FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1151.ptfa, 1906 aa vs ./tmplib.26680 library 1767111 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7190+/-0.00809; mu= -14.0892+/- 0.535 mean_var=368.9445+/-90.253, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0668 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0938 ( 1381 res) mbg05063 (1381) 1864 195 1.2e-49 mKIAA3015 ( 858 res) mbg13024 ( 858) 448 58 9.6e-09 mKIAA1758 ( 1565 res) mic23055 (1565) 274 42 0.0017 >>mKIAA0938 ( 1381 res) mbg05063 (1381 aa) initn: 2662 init1: 1125 opt: 1864 Z-score: 983.7 bits: 194.9 E(): 1.2e-49 Smith-Waterman score: 3377; 43.521% identity (49.204% ungapped) in 1420 aa overlap (612-1906:1-1381) 590 600 610 620 630 640 mKIAA1 SGSLKMEPGTSKWRRERPESCDDASKGGELKKPISLGHPGSLKKGKTPPVAVTSPITH-T : .:... :: ..: . .. . . : mKIAA0 KASLSVSQTGSWRRGMSAQGGTPATARQKT 10 20 30 650 660 670 680 690 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::. .: :. mKIAA0 LIEMEIERNIRNNDLVKIIDWIPKTWHHLNSFLETHSSSDVTIGPRLFLPCPMDVEGSRV 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1790 1800 1810 1820 1830 1840 mKIAA1 WFIDLWNNSIIPYLQEGAKDGIKVHGQKAAWEDPVEWVRDTLPWPSAQ--QDQSKLYHLP ::.:::: :..::. :....:....:..: :::: .:: :: :: ::. :. : .: mKIAA0 WFMDLWNYSLVPYVLEAVREGLQMYGKRAPWEDPSKWVLDTYPWSSASLPQEGPALLQLR 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1850 1860 1870 1880 1890 mKIAA1 PPSVGPHSTASPPEDRTVKDSTPNSLDSDPLMAMLLKLQEAANY--IESPD------RET : .:: .. .: : : : .. ..:::: ::.:::::::: .: : :: mKIAA0 PEDVGYEACTSTKEATTSKHIPQTDTEGDPLMNMLMKLQEAANYPSTQSCDGDSVSHRED 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1900 mKIAA1 ILDPNLQATL ::: ....:: mKIAA0 ILDTSIESTL 1380 >>mKIAA3015 ( 858 res) mbg13024 (858 aa) initn: 487 init1: 198 opt: 448 Z-score: 249.4 bits: 58.4 E(): 9.6e-09 Smith-Waterman score: 491; 27.936% identity (32.914% ungapped) in 562 aa overlap (1-504:284-818) 10 20 30 mKIAA1 SGTSSPVCSPVQSMRSSATPGVISFSSAHP : ::.: : :.. .:: ...: . : : mKIAA3 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