . :.:.. :...::. :: ::..:. :: :::.:: . : mKIAA0 EKLKQLM-ELDTSPSPSAQVVGLKHALSS--------ALAQNTDLKERLRRIHAESLLLD 390 400 410 420 430 440 530 540 550 560 570 mKIAA4 HVVSVNIIPSP-DEPGEQIHVS--LPLSQQVANESRLSMSESVSEFFDAQEVLLSASSSE . .:.: :. .:. . : .:..::::::...:.:::::::::::: :::: mKIAA0 PPA----VPKPGDNLAEENSRDEGRALVHQLSNESRLSITDSLSEFFDAQEVLLSPSSSE 450 460 470 480 490 580 590 600 610 620 630 mKIAA4 NEASDDESYISDVSDNISEDNTSVADNISRQILNGEL-TGGAFRNGRRTCLPAPCPDTSN :: :::.::.::.:::.: :: : . :: :. : ..: :. ::: :::: :.::. mKIAA0 NEISDDDSYVSDISDNLSLDNLSNDLDNERQTLGPVLESSGEARSKRRTSLPAPGPNTSS 500 510 520 530 540 550 640 650 660 670 680 690 mKIAA4 INLWNILRNNIGKDLSKVSMPVELNEPLNTLQHLCEEMEYSELLDKASETDDPYERMVLV ..::.:::::::::::::.:::::::::::::.::::.::::::::::. .: :::: : mKIAA0 VSLWSILRNNIGKDLSKVAMPVELNEPLNTLQRLCEELEYSELLDKASRIPSPLERMVYV 560 570 580 590 600 610 700 710 720 730 740 750 mKIAA4 AAFAVSGYCSTYFRAGSKPFNPVLGETYECIREDKGFRFFSEQVSHHPPISACHCESKNF ::::.:.: :.:::::::::::::::::::::.::::.::.:: mKIAA0 AAFAISAYASSYFRAGSKPFNPVLGETYECIRQDKGFQFFAEQ----------------- 620 630 640 650 760 770 780 790 800 810 mKIAA4 VFWQDIRWKNKFWGKSMEILPVGTLNVTLPKYGDYYVWNKVTTCIHNILSGRRWIEHYGE .:::::::::::::.:.:: .:::: .::.. :::::.::::::::.:::::::: mKIAA0 -----MRWKNKFWGKSMEIVPIGTTHVTLPAFGDHFEWNKVTSCIHNILSGQRWIEHYGE 660 670 680 690 700 710 820 830 840 850 860 870 mKIAA4 VTLRNTKSSVCICKLTFVKVNYWNSNVNEVQGVVIDQEGKVVHRLFGKWHEGLYCGVAPS . ..: ... : ::..:.:..::..:..:..:.:.:. ::.::::::::::..::: : : mKIAA0 IDIKNLNDDSCHCKVNFIKAKYWSTNAHEIEGTVFDRSGKAVHRLFGKWHESIYCGGASS 720 730 740 750 760 770 880 890 900 910 920 930 mKIAA4 AKCIWRPGSLPTNYELYYGFTRFAVELNELDPVLKDLLPPTDARFRPDQRFLEEGNLEAA . :.:: . .: .:: :::::.::.::::.::. ..::::::.::::::: mKIAA0 STCVWRANPMPKGYEQYYGFTQFALELNEMDPLSRSLLPPTDTRFRPDQR 780 790 800 810 820 940 950 960 970 980 990 mKIAA4 AAEKQRVEELQRSRRRYMEENNLEHIPKFFKKVIDANQREAWVSNDTYWELRKDPGFSKV >>mKIAA4220 ( 516 res) mia04077 (516 aa) initn: 768 init1: 363 opt: 752 Z-score: 698.7 bits: 139.8 E(): 9e-34 Smith-Waterman score: 944; 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